Гемолизирующая кишечная палочка у грудничка: Вопрос задает – Ирина, — вопрос-ответ от специалистов клиники «Мать и дитя»

Per и Ler тесно связаны (Рисунок 1). Исследование микроматрицы показало, что Ler репрессирует на экспрессии примерно в три раза, указывая на петлю отрицательной обратной связи (Bingle et al., 2014). Взаимосвязанная регуляция этих важных игроков имеет значение для интерпретации наблюдаемых ими регулонов.Например, увеличение количества транскриптов bfp в мутанте ler , вероятно, связано со снижением репрессии perA , известного позитивного регулятора bfp (Bustamante et al., 2011; Bingle et al., 2014; Mellies et al., 2017). Напротив, было обнаружено, что экспрессия оперона fim увеличивалась в обоих мутантах с делецией perC — и ler- . Снижение регуляции fim этими регуляторами, возможно, можно объяснить снижением транскрипции рекомбиназы fimE , что в обоих случаях инвертирует элемент fimS в положение OFF из-за Ler (Bingle et al., 2014; Mellies et al., 2017). Петля отрицательной обратной связи между на и Ler диктует контролируемое регулирование LEE, которое также координируется сигналами окружающей среды.

Сигналы окружающей среды

Нутриционный стресс оказывает сильное влияние на экспрессию генов вирулентности. Первоначально было замечено, что среда DMEM с низким содержанием глюкозы, которая содержит 5,5 мМ D -глюкозы, или 0,1% (в то время как DMEM с высоким содержанием глюкозы содержит 25 мМ D -глюкозы, или 0,45%), обеспечивает повышенную экспрессию генов вирулентности. по сравнению с LB при выращивании при 37 ° C до OD ₆₀₀ 0.От 2 до 0,5 (Puente et al., 1996; Rosenshine et al., 1996; Leverton, Kaper, 2005; Bustamante et al., 2011; Hazen et al., 2015a). на , bfpA и grlA все увеличиваются более чем в 4 log ₂ раз по сравнению с LB при OD ₆₀₀ 0,5 в штамме E2348 / 69, и аналогично ler экспрессируется более чем 2 log ₂ раз в этом штамме (Hazen et al., 2015a). Этот образец регуляции не поддерживается во всех штаммах tEPEC, протестированных Hazen et al.(2015a) — фактически, perC снижает экспрессию в штамме tEPEC C581-05 в этих условиях, а экспрессия ler и grlA не изменилась (Hazen et al., 2015a). Условия роста дополнительно диктуют экспрессию LEE — в мутанте Δ perC транскрипция ler в 5,5 раз меньше, чем WT, в DMEM с 0,45% глюкозы и при статическом росте с 5% CO ₂ , но не изменяется в условиях встряхивания без добавления CO ₂ (Bustamante et al., 2011). Эта регуляция имеет последующие эффекты, поскольку эффекторная секреция EspA, EspB, EspC и EspD снижается в статических условиях, но не в условиях встряхивания (Bustamante et al., 2011). Кроме того, бутират, который присутствует в большом количестве в толстой кишке, где колонизируется EHEC, увеличивает экспрессию pchA в EHEC (Nakanishi et al., 2009). Условия роста также влияют на GrlA-опосредованный контроль LEE. В мутанте grlA транскрипция ler снижалась в пять раз при встряхивании в DMEM с 0.45% глюкозы и без CO ₂ , но транскрипция не снижалась в статических условиях роста с CO ₂ (Barba et al., 2005; Bustamante et al., 2011). Важно отметить, что сигналы окружающей среды оказывают значительное влияние на регуляторы и в конечном итоге влияют на время экспрессии гена вирулентности.

Оперон на влияет на время экспрессии вирулентности. на транскрибируется в ответ на стимулы окружающей среды и, в свою очередь, модулирует экспрессию LEE PAI и других генов, которые, как предполагается, будут полезны tEPEC в его нише подвздошной кишки (Nakanishi et al., 2006; Spira et al., 2014; Leh et al., 2017; Mellies et al., 2017; Ронин и др., 2017). Экспрессия гена на происходит максимально в начале экспоненциального роста и участвует во временном контроле колонизации (Bustamante et al., 2011; Bueris et al., 2015). Удивительно, но aEPEC может быть индуцирован к колонизации раньше, когда на вводится в транс (Bueris et al., 2015). Эти данные указывают на большую роль во времени экспрессии гена вирулентности в ответ на благоприятную среду для колонизации.

Эти первоначальные наблюдения за влиянием типа среды на транскрипцию генов вирулентности привели к открытию, что именно переход от плотных питательных веществ LB к DMEM с низким содержанием глюкозы индуцирует экспрессию гена вирулентности в EHEC (Nakanishi et al., 2006). Этот переход вызывает строгий ответ, при котором relA и spoT , кодирующие синтетазы гуанозин (пента-) тетрафосфата (здесь все вместе обозначаются как ppGpp), и DksA необходимы для зависимого от фазы роста увеличения уровня LEE1. в EHEC (Nakanishi et al., 2006). Сверхэкспрессия RelA увеличивает секрецию EspB и Tir в присутствии функциональных генов pchA и ler в EHEC (Nakanishi et al., 2006). Интересно, что в EPEC RelA индуцирует на экспрессии, он необходим для экспрессии bfp на уровнях WT и играет роль в прикреплении к клеткам HEp-2 (Spira et al., 2014). Кроме того, избыточное производство ppGpp подавляет экспрессию Fis и в меньшей степени H-NS (Brandi et al., 2016). Fis также увеличивает транскрипцию многих генов, участвующих в первичном метаболизме, таких как тРНК и рРНК, вероятно потому, что это гены, которые экспрессируются в ранней фазе экспоненциального роста, когда экспрессируется Fis (Ross et al., 1990; Гонсалес-Гил и др., 1996; Goldberg et al., 2001). Недостаток питательных веществ определяется и передается через строгий ответ на контроль на и экспрессию гена вирулентности. Помимо условий роста, другие детерминанты вирулентности были связаны с восприятием сигналов окружающей среды, включая опосредованную кальцием сборку системы секреции, глобальную регуляцию и метаболизм мРНК, а также опосредование факторов вирулентности, вызванное стрессом оболочки.

Секция третьего типа

Секреция, опосредованная кальцием

Было обнаружено, что условия дефицита кальция снижают секрецию более ранних транслокаторов и вызывают «гиперсекрецию» секретируемых позже эффекторов через T3SS, вероятно, за счет передачи сигналов через привратный белок SepL и / или через белок «линейка» EscP. (Кенни и др., 1997a; Ide et al., 2003; Deng et al., 2004; Гайтан и др., 2017; Шаулов и др., 2017). Связанный с мембраной рецептор транслокатора SepL участвует в модуляции переключения от ранних субстратов к транслокаторам и от транслокаторов к эффекторам, взаимодействуя с различными белками с помощью различных механизмов (Portaliou et al., 2017; Shaulov et al., 2017). Предполагается, что секреция эффекторов блокируется взаимодействием SepL и EscP, а в условиях дефицита кальция, SepL и EscP диссоциируют и секретируются эффекторы (Shaulov et al., 2017). Шаулов и др. (2017) предполагают, что богатая кальцием внеклеточная среда просачивается в основание базального тела во время образования T3SS, а после завершения T3SS и закрытого соединения бактериальных клеток и клеток-хозяев концентрация кальция падает до внутриклеточного уровня, вызывая диссоциацию SepL и EscP (Monjarás Feria et al., 2012; Shaulov et al., 2017). Многие исследования наблюдали зависимые от кальция изменения секреции, и это один из возможных механизмов этих наблюдений.

Другой механизм обеспечивает независимое от кальция объяснение контроля секреции с помощью SepL.Поэтапная теория, в которой секретируются ранние субстраты, затем транслокаторы и, наконец, эффекторы, требует, чтобы SepL, SepD и EscV взаимодействовали в едином механизме, чтобы контролировать секрецию как транслокатора, так и эффектора (Portaliou et al., 2017). SepL взаимодействует с SepD кальций-независимым образом, при этом SepD опосредует перекрестные помехи между SepL и основным компонентом T3SS EscV, активируя SepL и обеспечивая целевую секрецию транслокатора, блокируя секрецию эффектора (Gaytán et al., 2017; Portaliou et al., 2017). SepD высвобождает, разъединяя перекрестные помехи EscV и SepL и разрешая секрецию как транслокатора, так и эффектора (Portaliou et al., 2017). Затем рецептор транслокатора SepL высвобождает, освобождая место для эффекторов, чтобы связывать EscV и секретироваться (Portaliou et al., 2017). В этих двух исследованиях предполагается, что SepL участвует в контроле времени секреции в параллельных, зависимых от кальция и независимых механизмах.

Нарушение гомеостаза хозяина

Энтеропатогенная инфекция Escherichia coli за счет T3SS-опосредованных механизмов нарушает ряд метаболических и физиологических процессов хозяина.Живой EPEC с функциональным T3SS, но не непатогенным E. coli , мертвым EPEC или супернатантом EPEC, снижает поглощение витамина B1 (тиамина) клетками Caco-2, влияя на рецепторы захвата тиамина hTHTR-1 и hTHTR-2 (Ashokkumar et al., 2009). Эффекторы espF и espH по крайней мере частично подавляют поглощение тиамина (Ashokkumar et al., 2009). EPEC T3SS-зависимым образом индуцирует активность Na ⁺ / H ⁺ транспортеров NHE1 и NHE2, тем самым увеличивая захват катионов Na ⁺ , нарушая гомеостаз электролитов (Hecht et al., 2004). Фактически, инфекция EPEC вызывает увеличение тока короткого замыкания эпителия, которое частично зависит от индукции секреции хлоридов (Collington et al., 1998). Инфекция EPEC вызывает увеличение протеинтирозинфосфатазы (PTPase), в частности, путем активации домена Src-homology-2, содержащего PTPase, что снижает фосфорилирование тирозина переносчика серотонина, снижая функцию переносчика и, таким образом, дерегулируя захват серотонина (Singhal et al., 2017). EPEC T3SS необходим во многих случаях нарушения гомеостаза хозяина.

Передача сигналов мРНК и бактериальный метаболизм

Малые РНК и их шапероны

Малые РНК (мРНК) являются регуляторами многих метаболических процессов, подвижности, вирулентности и других функций клетки. Большинство открытий регуляции патогенной мРНК E. coli было сделано в EHEC. Bhatt et al. (2016) всесторонне рассмотрели контроль sRNA в EPEC и EHEC, поэтому здесь упоминаются открытия в этой области, чтобы обрисовать недавнее открытие и подчеркнуть их важность в связывании метаболизма и вирулентности в EPEC.мРНК быстро реагируют на различные изменения окружающей среды и являются энергетически выгодными в качестве регуляторов, поскольку им не нужно транслировать в функциональный белок для осуществления регуляторного контроля (Bhatt et al., 2016). мРНК неспецифически регулируют широкий спектр генов с широким спектром функций, таких как гены метаболизма и вирулентности.

мРНК представляют собой молекулы от 50 до 500 нуклеотидов, которые наиболее часто действуют путем посттранскрипционной модуляции экспрессии информационных РНК (мРНК) путем спаривания оснований комплементарных последовательностей, блокирования элонгации транскрипции, трансляции и / или стабильности мРНК (Bhatt et al., 2016). Большинство мРНК в E. coli кодируются транс- или кодируются дистанционно по отношению к его объекту-мишени, таким образом, образуются короткие и часто прерывистые комплементарные сегменты длиной 6-25 п.н. (Bhatt et al., 2016). Trans--кодируемые мРНК требуют шаперона, которым чаще всего является Hfq в E. coli (Bhatt et al., 2016). Обширная роль Hfq и Hfq-зависимых мРНК в EHEC указывает на то, что, вероятно, существует большая роль Hfq-зависимой регуляции мРНК в EPEC, которая не была изучена.

Enteropathogenic Escherichia coli Hfq-зависимые мРНК MgrR, RyhB и McaS влияют на трансляцию grlRA (Bhatt et al., 2017) (Рисунок 1). MgrR репрессирует grlR непосредственно путем связывания с предшествующей лидерной областью мРНК, активируя при этом grlA (Bhatt et al., 2017). RyhB непосредственно репрессирует трансляцию grlRA путем спаривания оснований с более короткой последовательностью РНК для репрессии трансляции, а McaS, вероятно, действует косвенно, репрессируя grlRA (Bhatt et al., 2017). Эти три мРНК реагируют на разные условия окружающей среды. Экспрессия MgrR, которая увеличивает экспрессию LEE через более стабильные транскрипты grlA , увеличивается в случае низких концентраций катионов магния, вероятно, через фосфореле PhoQ-PhoP (Bhatt et al., 2017). Высокое содержание катионов железа, связанных с регуляторным белком железа Fur, подавляет RyhB, и в этом случае RyhB не может снизить концентрацию LEE до grlRA , таким образом, LEE активируется (Bhatt et al., 2017) (рисунок 1). Открытие этих трех Hfq-зависимых мРНК, которые специфически регулируют экспрессию EPEC LEE, является вершиной айсберга многих взаимодействий мРНК, связывающих восприятие окружающей среды и вирулентность, которые еще предстоит охарактеризовать.

Другой РНК-связывающий белок, CsrA (и его гомолог RsmA), ко-регулирует чувствительность метаболитов, подвижность, строгий ответ и вирулентность посредством ослабленной специфичности последовательности, которая обеспечивает спаривание оснований и регуляцию большого количества оперонов, которые контролируют многие аспекты функция клетки.CsrA является частью эгуляционной системы c arbon s torage r , которая кодирует РНК CsrB и CsrC, а также белок CsrD, который нацелен на эти РНК для деградации РНКазы E (Bhatt et al., 2009). CsrA тесно связан со строгим ответом, включая DksA и ppGpp. CsrA действует по ряду различных механизмов — некоторые опероны затрагиваются, когда CsrA находится в высокой концентрации и создает большие гомо-мультимеры, а другие опероны затрагиваются при более низких концентрациях (Bhatt et al., 2009). CsrA положительно регулируется путем связывания на расстоянии от последовательности Shine-Dalgarno и создания стабильности мРНК, и отрицательно регулируется путем связывания вблизи этой последовательности, что предотвращает связывание 30S субъединицы рибосомы и ингибирование трансляции (Bhatt et al., 2009). Флагеллярный оперон flhDC , вероятно, регулируется с помощью CsrA в EPEC, потому что существует консервативная последовательность связывания CsrA, идентифицированная в E. coli K-12 (Bhatt et al., 2009). Предполагается, что CsrA может участвовать в дифференциальной регуляции этого оперона в ответ на концентрации глюкозы, потому что штамм K-12 неподвижен при концентрациях глюкозы 10 мМ, тогда как EPEC подвижен (Bhatt et al., 2009).

CsrA регулирует вирулентность с помощью ряда факторов, одним из которых является увеличение транскрипта sepL , продукт которого способствует секреции транслокаторов вместе с SepD (Bhatt et al., 2009). CsrA репрессирует grlA при высоких концентрациях регулятора, который оказывает нижестоящий негативный регуляторный эффект на экспрессию LEE, возможно, в благоприятном эффекте сохранения ресурсов, когда глюкозы в изобилии (Bhatt et al., 2009). Важно отметить, что штамм EPEC с удаленным csrA не способен ни создавать пьедесталы, ни деполяризовать мембрану энтероцитов in vitro , отчасти потому, что мутант больше не стимулирует метаболизм триптофана через tnaA (Bhatt et al., 2009). CsrA косвенно способствует транскрипции tnaA (Рисунок 2), который кодирует фермент триптофаназу трицистронного оперона tnaCAB , который аналогичным образом связан как с метаболизмом, так и с вирулентностью (Bhatt et al., 2009). Кроме того, белок CesT связывается с CsrA, противодействуя глобальному регулятору (Katsowich et al., 2017; Ye et al., 2018). Широкий геномный контроль с помощью мРНК и их белков-шаперонов становится решительно важным для привязки экологической стимуляции к метаболизму и контролю вирулентности в зависимости от штамма.

РИСУНОК 2. Стрессовые реакции оболочки нарушают и способствуют вирулентности и колонизации EPEC. Ответы σ ^E и Cpx срабатывают, когда EPEC встречает сигналы окружающей среды. σ ^E способствует транскрипции degP , которая разрушает Е-кадгерин хозяина, нарушая слипчивые соединения, и репрессирует транскрипцию LEE1 . σ ^E разрушает вирулентность, уменьшая транскрипцию csrA . Фосфорилированный CpxR способствует транскрипции degP, ppiA и dsbA и репрессирует транскрипцию perC .Индол в концентрации 1,5 мМ репрессирует транскрипцию LEE5 , а в концентрации 50 мкМ способствует транскрипции LEE5 . Тонкие прямые стрелки указывают на продвижение транскрипции; тупые стрелки указывают на репрессию транскрипции; изогнутая стрелка указывает на ферментативную реакцию; жирные стрелки указывают на генетические элементы; белки расположены овалами; сигналы окружающей среды помещены в коробки.

Метаболизм и вирулентность триптофана

Присутствие триптофана положительно влияет на экспрессию вирулентности в EPEC (рис. 2).В целом, экспрессия триптофана и tnaCAB вызывает увеличение экспрессии LEE1, LEE4 и секретируемых факторов, которые влияют на выживаемость Caenorhabditis elegans (Bhatt et al., 2011). Оперон tnaCAB , который кодирует действующий регулятор цис- (TnaC), каталитический фермент триптофаназа, который расщепляет триптофан на индол, пируват и аммиак (TnaA), и первичная пермеаза, важная для поглощения триптофана бактериями (TnaB ), необходим для EPEC-опосредованного уничтожения C.elegans (Bhatt et al., 2011). В низких концентрациях индол способствует транскрипции tir . Однако в высоких концентрациях индол действует как конкурентный ингибитор триптофаназы, связываясь с каталитическим сайтом, который замедляет транскрипцию LEE (Bhatt et al., 2011) (рис. 2). Эта прямая связь между функцией метаболических генов и экспрессией вирулентности указывает на то, что эти клеточные процессы тонко взаимосвязаны. Использование этих соединений уже началось в роли индола и производных индола в подавлении патогенеза (Bommarius et al., 2013).

Индол и два производных индола, индол-3-карбоксиальдегид (ICA) и индол-3-уксусная кислота (IAA), являются потенциальными терапевтическими средствами из-за их репрессивного действия на экспрессию LEE (Bommarius et al., 2013). Индол представляет собой кворум-чувствительную и сигнальную молекулу стационарной фазы, продуцируемую не только EPEC, но и резидентной непатогенной E. coli , что потенциально объясняет часть вклада резидентной кишечной микробиоты в защиту от патогенной инфекции (Bommarius et al. ., 2013). При низкой концентрации 50 мкМ индол и ICA индуцируют экспрессию tir , но при уровнях выше 1 мМ индол, ICA и IAA ингибируют экспрессию генов LEE (Bommarius et al., 2013). ICA наиболее эффективно подавляет экспрессию LEE — при 1,5 мМ ICA снижает пьедесталы, образованные EPEC на культивируемых клетках, в семь раз (Bommarius et al., 2013). Когда Citrobacter rodentium вводят мышам MyD88 ^{— / —} , модели инфекции EPEC у людей, в летальной дозе, пероральное введение ICA снижает КОЕ в толстой кишке в 50 раз (Bommarius et al., 2013). Индол и ICA могут быть многообещающими терапевтическими средствами против EPEC.

Реакция конверта на стресс

Стрессовые реакции оболочки связаны с ослаблением вирулентности в EPEC (рис. 2). Из многих стрессовых реакций альтернативный стрессовый ответ сигма-фактора RpoE (σ ^E ) и двухкомпонентная система CpxRA используются в ответ на ряд стрессов, а также на неправильно свернутые белки внутренней и внешней мембран и периплазматические белки. σ ^E — один из шести альтернативных сигма-факторов в E.coli (Gruber and Gross, 2003), хотя прототип лабораторного штамма EPEC E2348 / 69 содержит вредоносную мутацию в σ ^S (Bleibtreu et al., 2014). В ответе на стресс σ ^E тепло (Эриксон и Гросс, 1989), н-бутанол (Резерфорд и др., 2010), цинк (Ямамото и Исихама, 2005), индол (Ицхаки и др., 2012) и другие факторы вызывают неправильную укладку белков внешней мембраны, что приводит к протеолитическому каскаду, который в конечном итоге срезает анти-σ-фактор RseA, высвобождая σ ^E (Mecsas et al., 1993) (рисунок 2). Зависимая от фазы роста активация σ ^E зависит от ppGpp (Costanzo and Ades, 2006), а DksA и ppGpp напрямую активируют σ ^E -зависимую транскрипцию (Costanzo et al., 2008). σ ^E связывается с РНК-полимеразой и направляет ее к промоторам, чтобы управлять экспрессией шаперона, протеазы и факторов биогенеза внешней мембраны (Raivio et al., 2013). CsrA репрессирует трансляцию σ ^E , а σ ^E косвенно активирует транскрипцию csrB и csrC , которые связывают и секвестрируют CsrA, с потенциальным влиянием на вирулентность, как указывалось ранее (Яхнин и др., 2017) (рисунок 2).

В E. coli двухкомпонентная система CpxRA стимулируется рядом сигналов, включая индол (Raffa and Raivio, 2002), высокую осмолярность (Jubelin et al., 2005), этанол (Bury-Moné et al. ., 2009), н-бутанол (Rutherford et al., 2010), медь (Yamamoto and Ishihama, 2006), щелочной pH (Danese and Silhavy, 1998), аминогликозидные антибиотики (Kashyap et al., 2011), адгезия (Otto and Silhavy, 2002), рост (DiGiuseppe, Silhavy, 2003; Wolfe et al., 2008) и ряд нарушений мембран / периплазматических белков и фосфолипидов (Jones et al., 1997; Wang et al., 2010; Itou et al., 2012; Райвио и др., 2013). Цинк не вызывает индукцию CpxRA (Yamamoto and Ishihama, 2005). Липопротеин внешней мембраны NlpE активирует CpxA в ответ на абиотическую поверхностную адгезию (Otto and Silhavy, 2002), а транскрипция cpxP транскрибируется на высоких уровнях в ответ и блокирует фосфорилирование CpxA в петле отрицательной обратной связи (Raivio et al., 1999 ). Внутренняя трансмембранная сенсорная гистидинкиназа CpxA напрямую воспринимает стрессоры, аутофосфорилирует свой цитоплазматический сенсорный домен, затем фосфорилирует CpxR, который продолжает связываться с последовательностями ДНК для регулирования экспрессии генов (Grabowicz and Silhavy, 2017) (Рисунок 2).Активация Cpx-ответа регулирует LEE и другие ключевые белки, которые способствуют бактериальной колонизации.

Ключевые белки ответа Cpx DsbA, PpiA и DegP активируются ответом Cpx и способствуют регуляции вирулентности. DsbA представляет собой дисульфидоксидазу, которая способствует стабильности основной субъединицы BFP bundlin (Zhang and Donnenberg, 1996; Heras et al., 2009; Vogt et al., 2010). PpiA представляет собой пептидил-пролилизомеразу и может способствовать биогенезу системы секреции третьего типа и жгутиков (Justice et al., 2005; MacRitchie et al., 2012). Так же, как в ответ на Cpx, кодирующее протеазу / шаперон degP транскрибируется в ответ на активацию σ ^E (MacRitchie et al., 2012; Abfalter et al., 2016). DegP разрушает неправильно свернутые белки периплазматической оболочки и расщепляет человеческий E-кадгерин, нарушая соединения межклеточной адгезии (MacRitchie et al., 2012; Abfalter et al., 2016). α-бундалин BFP связывается с N -ацетиллактозамингликановыми рецепторами на энтероцитах человека, и, следовательно, BFP разрушается DegP (Hyland et al., 2008; Хамфрис и др., 2010). В дополнение к этим вспомогательным факторам, которые вносят вклад в вирулентность, Cpx участвует в прямой репрессии LEE.

Стрессовый ответ оболочки Cpx оказывает негативное влияние на экспрессию LEE, особенно на опероны LEE4 и LEE5 (MacRitchie et al., 2008) (Рис. 2). Сайт связывания CpxR на LEE5 предполагает, что CpxR может действовать непосредственно на этот оперон (MacRitchie et al., 2008; Vogt et al., 2010). BFP, Intimin, Tir и транслокаторные белки EspA, EspB, EspD и игольчатый комплекс EscF, а также компоненты внутренней и внешней мембраны EscJ и EscC, как следствие, уменьшаются (MacRitchie et al., 2008; Vogt et al., 2010; MacRitchie et al., 2012). Несмотря на положительный эффект на патогенез через продвижение BFP и жгутиков и деградацию E-кадгерина некоторыми белками ответа Cpx (рис. 2), подавляющим эффектом стресса оболочки является снижение вирулентности EPEC, демонстрируемое введением цинка.

Тяжелые металлы вызывают стрессовую реакцию оболочки, и, хотя большинство из них не применимы в качестве терапии, поскольку они токсичны, Всемирная организация здравоохранения с 2008 года добавляла цинк для лечения острых диарейных инфекций.Цинк вводят вместе с методами регидратации, чтобы помочь в лечении острых диарейных инфекций, поскольку было замечено, что он снижает тяжесть и продолжительность заболевания (Sazawal et al., 1995). В частности, цинк вызывает стресс клеточной оболочки и косвенно подавляет вирулентность, возможно, через несколько механизмов стресса. Например, цинк увеличивает транскрипцию rpoE (Xue et al., 2015). В конечном итоге наблюдается заметное снижение экспрессии perC , bfpA, ler и espA , вероятно, из-за непрямого подавления, которое приводит к снижению адгезии к эпителиальным клеткам (Crane et al., 2007; Сюэ и др., 2015). Кроме того, темпы роста EPEC снижаются, а возмущение мембраны и проницаемость увеличиваются (Xue et al., 2015). Цинк как ингибитор вирулентности использовался и продолжает использоваться в ответ на EPEC и другие кишечные патогены.

Заключение

Изучение вирулентности EPEC выявило T3SS, многие регуляторы, эффекторные молекулы и стрессы окружающей среды, связанные с сенсорными реакциями и метаболизмом, которые необходимы для патогенеза. Здесь мы представляем наше текущее общее понимание сложных регуляторных сетей, которые способствуют колонизации и вирулентности, а также тех, которые нарушают этот процесс.Помимо общепринятых антибиотиков, два альтернативных терапевтических подхода — нарушение метаболизма триптофана производными индола или широко применяемые в настоящее время пищевые добавки с цинком. В то время как ICA и IAA еще не используются в клинической практике, недорогие добавки цинка давались вместе с пероральной регидратационной терапией детям и младенцам с диареей в течение почти десяти лет. Такая направленная терапия требует понимания консервативных регуляторных путей. Хотя большинство исследований было проведено с архетипическими штаммами EPEC, штамм-специфический регуляторный контроль генов вирулентности в ответ на воздействие окружающей среды, подобно тем, которые наблюдали Hazen et al.(2015a), иллюстрируют важность расширения наших исследований, чтобы охватить более широкий спектр родственных штаммов (Platenkamp and Mellies, 2017). Исследования регуляции генов вирулентности, связанных с сигналами окружающей среды, реакциями на стресс, метаболизмом и передачей сигналов, связанных с хозяином, добавят к растущему объему знаний, необходимых для минимизации болезней, вызываемых EPEC и родственными патогенами.

Взносы авторов

JM и AP были соавторами и редактировали рукопись. А.П. нарисовал цифры и составил таблицу.

Финансирование

Эта работа была поддержана грантом NIH 1R21AI115193-01, предоставленным JM.

Заявление о конфликте интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Список литературы

Абфальтер, К. М., Шуберт, М., Гётц, К., Шмидт, Т. П., Посселт, Г., и Весслер, С. (2016). HtrA-опосредованное расщепление E-кадгерина ограничено гомологами DegP и DegQ, экспрессируемыми грамотрицательными патогенами. Cell Commun. Сигнал. 14:30. DOI: 10.1186 / s12964-016-0153-y

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ахмед, С. Ф., Шахин, Х. И., Абдель-Месси, И. А., Мостафа, М., Патнэм, С. Д., Камаль, К. А. и др. (2014). Эпидемиологические и клинические характеристики диареи, связанной с энтеропатогенными, энтероагрегативными и диффузно-адгезивными Escherichia coli у детей Египта. J. Trop. Педиатр. 60, 397–400. DOI: 10.1093 / тропей / fmu034

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Аренас-Эрнандес, М. М., Мартинес-Лагуна, Ю., и Торрес, А. Г. (2012). Клинические последствия энтероадгезии Escherichia coli . Curr. Гастроэнтерол. Реп. 14, 386–394. DOI: 10.1007 / s11894-012-0277-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст

Арольд С. Т., Леонард П. Г., Паркинсон Г. Н. и Лэдбери Дж. Э. (2010). H-NS образует сверхспиральный белковый каркас для конденсации ДНК. Proc. Natl. Акад. Sci. США 107, 15728–15732. DOI: 10.1073 / pnas.1006966107

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст

Ашоккумар Б., Кумар Дж. С., Хехт Г. А. и Саид Х. М. (2009). Энтеропатогенный Escherichia coli подавляет усвоение кишечного витамина B1 (тиамина): исследования с человеческими клетками кишечного эпителия Caco-2. Am. J. Physiol. Гастроинтест. Liver Physiol. 297, G825 – G833. DOI: 10.1152 / ajpgi.00250.2009

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Барба, Дж., Бустаманте, В. Х., Флорес-Вальдес, М. А., Дэн, В. Ю., Финли, Б. Б., и Пуэнте, Дж. Л. (2005). Положительная регуляторная петля контролирует экспрессию локуса регуляторов Ler и GrlA, кодируемых сглаживанием энтероцитов. J. Bacteriol. 187, 7918–7930. DOI: 10.1128 / JB.187.23.7918-7930.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бхат, А., Шин, М., Чон, Дж. Х., Ким, Х. Дж., Лим, Х. Дж., Ри, Дж. Х. и др. (2014). Зависящая от петли ДНК авторепрессия промоторов LEE1 P1 под действием Ler в энтеропатогенной Escherichia coli (EPEC). Proc. Natl. Акад. Sci. США 111, E2586–2595. DOI: 10.1073 / pnas.1322033111

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бхатт, С., Аньянфул, А., Калман, Д. (2011). CsrA и TnaB корегулируют активность триптофаназы, способствуя индуцированному экзотоксинами уничтожению Caenorhabditis elegans энтеропатогенными Escherichia coli . J. Bacteriol. 193, 4516–4522. DOI: 10.1128 / JB.05197-11

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бхатт, С., Эдвардс, А. Н., Нгуен, Х. Т. Т., Мерлин, Д., Ромео, Т., и Калман, Д. (2009). РНК-связывающий белок csra является плейотропным регулятором локуса острова патогенности исчезновения энтероцитов энтеропатогенной Escherichia coli . Заражение. Иммун. 77, 3552–3568. DOI: 10.1128 / IAI.00418-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бхатт, С., Иган, М., Дженкинс, В., Муче, С., и Эль-Фенедж, Дж. (2016). Верхушка айсберга: о роли регуляторных малых РНК в вирулентности энтерогеморрагических и энтеропатогенных Escherichia coli . Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol. 6: 105. DOI: 10.3389 / fcimb.2016.00105

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Bhatt, S., Egan, M., Ramirez, J., Xander, C., Jenkins, V., Muche, S., et al. (2017). Hfq и три Hfq-зависимые малые регуляторные РНК-MgrR, RyhB и McaS-корегулируют локус сглаживания энтероцитов в энтеропатогенной Escherichia coli . Патог. Дис. 75: ftw113. DOI: 10.1093 / femspd / ftw113

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бингл, Л.Э., Константиниду, К., Шоу, Р. К., Ислам, М. С., Патель, М., Снайдер, Л. А. и др. (2014). Микроматричный анализ регулона Ler в энтеропатогенных и энтерогеморрагических штаммах Escherichia coli . PLoS One 9: e80160. DOI: 10.1371 / journal.pone.0080160

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Bleibtreu, A., Clermont, O., Darlu, P., Glodt, J., Branger, C., Picard, B., et al. (2014). Ген rpoS преимущественно инактивируется при хранении в лаборатории и претерпевает эволюцию источник-поглотитель у видов Escherichia coli . J. Bacteriol. 196, 4276–4284. DOI: 10.1128 / JB.01972-14

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Боммариус, Б., Аньянфул, А., Израелит, Ю., Бхатт, С., Картрайт, Э., Ван, В. и др. (2013). Семейство индолов регулирует вирулентность и выработку токсина шига в патогенной кишечной палочке . PLoS One 8: e54456. DOI: 10.1371 / journal.pone.0054456

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст

Брэнди, А., Джангросси, М., Джулиодори, А.М., и Фалькони, М. (2016). Взаимодействие между fis, h-ns и гуанозинтетрафосфатом модулирует транскрипцию гена Escherichia coli cspA в физиологических условиях роста. Фронт. Мол. Biosci. 3:19. DOI: 10.3389 / fmolb.2016.00019

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бринкли К., Берланд В., Келлер Р., Роуз Д. Дж., Бутин А. Т. и Клинк С. А. и др. (2006). Анализ нуклеотидной последовательности энтеропатогенной плазмиды фактора адгезии Escherichia coli pMAR7. Заражение. Иммун. 74, 5408–5413. DOI: 10.1128 / IAI.01840-05

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Буэрис В., Уэрта-Кантильо Дж., Наварро-Гарсия Ф., Руис Р. М., Чианчиарулло А. М. и Элиас В. П. (2015). Позднее возникновение прикрепляющегося и сглаживающего поражения, вызванного атипичной энтеропатогенной Escherichia coli , зависит от экспрессии белка, регулируемого Per. Заражение. Иммун. 83, 379–388. DOI: 10.1128 / IAI.02563-14

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бери-Моне, С., Nomane, Y., Reymond, N., Barbet, R., Jacquet, E., Imbeaud, S., et al. (2009). Глобальный анализ передачи сигналов экстрацитоплазматического стресса в Escherichia coli . PLoS Genet. 5: e1000651. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1000651

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бустаманте, В. Х., Сантана, Ф. Дж., Кальва, Э. и Пуэнте, Дж. Л. (2001). Регуляция транскрипции генов секреции типа III в энтеропатогенной Escherichia coli : ler противодействует H-NS-зависимой репрессии. Мол. Microbiol. 39, 664–678. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2001.02209.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бустаманте, В. Х., Вильяльба, М. И., Гарсия-Ангуло, В. А., Васкес, А., Мартинес, Л. К., Хименес, Р. и др. (2011). PerC и GrlA независимо регулируют экспрессию Ler в энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 82, 398–415. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07819.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Клири, Дж., Lai, L.C., Shaw, R.K., Straatman-Iwanowska, A., Donnenberg, M.S., Frankel, G., et al. (2004). Энтеропатогенная адгезия Escherichia coli (EPEC) к эпителиальным клеткам кишечника: роль пучкообразующих пилей (BFP), нитей EspA и интимина. Микробиология 150, 527–538. DOI: 10.1099 / mic.0.26740-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коллингтон, Г. К., Бут, И. В., и Кнуттон, С. (1998). Быстрая модуляция транспорта электролитов в монослоях клеток Caco-2 энтеропатогенной инфекцией Escherichia coli (EPEC). Кишечник 42, 200–207. DOI: 10.1136 / gut.42.2.200

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коллинз, Дж. У., Кини, К. М., Крепин, В. Ф., Ратинам, В. А., Фицджеральд, К. А., Финли, Б. Б. и др. (2014). Citrobacter rodentium: инфекция, воспаление и микробиота. Нац. Rev. Microbiol. 12, 612–623. DOI: 10.1038 / nrmicro3315

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коннолли, Дж. П. Р., Финли, Б.Б., Роу А. Дж. (2015). От приема внутрь до колонизации: влияние среды хозяина на регуляцию системы секреции типа III, кодируемой LEE, у энтерогеморрагической Escherichia coli . Фронт. Microbiol. 6: 568. DOI: 10.3389 / fmicb.2015.00568

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Cordeiro, T. N., Schmidt, H., Madrid, C., Juarez, A., Bernado, P., Griesinger, C., et al. (2011). Непрямое считывание ДНК белком, родственным H-NS: структура ДНК-комплекса С-концевого домена Ler. PLoS Pathog. 7: e1002380. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1002380

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Костанцо А. и Адес С. Э. (2006). Зависимая от фазы роста регуляция экстрацитоплазматического стрессового фактора, sigmaE, гуанозин-3 ’, 5’-бипирофосфатом (ppGpp). J. Bacteriol. 188, 4627–4634. DOI: 10.1128 / JB.01981-05

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Костанцо, А., Николофф, Х., Барчингер, С. Е., Банта, А. Б., Гурс, Р. Л., и Адес, С. Е. (2008). ppGpp и DksA, вероятно, регулируют активность экстрацитоплазматического стрессового фактора sigmaE в Escherichia coli как прямым, так и косвенным механизмом. Мол. Microbiol. 67, 619–632. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2007.06072.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Крейн, Дж. К., Наехер, Т. М., Шульгина, И., Чжу, К. Р., и Бодекер, Е. С. (2007). Влияние цинка на энтеропатогенную инфекцию Escherichia coli . Заражение. Иммун. 75, 5974–5984. DOI: 10.1128 / IAI.00750-07

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Данезе П. Н. и Силхави Т. Дж. (1998). CpxP, антистрессовый член регулона Cpx. J. Bacteriol. 180, 831–839.

Google Scholar

Deng, W., Puente, J. L., Gruenheid, S., Li, Y., Vallance, B.A., Vázquez, A., et al. (2004). Рассекающая вирулентность: систематический и функциональный анализ острова патогенности. Proc. Natl. Акад. Sci. США 101, 3597–3602. DOI: 10.1073 / pnas.0400326101

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Дэн В., Валланс Б. А., Ли Ю., Пуэнте Дж. Л. и Финли Б. Б. (2003). Транслоцированный Citrobacter rodentium рецептор интимина (Tir) является важным фактором вирулентности, необходимым для конденсации актина, кишечной колонизации и гиперплазии толстой кишки у мышей. Мол. Microbiol. 48, 95–115. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2003.03429.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

ДиДжузеппе, П. А., Сильхави, Т. Дж. (2003). Обнаружение сигнала и индукция целевого гена двухкомпонентной системой CpxRA. J. Bacteriol. 185, 2432–2440. DOI: 10.1128 / JB.185.8.2432-2440.2003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эберхард, В. Г. (1989). Почему бактериальные плазмиды несут одни гены, а другие нет? Плазмида 21, 167–174. DOI: 10.1016 / 0147-619X (89)

-1

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эдвардс, А.Н., Паттерсон-Фортин, Л.М., Вакульскас, К.А., Мерканте, Дж. У., Потрикус, К., Винелла, Д. и др. (2011). Схема, связывающая ЦСО и глобальные регулирующие системы строгого реагирования. Мол. Microbiol. 80, 1561–1580. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07663.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эллиот, С. Дж., Сперандио, В., Хирон, Дж. А., Шин, С., Меллис, Дж. Л., Уэйнрайт, Л. и др. (2000). Регулятор, кодируемый локусом сглаживания энтероцитов (LEE), контролирует экспрессию как LEE-, так и не-LEE-кодируемых факторов вирулентности в энтеропатогенных и энтерогеморрагических Escherichia coli . Заражение. Иммун. 68, 6115–6126. DOI: 10.1128 / IAI.68.11.6115-6126.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эллиот, С. Дж., Уэйнрайт, Л. А., МакДэниел, Т. К., Джарвис, К. Г., Дэн, Ю. К., Лай, Л.C., et al. (1998). Полная последовательность локуса исчезновения энтероцитов (LEE) из энтеропатогенной Escherichia coli E2348 / 69. Мол. Microbiol. 28, 1–4. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1998.00783.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эриксон, Дж. У., и Гросс, К. А. (1989). Идентификация сигма-субъединицы E РНК-полимеразы Escherichia coli : второй альтернативный сигма-фактор, участвующий в высокотемпературной экспрессии генов. Genes Dev. 3, 1462–1471. DOI: 10.1101 / gad.3.9.1462

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Франкель Г. и Филлипс А. Д. (2008). Прикрепление стирания Escherichia coli и парадигмы Tir-триггерной полимеризации актина: сойти с пьедестала. Ячейка. Microbiol. 10, 549–556. DOI: 10.1111 / j.1462-5822.2007.01103.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фридберг Д., Умански Т., Фанг, Ю., и Розеншайн, И. (1999). Иерархия в экспрессии локуса генов сглаживания энтероцитов энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 34, 941–952. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1999.01655.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фукуи, Н., Осима, Т., Уэда, Т., Огасавара, Н., и Тобе, Т. (2016). Активация гена посредством модуляции структур нуклеоидов с помощью горизонтально переносимого регулятора pch в энтерогеморрагической Escherichia coli . PLoS One 11: e0149718. DOI: 10.1371 / journal.pone.0149718

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гармендиа Дж., Франкель Г. и Крепин В. Ф. (2005). Энтеропатогенные и энтерогеморрагические Escherichia coli инфекции: транслокация, транслокация, транслокация. Заражение. Иммун. 73, 2573–2585. DOI: 10.1128 / IAI.73.5.2573-2585.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гайтан, М.О., Монхарас Фериа, Дж., Сото, Э., Эспиноза, Н., Бенитес, Дж. М., Джорджеллис, Д. и др. (2017). Новое понимание механизма SepL-опосредованного контроля эффекторной секреции у энтеропатогенной Escherichia coli . Microbiologyopen. 7: e00571. DOI: 10.1002 / mbo3.571

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хирон, Дж. А., Торрес, А. Г., Фрир, Э. и Капер, Дж. Б. (2002). Жгутики энтеропатогенной Escherichia coli опосредуют прикрепление к эпителиальным клеткам. Мол. Microbiol. 44, 361–379. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2002.02899.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Голдберг, М. Д., Джонсон, М., Хинтон, Дж. К., и Уильямс, П. Х. (2001). Роль нуклеоид-ассоциированного белка Fis в регуляции вирулентных свойств энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 41, 549–559. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2001.02526.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гомес-Дуарте, О.Г. и Капер Дж. Б. (1995). Кодируемая плазмидой регуляторная область активирует экспрессию хромосомного eaeA в энтеропатогенной Escherichia coli . Заражение. Иммун. 63, 1767–1776.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Гордон Б. Р., Ли Ю., Кот А., Вейраух М. Т., Динг П., Хьюз Т. Р. и др. (2011). Структурная основа распознавания AT-богатой ДНК неродственными ксеногенными белками сайленсинга. Proc. Natl. Акад. Sci. США 108, 10690–10695.DOI: 10.1073 / pnas.1102544108

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Грант, А. Дж., Фаррис, М., Алефундер, П., Уильямс, П. Х., Вудворд, М. Дж., И О’Коннор, К. Д. (2003). Координация экспрессии острова патогенности с помощью BipA GTPase в энтеропатогенной Escherichia coli (EPEC). Мол. Microbiol. 48, 507–521. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2003.t01-1-03447.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Грубер, Т.М., и Гросс, К. А. (2003). Множественные сигма-субъединицы и разделение бактериального транскрипционного пространства. Annu. Rev. Microbiol. 57, 441–466. DOI: 10.1146 / annurev.micro.57.030502.0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хаак К. Р., Робинсон К. Л., Миллер К. Дж., Фаулкс Дж. У. и Меллис Дж. Л. (2003). Взаимодействие Ler с опероном LEE5 ( tir ) энтеропатогенной Escherichia coli . Заражение.Иммун. 71, 384–392. DOI: 10.1128 / IAI.71.1.384-392.2003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хартленд, Э. Л., и Леонг, Дж. М. (2013). Энтеропатогенные и энтерогеморрагические E. coli: экология, патогенез и эволюция. Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol. 3:15. DOI: 10.3389 / fcimb.2013.00015

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хазен, Т. Х., Догерти, С. К., Шетти, А., Махуркар, А.А., Уайт О., Капер Дж. Б. и др. (2015a). Анализ RNA-Seq специфических для изолята и фазы роста различий в глобальных транскриптомах энтеропатогенных изолятов-прототипов Escherichia coli . Фронт. Microbiol. 6: 569. DOI: 10.3389 / fmicb.2015.00569

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хазен, Т. Х., Капер, Дж. Б., Натаро, Дж. П., и Раско, Д. А. (2015b). Сравнительная геномика позволяет понять разнообразие прикрепляющихся и удаляемых плазмид вирулентности Escherichia coli . Заражение. Иммун. 83, 4103–4117. DOI: 10.1128 / IAI.00769-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хазен, Т. Х., Сахл, Дж. У., Фрейзер, К. М., Донненберг, М. С., Шойц, Ф. и Раско, Д. А. (2013). Уточнение парадигмы патоваров с помощью филогеномики прикрепления и удаления Escherichia coli . Proc. Natl. Акад. Sci. США 110, 12810–12815. DOI: 10.1073 / pnas.1306836110

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hecht, G., Ходжес, К., Гилл, Р.К., Кир, Ф., Тьяги, С., Малакути, Дж. И др. (2004). Дифференциальная регуляция активности изоформ обмена Na + / H + энтеропатогенной E. coli в эпителиальных клетках кишечника человека. Am. J. Physiol. Гастроинтест. Liver Physiol. 287, G370 – G388. DOI: 10.1152 / ajpgi.00432.2003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Херас, Б., Шолдис, С. Р., Тоцика, М., Скэнлон, М. Дж., Шембри, М. А., и Мартин, Дж. Л.(2009). Белки DSB и патогенность бактерий. Нац. Rev. Microbiol. 7, 215–225. DOI: 10.1038 / nrmicro2087

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хамфрис, Р. М., Гринер, Т. П., Фогт, С. Л., Малви, Г. Л., Райвио, Т., Донненберг, М. С. и др. (2010). N-ацетилактозамин-индуцированная ретракция пучкообразующих пилей регулирует экспрессию генов, ассоциированных с вирулентностью, в энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 76, 1111–1126.DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2010.07192.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хайленд, Р. М., Сан, Дж., Гринер, Т. П., Малви, Г. Л., Классен, Дж. С., Донненберг, М. С. и др. (2008). Белок пилина бандлин энтеропатогенной Escherichia coli представляет собой N-ацетилактозамин-специфичный лектин. Ячейка. Microbiol. 10, 177–187.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Ибарра, Дж. А., Гарсия-Закариас, К. М., Лара-Очоа, К., Carabarin-Lima, A., Tecpanecatl-Xihuitl, J. S., Perez-Rueda, E., et al. (2013). Дальнейшая характеристика функциональных доменов pera, роли амино- и карбоксиконцевых доменов в связывании ДНК. PLoS One 8: e56977. DOI: 10.1371 / journal.pone.0056977

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ide, T., Michgehl, S., Knappstein, S., Heusipp, G., and Schmidt, M.A. (2003). Дифференциальная модуляция Са2 + секреции типа III диффузно прикрепляющейся энтеропатогенной Escherichia coli . Заражение. Иммун. 71, 1725–1732. DOI: 10.1128 / IAI.71.4.1725-1732.2003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Игучи А., Томсон Н. Р., Огура Ю., Сондерс Д., Оока Т., Хендерсон И. Р. и др. (2009). Полная последовательность генома и сравнительный анализ генома энтеропатогенного штамма Escherichia coli O127: H6 E2348 / 69. J. Bacteriol. 191, 347–354. DOI: 10.1128 / JB.01238-08

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Итоу, А., Мацумото К. и Хара Х. (2012). Активация системы передачи сигнала фосфолипидов Cpx в кислых фосфолипид-дефицитных мутантных клетках pgsA Escherichia coli . Biochem. Биофиз. Res. Commun. 421, 296–300. DOI: 10.1016 / j.bbrc.2012.04.003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Jeong, J.H., Kim, H.J., Kim, K.H., Shin, M., Hong, Y., Rhee, J.H., et al. (2012). Необычная особенность, связанная с промоторами LEE1 P1 в энтеропатогенной Escherichia coli (EPEC). Мол. Microbiol. 83, 612–622. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07956.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хименес Р., Крус-Мигони С. Б., Уэрта-Сакеро А., Бустаманте В. Х. и Пуэнте Дж. Л. (2010). Молекулярная характеристика GrlA, специфического позитивного регулятора экспрессии ler в энтеропатогенной Escherichia coli . J. Bacteriol. 192, 4627–4642. DOI: 10.1128 / JB.00307-10

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Джонс, К.Х., Данезе, П. Н., Пинкнер, Дж. С., Силхави, Т. Дж., И Халтгрен, С. Дж. (1997). Освобождение мембраны и путь сворачивания с помощью шаперонов воспринимается двумя системами передачи сигналов. EMBO J. 16, 6394–6406. DOI: 10.1093 / emboj / 16.21.6394

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Джубелин, Г., Вианни, А., Белойн, К., Гиго, Дж. М., Лаццарони, Дж. К., и Лежен, П., и др. (2005). Взаимодействие CpxR / OmpR регулирует экспрессию гена curli в ответ на осмолярность в Escherichia coli . J. Bacteriol. 187, 2038–2049. DOI: 10.1128 / JB.187.6.2038-2049.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Джастис С.С., Ханстад Д.А., Харпер Дж. Р., Дюгуай А. Р., Пинкнер Дж. С., Банн Дж. И др. (2005). Периплазматические пептидилпролил-цис-транс-изомеразы не важны для жизнеспособности, но SurA необходим для биогенеза пилуса в Escherichia coli . J. Bacteriol. 187, 7680–7686. DOI: 10.1128 / JB.187.22.7680-7686.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кашьяп Д. Р., Ван М., Лю Л. Х., Бунс Г. Дж., Гупта Д. и Дзиарски Р. (2011). Белки распознавания пептидогликанов убивают бактерии, активируя двухкомпонентные системы, чувствительные к белкам. Нац. Med. 17, 676–683. DOI: 10,1038 / нм. 2357

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кацович Н., Эльбаз Н., Пал Р. Р., Миллс Э., Коби С., Кахан Т. и др. (2017).Присоединение клетки-хозяина вызывает посттранскрипционную регуляцию при инфицировании энтеропатогенных бактерий. Наука 355, 735–739. DOI: 10.1126 / science.aah5886

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кенни, Б. (1999). Фосфорилирование тирозина 474 энтеропатогенной молекулы рецептора Tir Escherichia coli (EPEC) необходимо для активности нуклеации актина, и ему предшествуют дополнительные модификации хозяина. Мол. Microbiol. 31, 1229–1241.DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1999.01265.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кенни Б., Эйб А., Стейн М. и Финли Б. Б. (1997a). Энтеропатогенная секреция белка Escherichia coli индуцируется в ответ на условия, аналогичные условиям желудочно-кишечного тракта. Заражение. Иммун. 65, 2606–2612.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Кенни, Б., Де Винни, Р., Стейн, М., Райншайд, Д. Дж., Фрей, Э.А. и Финли Б. Б. (1997b). Энтеропатогенная E. coli (EPEC) переносит свой рецептор для интимного прилипания в клетки млекопитающих. Cell 91, 511–520. DOI: 10.1016 / S0092-8674 (00) 80437-7

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ким, С., Сонг, И., Эом, Г., Ким, С. (2018). Небольшой периплазматический белок с гидрофобным С-концевым остатком усиливает протеолиз DegP в качестве суицидного активатора. J. Bacteriol. 200: e00519-17. DOI: 10.1128 / JB.00519-17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Knutton, S., Baldwin, T., Williams, P., Manjarrezhernandez, A., and Aitken, A. (1993). Свойство прикрепления и удаления вирулентности энтеропатогенного Escherichia-coli . Zentralbl. Бактериол. 278, 209–217. DOI: 10.1016 / S0934-8840 (11) 80838-8

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Котлофф, К. Л., Натаро, Дж. П., Блэквелдер, В.C., Nasrin, D., Farag, T.H., Panchalingam, S., et al. (2013). Бремя и этиология диарейных заболеваний у младенцев и детей раннего возраста в развивающихся странах (Глобальное многоцентровое исследование кишечных заболеваний, GEMS): проспективное исследование случай-контроль. Ланцет 382, ​​209–222. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (13) 60844-2

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, Л. Дж., Барретт, Дж. А., и Пул, Р. К. (2005). Полногеномный транскрипционный ответ культивированного в хемостате Escherichia coli на цинк. J. Bacteriol. 187, 1124–1134. DOI: 10.1128 / JB.187.3.1124-1134.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Leh, H., Khodr, A., Bouger, M.C., Sclavi, B., Rimsky, S., and Bury-Mone, S. (2017). Структурные белки бактериального хроматина регулируют бимодальную экспрессию локуса патогенности островка патогенности энтероцитов (LEE) в энтеропатогенной Escherichia coli . мБио 8: e00773-17. DOI: 10.1128 / mBio.00773-17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Левертон, Л.К., и Капер, Дж. Б. (2005). Временная экспрессия энтеропатогенных генов вирулентности Escherichia coli на модели инфекции in vitro. Заражение. Иммун. 73, 1034–1043. DOI: 10.1128 / IAI.73.2.1034-1043.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Левин, М. М., Натаро, Дж. П., Карч, Х., Балдини, М. М., Капер, Дж. Б., Блэк, Р. Е. и др. (1985). Диарейный ответ человека на некоторые классические серотипы энтеропатогенной Escherichia coli зависит от плазмиды, кодирующей фактор энтероадгезивности. J. Infect. Дис. 152, 550–559. DOI: 10.1093 / infdis / 152.3.550

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, М., Розеншайн, И., Тунг, С. Л., Ван, Х. Х., Фридберг, Д., Хью, К. Л. и др. (2004). Сравнительный протеомный анализ внеклеточных белков энтерогеморрагических и энтеропатогенных штаммов Escherichia coli и их мутантов ihf и ler. заявл. Environ. Microbiol. 70, 5274–5282. DOI: 10.1128 / AEM.70.9.5274-5282.2004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макричи Д. М., Акоста Н. и Райвио Т. Л. (2012). DegP участвует в Cpx-опосредованной посттранскрипционной регуляции аппарата секреции типа III у энтеропатогенной Escherichia coli . Заражение. Иммун. 80, 1766–1772. DOI: 10.1128 / IAI.05679-11

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

MacRitchie, D. M., Ward, J. D., Nevesinjac, A. Z.и Райвио Т. Л. (2008). Активация стресса оболочки Cpx подавляет экспрессию нескольких локусов генов, кодируемых энтероцитами, в энтеронатогенном ответе Eschetichia coli . Заражение. Иммун. 76, 1465–1475. DOI: 10.1128 / IAI.01265-07

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Majowicz, S. E., Scallan, E., Jones-Bitton, A., Sargeant, J. M., Stapleton, J., Angulo, F. J., et al. (2014). Глобальная заболеваемость людей, продуцирующих токсин шига Escherichia coli , инфекции и смерти: систематический обзор и обобщение знаний. Патогенный микроорганизм пищевого происхождения. Дис. 11, 447–455. DOI: 10.1089 / fpd.2013.1704

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макобе, К. К., Санг, В. К., Кикуви, Г., и Кариуки, С. (2012). Молекулярная характеристика факторов вирулентности в диарейных изолятах Escherichia coli от детей в Найроби, Кения. J. Infect. Dev. Ctries. 6, 598–604. DOI: 10.3855 / jidc.2082

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

МакДэниел, Т.К. и Капер Дж. Б. (1997). Клонированный остров патогенности из энтеропатогенной Escherichia coli придает фенотип прикрепления и удаления E-coli K-12. Мол. Microbiol. 23, 399–407. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1997.2311591.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Mecsas, J., Rouviere, P. E., Erickson, J. W., Donohue, T. J., and Gross, C. A. (1993). Активность сигма E, индуцируемого нагреванием сигма-фактора Escherichia coli , модулируется экспрессией белков внешней мембраны. Genes Dev. 7, 2618–2628. DOI: 10.1101 / gad.7.12b.2618

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Меллис, Дж. Л., Бенисон, Г., Макнитт, В., Мейвор, Д., Бонифас, К., и Лараби, Ф. Дж. (2011). Лер патогенной Escherichia coli образует тороидальные белковые комплексы ДНК. Микробиология 157, 1123–1133. DOI: 10.1099 / mic.0.046094-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Меллис, Дж. Л., Эллиотт, С. Дж., Сперандио, В., Донненберг, М. С., и Капер, Дж. Б. (1999). Per регулон энтеропатогенной Escherichia coli : идентификация регуляторного каскада и нового активатора транскрипции, локуса регулятора, кодирующего сглаживание энтероцитов (LEE) (Ler). Мол. Microbiol. 33, 296–306. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1999.01473.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Меллис, Дж. Л., Платенкамп, А., Осборн, Дж., И Бен-Ави, Л.(2017). PerC управляет метаболизмом и поверхностными антигенами энтеропатогенной Escherichia coli . Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol. 7:32. DOI: 10.3389 / fcimb.2017.00032

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Монхарас Фериа, Х., Гарсиа-Гомес, Э., Эспиноза, Н., Минамино, Т., Намба, К., и Гонсалес-Педрахо, Б. (2012). Роль EscP (Orf16) в биогенезе инъекционных сомов и регуляции секреции белка типа III у энтеропатогенной Escherichia coli . J. Bacteriol. 194, 6029–6045. DOI: 10.1128 / JB.01215-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Манди Р., Макдональд Т. Т., Дуган Г., Франкель Г. и Уайлс С. (2005). Citrobacter rodentium мышей и человека. Ячейка. Microbiol. 7, 1697–1706. DOI: 10.1111 / j.1462-5822.2005.00625.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Наканиши, Н., Абэ, Х., Огура, Ю., Хаяси, Т., Таширо, К., Кухара, С., и другие. (2006). ppGpp с DksA контролирует экспрессию гена в локусе патогенности энтероцитов (LEE) островка патогенности энтерогеморрагической Escherichia coli посредством активации двух регуляторных генов вирулентности. Мол. Microbiol. 61, 194–205. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2006.05217.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Наканиши Н., Таширо К., Кухара С., Хаяси Т., Сугимото Н. и Тобе Т. (2009). Регулирование вирулентности с помощью определения бутирата у энтерогеморрагических Escherichia coli . Микробиология 155, 521–530. DOI: 10.1099 / mic.0.023499-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Нгуен, Р. Н., Тейлор, Л. С., Таушек, М., и Робинс-Браун, Р. М. (2006). Атипичная энтеропатогенная инфекция Escherichia coli и длительная диарея у детей. Emerg. Заразить. Дис. 12, 597–603. DOI: 10.3201 / eid1204.051112

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Океке, И.Н., Борнеман, Дж. А., Шин, С., Меллис, Дж. Л., Куинн, Л. Е., и Капер, Дж. Б. (2001). Сравнительный анализ последовательности плазмидного регулятора энтеропатогенных штаммов Escherichia coli . Заражение. Иммун. 69, 5553–5564. DOI: 10.1128 / IAI.69.9.5553-5564.2001

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Отто К. и Силхави Т. Дж. (2002). Зондирование поверхности и адгезия Escherichia coli , контролируемая сигнальным путем Cpx. Proc. Natl. Акад. Sci. США 99, 2287–2292. DOI: 10.1073 / pnas.042521699

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Padavannil, A., Jobichen, C., Mills, E., Velazquez-Campoy, A., Li, M., and Leung, K. Y., et al. (2013). Структура комплекса GrlR-GrlA, предотвращающего активацию GrlA генов вирулентности. Нац. Commun. 4: 2546. DOI: 10,1038 / ncomms3546.

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пан, К.К., Финкель, С. Е., Крамтон, С. Е., Фенг, Дж. А., Сигман, Д. С., и Джонсон, Р. К. (1996). Вариабельные структуры комплексов Fis-ДНК, определяемые фланкированием контактов ДНК-белок. J. Mol. Биол. 264, 675–695. DOI: 10.1006 / jmbi.1996.0669

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пирсон, Дж. С., Гиога, К., Вонг Фок Лунг, Т., и Хартланд, Э. Л. (2016). Генетика энтеропатогенной вирулентности Escherichia coli . Annu. Преподобный Жене. 50, 493–513. DOI: 10.1146 / annurev-genet-120215-035138

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Платенкамп А., Меллис Дж. Л. (2017). Патоварские транскриптомы. mSystems 2: e00049-17.

Google Scholar

Portaliou, A.G., Tsolis, K.C., Loos, M.S., Balabanidou, V., Rayo, J., Tsirigotaki, A., et al. (2017). Иерархическое нацеливание и секреция белков контролируется переключателем аффинности в системе секреции типа III энтеропатогенов. EMBO J. 36, 3517–3531. DOI: 10.15252 / embj.201797515

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Портер М. Э., Митчелл П., Фри А., Смит Д. Г. и Галли Д. Л. (2005). Промоторы LEE1 энтеропатогенных и энтерогеморрагических Escherichia coli могут активироваться PerC-подобными белками любого организма. J. Bacteriol. 187, 458–472. DOI: 10.1128 / JB.187.2.458-472.2005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Портер, М.Э., Митчелл, П., Роу, А. Дж., Фри, А., Смит, Д. Г. Э. и Галли, Д. Л. (2004). Прямая и непрямая транскрипционная активация генов вирулентности AraC-подобным белком PerA из энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 54, 1117–1133. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2004.04333.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пуэнте, Дж. Л., Бибер, Д., Рамер, С. В., Мюррей, В., и Школьник, Г. К. (1996). Формирующие пучки пили энтеропатогенной Escherichia coli : регуляция транскрипции с помощью сигналов окружающей среды. Мол. Microbiol. 20, 87–100. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02491.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Раффа Р. Г. и Райвио Т. Л. (2002). Третий путь передачи сигнала стресса оболочки в Escherichia coli . Мол. Microbiol. 45, 1599–1611. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2002.03112.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Райвио, Т. Л., Леблан, С. К., и Прайс, Н.Л. (2013). Стрессовый ответ оболочки Escherichia coli Cpx регулирует гены разнообразной функции, которые влияют на устойчивость к антибиотикам и целостность мембран. J. Bacteriol. 195, 2755–2767. DOI: 10.1128 / JB.00105-13

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Райвио Т. Л., Попкин Д. Л. и Силхави Т. Дж. (1999). Реакция на стресс оболочки Cpx контролируется усилением и подавлением обратной связи. J. Bacteriol. 181, 5263–5272.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Рис, С., Симмонс, К. П., Фиценри, Р. Дж., Бэтчелор, М., Хейл, К., Мэтьюз, С. и др. (2002). Мутагенез консервативных остатков триптофана в рецептор-связывающем домене интимина: влияние на связывающую активность и вирулентность. Микробиология 148, 657–665. DOI: 10.1099 / 00221287-148-3-657

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ронин И., Кацович Н., Розеншайн И. и Балабан Н.Q. (2017). Переключатель долговременной эпигенетической памяти контролирует бимодальность вирулентности бактерий. eLife 6: e19599 doi: 10.7554 / eLife.19599

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Розеншайн И., Рушковски С. и Финли Б. Б. (1996). Выражение активности прикрепления / удаления энтеропатогенной Escherichia coli зависит от фазы роста, температуры и синтеза белка при контакте с эпителиальными клетками. Заражение. Иммун. 64, 966–973.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Росс В., Томпсон Дж. Ф., Ньюлендс Дж. Т. и Гурс Р. Л. (1990). E.coli Fis-белок активирует транскрипцию рибосомной РНК in vitro и in vivo. EMBO J. 9, 3733–3742.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Резерфорд, Б. Дж., Даль, Р. Х., Прайс, Р. Э., Шмидт, Х. Л., Бенке, П. И., Мукхопадхай, А. и др. (2010). Функциональное геномное исследование экзогенного н-бутанольного стресса у Escherichia coli . заявл. Environ. Microbiol. 76, 1935–1945. DOI: 10.1128 / AEM.02323-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Санчес-Сан-Мартин, К., Бустаманте, В. Х., Кальва, Э. и Пуэнте, Дж. Л. (2001). Регуляция транскрипции гена orf19 и оперона tir-cesT-eae энтеропатогенной Escherichia coli . J. Bacteriol. 183, 2823–2833. DOI: 10.1128 / JB.183.9.2823-2833.2001

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сантос, А.С., Финли Б. Б. (2015). Уничтожение хозяина: энтеропатогенные и энтерогеморрагические Escherichia coli эффекторно-опосредованное нарушение путей врожденного иммунитета хозяина. Ячейка. Microbiol. 17, 318–332. DOI: 10.1111 / cmi.12412

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сазавал С., Блэк Р. Э., Бхан М. К., Бхандари Н., Синха А. и Джалла С. (1995). Добавки цинка для маленьких детей с острой диареей в Индии. Н.Англ. J. Med. 333, 839–844. DOI: 10.1056 / NEJM199509283331304

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Скалецкий И.С.А., Аранда К.Р.С., Соуза Т.Б., Сильва Н.П. (2010). Факторы адгезии в атипичных энтеропатогенных штаммах Escherichia coli , экспрессирующих локализованный характер адгезии в клетках HEp-2. J. Clin. Microbiol. 48, 302–306. DOI: 10.1128 / JCM.01980-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Скалецкий, И.К. А., Аранда, К. Р. С., Соуза, Т. Б., Сильва, Н. П., и Мораис, М. Б. (2009). Доказательства наличия патогенных подгрупп среди атипичных энтеропатогенных штаммов Escherichia coli . J. Clin. Microbiol. 47, 3756–3759. DOI: 10.1128 / JCM.01599-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сетте, М., Спурио, Р., Тротта, Э., Бранди, К., Брэнди, А., Пон, К. Л. и др. (2009). Последовательно-специфическое распознавание ДНК С-концевым доменом нуклеоид-ассоциированного белка H-NS. J. Biol. Chem. 284, 30453–30462. DOI: 10.1074 / jbc.M109.044313

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шарма В. К. и Цуэрнер Р. Л. (2004). Роль hha и ler в регуляции транскрипции оперона esp энтерогеморрагической Escherichia coli O157: H7. J. Bacteriol. 186, 7290–7301. DOI: 10.1128 / JB.186.21.7290-7301.2004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шарп, Ф.К. и Сперандио В. (2007). QseA напрямую активирует транскрипцию LEE1 в энтерогеморрагической Escherichia coli . Заражение. Иммун. 75, 2432–2440. DOI: 10.1128 / IAI.02003-06

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шаулов, Л., Гершберг, Дж., Дэн, В., Финли, Б. Б., и Сал-Ман, Н. (2017). Управляющий белок escp системы секреции энтеропатогенной Escherichia coli типа III участвует в восприятии кальция и регуляции иерархии секреции путем взаимодействия с привратным белком SepL. мБио 8: e01733-16 doi: 10.1128 / мБио.01733-16

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сингхал М., Манзелла К., Сони В., Алрефаи В. А., Саксена С., Хехт Г. А. и др. (2017). Роль протеинтирозинфосфатазы SHP2 в ингибировании SERT энтеропатогенами. Am. J. Physiol. Гастроинтест. Liver Physiol. 312, G443 – G449. DOI: 10.1152 / ajpgi.00011.2017

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сперандио, В., Меллис, Дж. Л., Делахей, Р. М., Франкель, Г., Кроуфорд, Дж. А., Нгуен, В. и др. (2000). Активация энтеропатогенных оперонов Escherichia coli (EPEC) LEE2 и LEE3 с помощью Ler. Мол. Microbiol. 38, 781–793. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.2000.02168.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Тарр П. И., Гордон К. А. и Чандлер В. Л. (2005). Шига-токсин-продуцент Escherichia coli и гемолитико-уремический синдром. Ланцет 365, 1073–1086.DOI: 10.1016 / S0140-6736 (05) 71144-2

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Тобе, Т., и Сасакава, К. (2001). Роль пучкообразующих пилусов энтеропатогенной Escherichia coli в адгезии клеток-хозяев и в развитии микроколоний. Ячейка. Microbiol. 3, 579–585. DOI: 10.1046 / j.1462-5822.2001.00136.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tobe, T., Schoolnik, G.K, Sohel, I., Bustamante, V.Х. и Пуэнте Дж. Л. (1996). Клонирование и характеристика bfpTVW, генов, необходимых для транскрипционной активации bfpA в энтеропатогенной Escherichia coli . Мол. Microbiol. 21, 963–975. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1996.531415.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Умански Т., Розеншайн И. и Фридберг Д. (2002). Терморегулируемая экспрессия генов вирулентности в энтеропатогенной Escherichia coli . Микробиология 148, 2735–2744.DOI: 10.1099 / 00221287-148-9-2735

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фогт, С. Л., Невесиньяк, А. З., Хамфрис, Р. М., Донненберг, М. С., Армстронг, Г. Д. и Райвио, Т. Л. (2010). Реакция на стресс оболочки Cpx как облегчает, так и ингибирует выработку энтеропатогенных пилообразных пучков Escherichia coli . Мол. Microbiol. 76, 1095–1110. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2010.07145.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, П., Кун, А., и Далби, Р. Э. (2010). Глобальное изменение экспрессии генов и физиологии клеток у обедненной YidC Escherichia coli . J. Bacteriol. 192, 2193–2209. DOI: 10.1128 / JB.00484-09

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wendrich, T. M., Blaha, G., Wilson, D. N., Marahiel, M. A., and Nierhaus, K.H. (2002). Рассмотрение механизма строгого фактора RelA. Мол. Cell 10, 779–788. DOI: 10.1016 / S1097-2765 (02) 00656-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Винарди, Р.С., Гулвади Р., Меллис Дж. Л. и Ян Дж. (2014). Локус регулятора, кодирующего удаление энтероцитов (Ler) патогенной Escherichia coli , конкурирует с гистоноподобным структурирующим нуклеоид белком (H-NS) посредством некооперативного связывания ДНК. J. Biol. Chem. 289, 13739–13750. DOI: 10.1074 / jbc.M113.545954

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вулф, А. Дж., Парих, Н., Лима, Б. П., и Жемайтайтис, Б. (2008). Интеграция сигнала с помощью двухкомпонентного регулятора реакции передачи сигнала CpxR. J. Bacteriol. 190, 2314–2322. DOI: 10.1128 / JB.01906-07

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вонг, А. Р., Пирсон, Дж. С., Брайт, М. Д., Мунера, Д., Робинсон, К. С., Ли, С. Ф. и др. (2011). Энтеропатогенные и энтерогеморрагические Escherichia coli : еще более разрушительные элементы. Мол. Microbiol. 80, 1420–1438. DOI: 10.1111 / j.1365-2958.2011.07661.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сюэ, Ю., Осборн, Дж., Панчал, А., и Меллис, Дж. Л. (2015). Путь стрессового ответа RpoE опосредует снижение вирулентности энтеропатогенной Escherichia coli под действием цинка. заявл. Environ. Microbiol. 81, 3766–3774. DOI: 10.1128 / AEM.00507-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Яхнин, Х., Айхеле, Р., Адес, С. Э., Ромео, Т., и Бабицке, П. (2017). Схема, связывающая глобальные системы стресс-реакции оболочки клетки, зависимые от Csr и σ. J. Bacteriol. doi: 10.1128 / JB.00484-17 [Epub перед печатью].

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст

Ямамото К. и Исихама А. (2006). Характеристика индуцируемых медью промоторов, регулируемых CpxA / CpxR, в Escherichia coli . Biosci. Biotechnol. Biochem. 70, 1688–1695. DOI: 10.1271 / bbb.60024

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Янг, Дж., Таушек, М., Харт, Э., Хартленд, Э. Л., и Робинс-Браун, Р. М. (2010). Регулирование вирулентности в Citrobacter rodentium : искусство измерения времени. Microb. Biotechnol. 3, 259–268. DOI: 10.1111 / j.1751-7915.2009.00114.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ye, F., Yang, F., Yu, R., Lin, X., Qi, J., Chen, Z., et al. (2018). Молекулярная основа связывания глобального посттранскрипционного регулятора CsrA и шаперона T3SS CesT. Нац. Commun. 9: 1196. DOI: 10.1038 / s41467-018-03625-х

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Йерушалми Г., Надлер К., Бердичевски Т. и Розеншайн И. (2008). Мутационный анализ локуса регулятора энтероцитов, кодируемого сглаживанием (Ler) энтеропатогенной Escherichia coli . J. Bacteriol. 190, 7808–7818. DOI: 10.1128 / JB.00663-08

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ицхаки, С., Рострон, Дж. Э., Сюй Ю., Райдаут, М. К., Аутемент, Р. Н., Барлоу, С. Б. и др. (2012). Сходство между экзогенно и эндогенно индуцированным стрессом оболочки: эффекты новой антибактериальной молекулы TPI1609-10. PLoS One 7: e44896. DOI: 10.1371 / journal.pone.0044896

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжан, Х. З., и Донненберг, М. С. (1996). DsbA необходим для стабильности пилина типа IV энтеропатогенной Escherichia coli . Мол.Microbiol. 21, 787–797. DOI: 10.1046 / j.1365-2958.1996.431403.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжу, К., Фэн, С., Тхате, Т. Е., Капер, Дж. Б., и Бодекер, Е. К. (2006). На пути к вакцине для прикрепления / удаления Escherichia coli : мутант регулятора (ler) кролика энтеропатогенной Escherichia coli , кодируемый LEE, является ослабленным, иммуногенным и защищает кроликов от летального заражения вирулентным штаммом дикого типа. Vaccine 24, 3845–3855. DOI: 10.1016 / j.vaccine.2005.07.019

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Атипичный гемолитико-уремический синдром — NORD (Национальная организация по редким заболеваниям)

Большинство случаев aHUS связаны с мутациями среди множества генов, которые продуцируют (кодируют) белки, участвующие в альтернативном пути комплемента, который является частью системы комплемента врожденная иммунная система. Система комплемента — это сложная группа белков, которые вместе борются с инфекциями в организме.Белки комплемента реагируют на бактерии, вирусы или другие чужеродные вещества в организме и в конечном итоге образуют большой мультибелковый комплекс, который напрямую атакует этих чужеродных захватчиков. Другие белки комплемента регулируют формирование этого атакующего комплекса, чтобы защитить собственные клетки организма от повреждения. У большинства людей с aHUS есть мутация в одном или нескольких генах, кодирующих эти регуляторные белки.

Мутации в одном из этих генов недостаточно, чтобы вызвать аГУС.Эти гены, скорее всего, передают генетическую предрасположенность к развитию аГУС, а не вызывают заболевание напрямую. Генетическая предрасположенность означает, что человек несет ген (или гены) расстройства, но он не может быть выражен, если он не запускается или не «активируется» при определенных обстоятельствах, например, из-за определенных факторов окружающей среды или из-за другого заболевания.

У большинства людей есть триггерное происшествие или событие, например, острая инфекция. Другие триггеры включают ветряную оспу (ветряную оспу) или грипп h2N1.У женщин беременность — частый спусковой крючок. Помимо триггера окружающей среды, затронутым людям может потребоваться мутация во втором гене комплемента или втором генетическом варианте, таком как однонуклеотидный полиморфизм (SNP), для развития расстройства. SNP являются наиболее распространенной генетической вариацией у людей и часто встречаются в ДНК человека. Большинство SNP не влияют на здоровье человека.

Было идентифицировано, по крайней мере, шесть различных генов, связанных с aHUS. Примерно в 30% случаев aHUS связан с нарушением работы гена (CFH), ответственного за выработку белка крови, известного как фактор H.Это наиболее частая мутация гена, связанная с aHUS. Фактор H — один из регуляторных белков системы комплемента, защищающих кровеносные сосуды от повреждений. Когда фактор H недостаточен или неактивен, существует вероятность повреждения мелких сосудов в почках с вторичным повреждением эритроцитов и тромбоцитов.

Другие случаи связаны с мутациями потери функции в генах, кодирующих другие регуляторные белки комплемента, мембранный кофакторный белок (MCP) и фактор I, или с мутациями усиления функции в генах, кодирующих ключевые белки комплемента, фактор комплемента B и C3.Наконец, мутации в гене, кодирующем тромбомодулин (THBD), эндотелиальный антикоагулянтный гликопротеин со свойствами регуляции комплемента, были обнаружены у 3-5% людей с aHUS.

Седьмой ген, известный как DGKE, был идентифицирован как связанный с aHUS. Некоторые исследователи полагают, что aHUS, связанный с DGKE, представляет собой похожее, но отличное заболевание. Белок, продуцируемый геном DGKE, не связан с альтернативным путем комплемента и вместо этого, по-видимому, участвует в процессе свертывания крови.

Конкретная присутствующая генетическая мутация с большей вероятностью связана с конкретными симптомами или тяжестью заболевания. Это известно как корреляция генотип-фенотип. На реакцию на лечение также может влиять конкретная основная генетическая мутация. Например, мутации MCP имеют более низкий риск необратимой почечной недостаточности и низкий риск рецидива заболевания после трансплантации почки. Люди с мутациями в генах CFH или THBD с большей вероятностью появятся в детстве.

У некоторых людей аГУС развивается из-за аутоантител, нацеленных на белки, кодируемые генами комплемента. Антитела — это специализированные белки, которые реагируют на инородные материалы в организме, вызывая их разрушение. Когда антитела реагируют против здоровой ткани, они известны как аутоантитела. Сообщалось, что аутоантитела к фактору H наблюдаются в 6–10% случаев, в основном у детей. Реже выявляются аутоантитела, нацеленные на другие белки комплемента. Причина развития этих аутоантител неизвестна.

Примерно у 30% -50% людей с аГУС не может быть обнаружена мутация в гене комплемента и аутоантитела. Эти люди могут быть названы страдающими идиопатическим аГУС. Однако многие исследователи полагают, что у этих людей, скорее всего, есть еще не идентифицированные мутации в генах комплемента.

Генетические мутации в генах комплемента, которые предрасполагают людей к aHUS, обычно возникают спорадически, что означает отсутствие предшествующего семейного анамнеза заболевания.Расстройство передается в семье только примерно в 20% случаев. В таких случаях эти мутации передаются (наследуются) как аутосомно-доминантный признак или, реже, как аутосомно-рецессивный признак. Доминирующая форма чаще поражает взрослых, чем детей.

Большинство генетических заболеваний определяется статусом двух копий гена, одной полученной от отца, а другой — от матери. Доминирующие генетические нарушения возникают, когда для того, чтобы вызвать конкретное заболевание, необходима только одна копия аномального гена.Аномальный ген может быть унаследован от любого из родителей или может быть результатом новой мутации (изменения гена) у пораженного человека. Риск передачи аномального гена от пораженного родителя к потомству составляет 50% для каждой беременности. Риск одинаков для мужчин и женщин.

Рецессивные генетические нарушения возникают, когда человек наследует две копии аномального гена одного и того же признака, по одной от каждого родителя. Если человек наследует один нормальный ген и один ген заболевания, он будет носителем болезни, но обычно не проявляет симптомов.Риск для двух родителей-носителей передачи измененного гена и рождения больного ребенка составляет 25% при каждой беременности. Риск иметь ребенка, который будет носителем, как и родители, составляет 50% при каждой беременности. Вероятность того, что ребенок получит нормальные гены от обоих родителей, составляет 25%. Риск одинаков для мужчин и женщин.

Прямой серологический анализ термолабильного энтеротоксина Escherichia coli с использованием пассивного иммунного гемолиза.

Ссылки

1 августа 1976 г. · Инфекция и иммунитет · DH MundellR M Wishnow

1 мая 1975 г. · Медицинский журнал Новой Англии · SL GorbachD Bessudo

1 марта 1976 г. · The Journal of Infectious Diseases · DJ EvansS L Gorbach

30 декабря 1976 г. · Медицинский журнал Новой Англии · HL DuPontD J Evans

1 января 1977 г. · Журнал клинической микробиологии · DJ Evans, DG Evans

10 июня 1976 г. · The New England Journal of Medicine · MH MersonE J Gangarosa

1 июля 1976 г. · Инфекция и иммунитет · RA Giannella

18 сентября 1975 г. · Медицинский журнал Новой Англии · RL GuerrantM A Sande

1 января 1975 г. · Ежегодный обзор микробиологии · RB Sack

1 декабря 1975 г. · Инфекция и иммунитет · RB SackR A Cash

1 марта 1974 г. · The Journal of Infectious Diseases · CL Gyles

1 марта 1974 г. · Инфекция и иммунитет · CL Gyles

1 февраля, 1973 · Журнал инфекционных болезней · Н. В. Смит, Р. Б. Сак k

1 сентября 1973 · Инфекция и иммунитет · DJ Evans, DG Evans

1 ноября 1973 · Инфекция и иммунитет · DJ EvansS L Gorbach

1 ноября 1973 · Инфекция и иммунитет · DG EvansS L Gorbach

Nov 1, 1973 · Annals of Internal Medicine · FA KlipsteinW E Moore

1 марта 1974 г. · The Journal of Infectious Diseases · RB SackR Mitra

1 марта 1974 г. · Инфекция и иммунитет · ST Donta, DM Smith

1 октября, 1974 • Инфекция и иммунитет

1 января 1986 г. · Медицинская микробиология и иммунология · MS GattiA R Monteiro

1 ноября 1985 г. · Журнал прикладной бактериологии · GP BongaertsR P Mouton

1 января 1982 г. · Медицинская микробиология и иммунология · T YanoA F de Castro

1 января 1980 г. · Medical Microb иология и иммунология · J GoldharM Lahav

1 января 1986 г. · Медицинская микробиология и иммунология · LC Ricci, AF de Castro

1 марта 1979 г. · Acta paediatrica Scandinavica · A SimhonL Mata

1 мая 1986 г. · Revista Do Instituto De Medicina Tropical De São Paulo · AC LinharesJ D Pereira

1 января 1988 г. · Микробиология и иммунология · Y OkuY Takeda

1 января 1984 г. · Медицинская микробиология и иммунология · LC RicciA F Pestana de Castro

1 января 1983 г. · Сделки Королевского общества тропической медицины и гигиены · AC LinharesE C Loureiro

1 июля 1977 г. · Инфекция и иммунитет · DJ EvansI Orskov

1 августа 1978 г. · Инфекция и иммунитет · DG Evans, DJ Evans

1 ноября 1977 г. · Журнал клинической микробиологии · RH YolkenA Z Kapikian

1 июля 1978 г. · Инфекция и иммунитет · FA KlipsteinR J Gross

1 июля 1979 г. · Инфекция и иммунитет · FA KlipsteinR F Engert

1 июня 1979 г. · Инфекция и иммунитет · МБ СерафимЛ Р Тра bulsi

1 июня 1984 г. · Журнал клинической микробиологии · Ф. А. Клипштейн Б. Роу

1 января 1981 г. · Журнал клинической микробиологии · Т. ХондаТ Миватани

1 февраля 1984 г. · Журнал клинической микробиологии · D SenS C Pal

января 1, 1985 • Фармакология и терапия · Журнал клинической микробиологии · MG Bramucci, RK Holmes

1 июля 1989 г. · Исследования в области микробиологии · LC RicciA F de Castro

1 июля 1980 г. · Инфекция и иммунитет · MH MersonR W Black

1 января 1979 г. · Журнал клинической микробиологии · BM BrillS H Richardson

1 ноября 1987 · Annales De L’Institut Pasteur.Микробиология · AC SaidA F Pestana de Castro

1 января 1980 г. · Журнал клинической микробиологии · DA SackW M Spira

1 апреля 1980 г. · Инфекция и иммунитет · FA KlipsteinH B Short

1 декабря 1980 г. · Журнал клинической микробиологии · T TsukamotoT Miwatani

1 ноября 1980 · Журнал клинической микробиологии · AF de CastroM S Gatti

1 ноября 1986 · Инфекция и иммунитет · BE GuthL R Trabulsi

1 февраля 1979 · Инфекция и иммунитет · DJ EvansH L DuPont

1 марта 1979 г. · Инфекция и иммунитет · Ф. А. Клипштейн, РФ Энгерт

1 января 1985 г. · Инфекция и иммунитет · TM ChenW K Maas

1 ноября 1981 г. · Журнал клинической микробиологии · MB SerafimA R Monteiro

1 февраля 1982 г. · Журнал клинической микробиологии · Б. Густафссон, Р. Меллби

1 октября 1985 г. · Журнал клинической микробиологии · Б. Е. Гут, Л. Р. Трабульси

1 ноября 1977 г. · Инфекция и иммунитет · Д. Г. Эванс В. Тхоа

1 февраля , 1978 · Инфекция и иммунитет · DG EvansH L DuPo nt

1 марта 1978 г. · Инфекция и иммунитет · DG EvansH L DuPont

1 февраля 1989 г. · Журнал клинической микробиологии · SM ScotlandB Rowe

Тест на гидролиз казеина

Казеин и сыворотка — два типа белка, обнаруженные в коровье молоко, составляющее 80% и 20% молочного белка соответственно ().Это высококачественные белки, так как они содержат все незаменимые аминокислоты …

Гидролиз казеина в виде полиуретана: протеолитический — бактериальный: FCC: гидролиз казеина в виде ПК: протеолитический — грибок: FCC: гидролиз гемоглобина в виде HUT или казеина в виде SAP: Пектиназа: AJDU или VPLA: Использование яблочного сока, пектин в качестве субстрата: Лизоцим: FCC: Микокк в качестве субстрата: Гемицеллюлаза: FCC: Вязкость: Трипсин: FCC: Гидролиз N-бензоил-L …

августа 17, 2021 · Тест на гидролиз казеина также можно использовать для дифференциации аэробных актиномицетов на основе протеолиза казеина.Тест на гидролиз казеина используется для идентификации организма, который помогает в гидролизе казеина. Некоторые из таких организмов включают Streptomyces, Pseudomonas и Actinomadura.

Я также наткнулся на эфирную связь во время своих исследований и хотел бы знать, как она играет роль в гидролизе сахарозы и взаимодействует ли с ней $ \ ce {HCl} $. Гидролиз по механизму реакции в органической химии. Делиться. Уточните этот вопрос. Follow отредактировано 17 дек.

Bacillus Bacillus sp.Стержень GP Спорообразователь Примеры B. anthracis B. cereus B. subtilis B. megatarium Экзоферменты Липаза Амилаза Казеаза Желатиназа Споры Гидролиз коллагена Фермент Желатиназа Использование петли (по сравнению с иглой) Засейте несколько раз Укол глубоко Субстрат Желатиновая реакция Прозрачная зона на агаре Разжиженный желатин в пробирке Инокулят для восстановления нитратов с петлевым инкубатором Дополнительные растворы Сульфаниловый …

Гидролиз казеина в виде полиуретана: протеолитический — бактериальный: FCC: гидролиз казеина в виде ПК: протеолитический — грибок: FCC: гидролиз гемоглобина в виде HUT или казеина в виде SAP: пектиназы : AJDU или VPLA: Использование яблочного сока, пектин в качестве субстрата: Лизоцим: FCC: Микокк в качестве субстрата: Гемицеллюлаза: FCC: Вязкость: Трипсин: FCC: Гидролиз N-бензоил-L…

Казеин — это высокомолекулярный белок, содержащийся в молоке. Как и крахмал, эта макромолекула должна гидролизоваться экзоферментами до более мелких молекул. В этом случае образуются аминокислоты, которые могут транспортироваться через клеточную мембрану. Этот гидролиз осуществляется протеолитическим экзоферментом, известным как казеиназа.

Тест гидролиза крахмала Тест гидролиза крахмала проверяет способность организма производить гидролитические ферменты или экзоферменты, такие как амилаза, в гидролизованный крахмал.Экзоферменты выводятся организмом, чтобы расщепить крупные или сложные вещества (крахмал) на более мелкие (сахара), чтобы они могли попасть в клетку для еды. Тест состоит из…

Методика использования принципа испытания гидролиза гиппурата. … 30 Либретексты биологии гидролиза казеина. Гидролизованный бульон International Dehydrated Foods Inc.

Быстрый анализ активности протеиназы в папаине путем измерения увеличения опалесценции раствора казеина во время гидролиза G.