аптечные средства и рецепты народной медицины от дисбактериоза, рекомендации по улучшению иммунитета
Антибиотики при длительном приеме разрушают микрофлору кишечника. Даже при однократном приеме нарушается правильный баланс. За один полный курс погибает около 50% микроорганизмов.
Восстановить микрофлору кишечника после антибиотиков очень сложно, поэтому принимать бифидобактерии нужно с начала антибактериальной терапии и не менее 1-2 недели по ее окончании.
Сведения о микрофлоре
Микрофлорой называют ряд бактерий, участвующих в обеспечении жизнедеятельности организма. Большая часть полезной флоры заселяет кишечник, оставшаяся треть распределяется на кожные покровы и органы мочеполовой системы.
- обеспечение защиты от вирусных и бактериальных инфекций;
- очистка от токсических выделений;
- контроль водно-электролитного процесса, газообразования;
- продукция гормонов, витаминов;
- регулировка усвоения полезных веществ.
Влияние антибактериальных средств на баланс микрофлоры
Кишечник насыщен бифидо и лактобактериями. Они нужны организму, отвечают за правильную работу органа. К условно-патогенной среде относят энтерококки, кишечную палочку, дрожжеподобные грибы. При нормальном балансе они не представляют угрозы для человека.
Антибактериальные препараты нарушают эту гармонию и приводят к уничтожению как вредных, так и полезных бактерий.
Наиболее опасны средства из макролидного, хинолинового, клиндамицинового, цефалоспоринового, амино пенициллинового ряда. Менее выраженное действие имеет Эритромицин.
При приеме антибиотиков разрушается флора кишечника. При отсутствии лечения это приводит к снижению иммунитета, нарушению в работе ЖКТ, ухудшению выработки витаминов, гормонов, не полному всасыванию полезных веществ.
Симптомы повреждения микрофлоры
- Появлении диареи.
- Вздутии.
- Повышенной утомляемости.
- Головных болях.
- Апатии.
- Депрессии.
- Неприятных ощущениях. Боль в животе обычно локализуется в нижней его части.
- Ломкости волос, ногтей, из-за плохой усвояемости витаминов.
Нормализация баланса микрофлоры у детей
Основными симптомами дисбактериоза у детей является боль и тяжесть в животе после приема лекарства. Это связано с тем, что из-за недостатка ферментов пища плохо переваривается и не полностью усваивается.
Остатки начинают гнить и провоцируют метеоризм, вздутие. Далее появляется диарея, обезвоживание. Может наблюдаться неприятный запах изо рта, гнилостный “аромат” испражнений, остатки непереваренной пищи в кале, слабость, сонливость.
- стоматит;
- молочница у девочек;
- аллергия на непереваренный белок;
- ослабление иммунитета;
- авитаминоз.
У малышей до года кишечник стерилен. Заселение бифидобактерий и иной флоры начинается при родах и продолжается при кормлении грудью. Тем не менее у грудничков риск дисбактериоза значительно выше, так как полное формирование оканчивается около года.
Проявляется болезнь обычно сильным плачем, срыгиванием, диареей, потерей веса, нарушением аппетита. При лечении детей следует неукоснительно соблюдать рекомендации врача. Но обычно достаточно материнского молока и введения кисломолочных продуктов после достижения 6 месяцев.
Классификация препаратов
Средства, восстанавливающие микрофлору, бывают в виде таблеток, капсул, готовых суспензий, порошков для разведения, капель.
- Пребиотики. Эти лекарства являются лишь основой “роста” новой флоры. Они не подлежат перевариванию. К этой группе относят галактозу, олигосахариды, лактулозу, инулин, изомеры фруктозы. Пребиотики встречаются в кукурузе, луке, цикории, чесноке, пшенице. Из медицинских средств выделяют Дюфалак, Лактусан, Нормазе.
- Пробиотики. Это комплексные средства с содержанием живых полезных бактерий. Они помогают побороть патогенную флору и нормализовать баланс. Известны такие лекарственные пробиотики, как Бифидумбактерин, Лактобактерин.
- Симбиотики. Имеют ряд бактерий, в составе пробиотические и пребиотические свойства. Сюда относят Бификол, Бифиформ. Некоторые медикаменты имеют комбинированный состав вместе с пребиотиками, например, Бифидо-бак, Ламинолакт.
- Иммуномодуляторы. Возобновляют защитные функции организма. Это настойка лимонника, эхинацеи, элеутерококка, экстракт прополиса.
Медикаменты для флоры, применяемые после антибиотиков
Лекарства, поддерживающие микрофлору, делятся на типы, основываясь на назначение и свойства. Из пробиотиков большая часть содержащихся бактерий не достигает места назначения, поэтому их лучше вводить с применением зонда или клизмы.
- Линекс. При нарушении микрофлоры обеспечивает организм бифидо и лактобактериями. Препарат поликомпонентный, поддерживает деятельность существующей полезной среды, сохраняя ее и заселяя новыми микроорганизмами. Выпускается в капсулах. У взрослых прием препарата производится в целом виде, детям разрешено раскрывать капсулу и растворять порошок в соке или воде. Запрещен медикамент при непереносимости лактозы.
- Бифидумбактерин. Бывает в порошке и капсулах. Недорогой и эффективный препарат комбинированного типа, назначают, когда окончен прием антибиотиков.
- РиоФлора. Укрепляет иммунитет, повышает уровень иммуноглобулинов А, поддерживает флору, предотвращает дисбактериоз.
Пребиотики помогают побороть патогенный микроорганизм еще в процессе приема антибактериальных средств.
- Хилак Форте. Угнетает патогенную среду, нормализует работоспособность кишечника. Форма выпуска – капли. Лекарство помогает справиться с запором, диареей, вздутием, метеоризмом, уменьшает тошноту. Детям препарат разводят в воде или соке.
- Дюфалак и Нормазе. Действующее вещество – лактулоза. Расщепление этого компонента происходит лишь в нижних частях пищеварительного тракта. Процесс приводит к понижению кислотности и размножению полезных бактерий.
- Бифиформ. В состав входят бифидобактерии, энтерококки. Бывает лекарство в виде капсул или порошкообразной формы.
- Биовестин. Комбинированный препарат. Жидкая эмульсия помогает наладить пищеварение, переваривание и всасывание полезных веществ, улучшает иммунитет, участвует в синтезе веществ.
- Бифидобак. БАД с рядом микроорганизмов. Помогает вырабатывать витамины, участвует в обменных процессах, стимулирует иммунитет. Производится в капсулах.
- Мультидофилус. Стимулирует работу кишечника. Содержит лактобациллы и бифидобактерии.
- Аципол. Капсулы устойчивы к кислотности желудка. Внутри содержатся ацидофильные лактобациллы и штаммы кефирного грибка. Средство избавляет от пищевой аллергии, инфекций, устраняет расстройство. Если принимать на фоне антибиотиков, то можно предотвратить молочницу.
Эффективны и препараты на основе спорообразующих бактерий. Это объясняется тем, что кислота желудка на них никак не влияет.
Среди таких препаратов:
- Споробактерин;
- Биоспорин.
Препараты для профилактики сохранения микрофлоры до приема антибиотиков
Чтобы защитить микрофлору и не позволить ее разрушить при употреблении антибактериальных средств, рекомендуется начать пить вспомогательные препараты сразу или заранее. Курс лечения включает пребиотики, витамины, энтеросорбенты.
Энтеросорбенты борются с интоксикацией. Наиболее популярны: Смекта, Энтеросгель, Полисорб.
Витаминные комплексы помогают предотвратить снижение иммунитета, ухудшение усвояемости полезных веществ, авитаминоз.
Пробиотики следует принимать после антибиотиков, они не эффективны для профилактических мер. Диета для микрофлоры
Чтобы нормализовать микрофлору, помимо приема препаратов, необходимо еще правильно питаться. Нельзя переедать, кушать следует часто, но маленькими порциями. Разгрузочные дни можно проводить на яблочной или кефирной диете.
Соблюдение питьевого режима — не менее важный этап, в сутки следует потреблять около 2 литров жидкости. Объем соли необходимо сократить. Продукты нужно отваривать или готовить на пару.
Стоит отказаться от:
- консерв;
- жирного мяса, бульонов, рыбы;
- мороженого;
- пряностей, копченостей;
- сдобы;
- кондитерских изделий;
- майонеза;
- кетчупа;
- алкоголя;
- кофе;
- перловки, ячки, пшенички;
- белого хлеба;
- бобовых;
- грибов;
- редиса.
Питание можно разнообразить фруктами и овощами богатыми клетчаткой, нежирным мясом, кефиром, ряженкой, йогуртом, гречкой, геркулесом, черносливом, медом.
Растительные препараты
После приема антибиотиков восстановить флору помогают некоторые травы, в частности их настои:
- Календула и зверобой. Для приготовления настойки смешивают зверобой и календулу в равных частях. 1 столовую ложку заливают кипятком и настаивают 15-20 минут. Готовый отвар процеживают и пьют по 50-80 мл незадолго до еды, за 30 минут. Этот напиток имеет бактерицидное действие, подавляет болезнетворные бактерии, стимулирует процесс пищеварения, устраняет интоксикацию.
- Шалфей и подорожник. Чтобы приготовить средство, смешивают подорожник и шалфей в равных пропорциях. Траву заливают кипятком (достаточно будет 1 литра) и варят около 5 минут. Процеживают и остужают, принимают по 50-60 мл трижды в сутки за полчаса до еды. Лекарственное средство имеет вяжущее, регенерирующее, бактерицидное действие.
Народные рецепты
Чтобы ускорить восстановление флоры на фоне приема соответствующих препаратов, можно прибегнуть к домашним методам борьбы с дисбактериозом.
Наиболее популярны:
- Смесь кураги, меда, чернослива. Все ингредиенты соединяют в равных частях и хранят в холодильнике. Принимают по 1 столовой ложке средства.
- Чеснок с простоквашей. На 1 стакан напитка понадобится 2 зубчика чеснока, которые следует тщательно измельчить. Принимают средство перед отходом ко сну.
- Чесночная настойка. 5 головок чеснока измельчают и соединяют смесь с литром оливкового или льняного масла. Настаивают в темном месте трое суток. Настойку пьют по 1 чайной ложке ежедневно натощак.
Чтобы избавиться от вздутия, народные средства предлагают укропную воду. Для этого 2 столовые ложки семян растения заливают 250 мл горячей воды и настаивают в термосе 2 часа. Пьют понемногу каждые 10-15 минут.
Длительность полного восстановления
Продолжительность терапии варьирует от 2 недель до нескольких месяцев. В основном это зависит от вида антибактериального средства, состояния органов ЖКТ пациента, типа болезни и ее тяжести, методов терапии. Намного быстрее выздоровление наступает, если пробиотики вводят сразу на фоне употребления антибиотиков, а не по окончании основной терапии.
Для стабилизации флоры после приема антибиотиков разработана масса средств в форме таблеток, капсул, капель, сиропов.
Симбиотики и пребиотики можно начинать пить раньше или совместно с антибактериальной терапией, что позволяет предотвратить негативные последствия. Пробиотики в этот период неэффективны
Правильно подобрать средство может только врач, опираясь на характер патологии, степень тяжести заболевания, возраст пациента, индивидуальные особенности организма.
Источник: https://vseozhivote.ru/kishechnik/kak-vosstanovit-mikrofloru-kishechnika-posle-antibiotikov.html
Как быстро восстановить микрофлору кишечника народными средствами и продуктами
В кишечнике человека находится множество бактерий: из них 80 % составляют бифидобактерии, остальная часть распределяется между микроорганизмами. В совокупности все они образуют микрофлору кишечника. Бифидобактерии, составляющие самую многочисленную группу кишечной флоры, очень необходимы для эффективной работы кишечного тракта.
Микрофлора кишечника нуждается в восстановлении, если в нем значительно уменьшается количественный состав бифидобактерий, народные средства зачастую очень эффективно справляются с этой задачей.
Роль микрофлоры для здоровья
Нормальная микрофлора кишечника является защитным барьером организма.
Если в кишечнике полный порядок с микроорганизмами, весь организм человека чувствует себя нормально, так как происходит хорошее переваривание пищи, питательные вещества полноценно усваиваются организмом.
Здоровая микрофлора является естественным барьером для патогенных бактерий, вырабатывает слизистые вещества, необходимые для оболочки кишечника, синтезирует витамины группы В и витамин К, тем самым обеспечивает нормальный уровень иммунитета.
Причины дисбактериоза
Если баланс бактерий в кишечном тракте нарушается, значительно уменьшается количество полезных бактерий и нарастает число болезнетворных микроорганизмов, развивается дисбактериоз. Он проявляется дискомфортом в животе. Но он не возникает сам по себе. Нормальная микрофлора нарушается при:
- приеме антибиотиков
- стрессовых ситуациях
- неправильном питании
- хронических заболеваниях
Признаки дисбактериоза, схожи с синдромом раздраженного кишечника:
- вздутие живота
- запор
- вялость
- диарея
Советы по восстановлению микрофлоры кишечника
Важно вовремя обратить внимание на проблему. Одной из причин нарушения флоры кишечника является прием антибиотиков. Поэтому обязательно после их приема следует пропить пробиотики, помогающие восстановить нормальную бактериальную среду кишечника.
Действие антибиотиков заключается в уничтожении и подавлении роста бактерий, вызывающих заболевание. Но вместе с болезнетворными бактериями антибиотики уничтожают и полезные. Количество полезных лакто−, бифидобактерий после курса антибиотиков значительно уменьшается, что позволяет патогенным микроорганизмам занять их место.
Прием препаратов, восстанавливающих микрофлору кишечника, очень важен во время лечения антибиотиками, если возникли предпосылки, и после него.
В аптеках представлен целый ряд этих замечательных препаратов: БифидумБАГ, Экофлор, Биофлор и др.
Если во время лечения антибиотиком возникло нарушение стула, появились признаки нарушения работы кишечника, начинают прием пробиотиков и пребиотиков. Но важно помнить, что эти препараты не принимаются одновременно с антибиотиком. Должно пройти не менее 2 часов после приема препарата, иначе антибиотик разрушит полезное действие пробиотического препарата.
Пробиотики содержат штаммы лакто−, бифидобактерий, необходимых для нормальной работы кишечника, пребиотики − попадая в ЖКТ, создают условия для быстрого роста полезной микрофлоры.
Также очень важно после курса приема антибиотиков включать в рацион питания кисломолочные продукты, содержащие бифидобактерии и лактобактерии. Это могут быть биойогурты, бифидокефир.
Народные средства, восстанавливающие микрофлору кишечника
Применение рецептов народной медицины помогает восстановить нормальный баланс микроорганизмов в кишечнике.
Лечение травами
Лекарственные травы помогают восстановить микрофлору кишечника. Прием настоя из равных частей зверобоя, ромашки, мелисы, семян льна благотворно сказывается на состоянии кишечника.
1 ст.л. сбора залить 0,5л кипятка, настоять 30мин., процедить. Принимать по ½ стакана 2 р. в день перед едой.
- Народное средство от вздутия живота и метеоризма
5 частей эвкалипта, 3 части мяты перечной, 1 часть семян укропа. 1 ст. л. смеси залить 1л кипятка, плотно закрыть, настоять 1 час, процедить. Принимать по 0,5 стакана перед едой в течение 2 недель.
- Настой девясила для улучшения микрофлоры
1ст.л. измельченного корня растения залить 200г чистой холодной воды, оставить на 8 часов (можно на ночь). Утром процедить. Пить по 50г перед едой 2 недели.
Отличным восстанавливающим действием обладает сбор из плодов шиповника, травы зверобоя, листьев крапивы двудомной, мяты перечной, подорожника, травы спорыша, листьев стевии, цветков липы. Смешать в равных количествах перечисленные ингредиенты (плоды шиповника измельчить). 1 ч.л. смеси залить 250г кипятка, закрыть крышкой, настоять 20 мин. Принимать по 0,5 стакана 2 р. в день.
- Отвар из корня кровохлёбки
300г измельченного корня залить 300мл кипятка, на слабом огне проварить 10 мин. Настоять 5 мин., процедить. Пить средство по 2 ст.ложки 4 р. в день в течение месяца.
Продукты для нормализации микрофлоры кишечника
Наряду с народными средствами нормализовать микрофлору кишечника помогут некоторые продукты питания. Продукты питания, пагубно влияющие на болезнетворные бактерии: чеснок, лук, черемша. Ежедневное употребление этих продуктов поможет быстрее привести в норму работу кишечника.
Для усиления их действия используют такие рецепты:
5 средних головок чеснока измельчить, залить 1л льняного или оливкового масла, настаивать 3 дня. Принимать масло по 1ч.л. утром натощак.
- Чеснок или черемша с простоквашей
2 зубчика чеснока или свежую черемшу смешать с 200г простокваши. Пить напиток вечером, незадолго перед сном.
Если нужно быстро восстановить микрофлору кишечника у маленьких детей, то поможет этот очень вкусный и простой рецепт: измельчите чернослив и курагу в блендере и смешайте полученную массу с качественным медом по вкусу. Для маленьких детей доза составляет по 1 чайной ложке утром и вечером, для подростков или взрослых по 1 ст ложке 2 раза в день.
Очень эффективный рецепт восстановления полезной микрофлоры кишечника у взрослых – это безградусная брага. Готовится это народное средство очень просто: в полулитре теплой воды размешайте по 1 столовой ложке сахарного песка и меда, а затем добавьте 2 грамма обычных дрожжей и тоже тщательно перемешайте.
Оставьте посуду в теплом месте побродить 2 часа (больше не нужно, иначе получится хмельная бражка). Всю дозу нужно будет выпить залпом за 1 раз между приемами пищи, т. е. примерно в 10-11 часов и 16-17 часов.
Эффективность этого рецепта высока тем, что вы сразу поселяете в своем кишечнике бродильные микроорганизмы, которые быстро восстанавливают полезную микрофлору.
Оздоровить и восстановить нормальную микрофлору кишечника помогут каши. Особенно хороши жидкие гречневая и геркулесовая каши. Употреблять их надо утром натощак. В каши можно добавлять яблоки, чернослив, курагу. Каши помогают выводу из организма шлаков, токсинов.
Включите в ежедневный рацион питания кисломолочные продукты: кефир, ряженку, кумыс. Утром и вечером выпивайте по стакану полезного напитка и со временем вы забудете о неприятной проблеме.
Профилактика
Причиной нарушения микрофлоры часто являются хронические заболевания. Своевременное выявление и лечение их помогут избежать проблем с кишечным трактом.
Откажитесь от вредных продуктов, диет для похудения. Организм должен ежедневно получать сбалансированное питание. Отказ от некоторых продуктов питания приводит к заболеваниям желудка и кишечника, чреватым нарушением их флоры.
Отличным способом профилактики дисбактериоза и восстановления микрофлоры в кишечнике является включение в рацион питания кисломолочных продуктов, овощей, фруктов, содержащих большое содержание клетчатки.
Важно! Газированные напитки, особенно сладкие, раздражают слизистую пищеварительного тракта, помогая вредным бактериям активно размножаться!
Обращайте внимание на состав продуктов, которые покупаете в магазине. Входящие в их состав усилители вкуса, консерванты, ароматизаторы не приносят пользы микрофлоре кишечника. Старайтесь выбирать продукты, содержащие минимум вредных веществ или вовсе откажитесь от таких.
Соблюдайте режим питания. Ешьте небольшими порциями. Пища не должна быть слишком горячей.
Источник: https://dar-zdorovya.ru/vosstanovlenie-mikrofloryi-kishechnika.html
Как восстановиться после курса антибиотиков
В любое время года можно заболеть. В особенности на стыке осень – зима, и зима – весна. Причиной тому является повышенная сырость и теплая погода. Не жара и не мороз. Чтобы правильно лечиться, важно понимать природу заболевания, правильно поставить диагноз. Если у болезни бактериальная основа, тяжелая форма и хоть немного запущенная стадия, для выздоровления назначаются антибиотики.
Почему антибиотики
Наш организм изначально оснащен системой защиты и способен отражать атаки врагов. Это иммунитет. Но если бактерий, попавших в тело, большое количество, а иммунная система недостаточно сильна, нам требуется помощь извне. Вот тут и нужны антибактериальные препараты. Они запрограммированы убивать те микроорганизмы, которые взломали иммунную защиту.
Вредоносных бактерий огромное число. Не все одинаково уязвимы. Поэтому антибиотики делятся на различные группы, в зависимости от того, какие бактерии они могут обезвредить. Как бы прискорбно это ни звучало, но вместе с вражескими, погибают и наши друзья-микроорганизмы. Те, что заселяют кишечник, кровь, слизистые оболочки. В общем, помощники нашего организма.
В тех случаях, когда диагноз был поставлен верно, назначено подходящее лечение и препараты, и не упущено драгоценное время – организм быстро выходит из критического положения.
Это хорошо также и тем, что восстановление иммунной системы происходит практически безболезненно и микрофлора без посторонней помощи вновь достигает необходимого уровня.
Но что бывает, когда антибактериальная терапия продолжается дольше недели? Когда болезнь беспощадно истощает тело, а антибиотики разрушают практически всю нашу защитную крепость? Человек начинает испытывать другой недуг – дисбактериоз. В таком случае приходится отстраивать все заново, используя для восстановления все, что только возможно.
Как распознать дисбактериоз?
Дисбактериоз – это нарушение соотношения полезной кишечной палочки, бифидо- и лакто-бактерий в организме.
Основные симптомы:
- нарушения стула, с преобладанием диареи;
- болевые ощущения в животе умеренной интенсивности;
- вздутие живота;
- встречается небольшое повышение температуры;
- слабость, быстро наступающая усталость, головные боли;
- депрессивные состояния, беспричинная смена настроения;
- сухость кожи и слизистых, хрупкость ногтей и волос.
Не делайте выводов самостоятельно, не рискуйте, чтобы не ухудшить ситуацию. Если вы обнаружили у себя однин или тем более несколько симптомов, немедленно обратитесь к врачу. Возможно, подтвердится дисбактериоз и придется от него избавляться.
В помощь микрофлоре
Врач с опытом и искренним желанием помочь вам восстановить организм после серьезного заболевания непременно расскажет о возможном вреде от антибиотиков. Прежде всего, доктора рекомендуют некоторые препараты фармацевтики.
Таблетки, порошки, капсулы и суспензии для возобновления полезной микрофлоры и выведения остатков лекарств из организма.
Но на сегодняшний день множество врачей обращают наше внимание на немедикаментозные способы лечения, на рецепты наших прародителей, на целебные силы самой природы.
И все же в первую очередь стоит качественно изменить свой рацион. Придется ограничить или вовсе исключить такие продукты, как алкоголь, соления и овощные салаты, пирожные и конфеты, жареное, острое и жирное. Во время еды не пить воду.
И вообще, чай, кофе и другое питье нужно употреблять с промежутком как минимум в час после приема пищи. Предпочтение следует отдать белковой, мясной еде, но исключительно в тушеном или отварном виде.
Хлеб лучше есть подсушенный и в виде сухариков.
Рецепты для борьбы с дисбактериозом
Чтобы помочь своему организму попробуйте применить некоторые рекомендации.
- На водяной бане 15 минут варить столовую ложку дубовой коры, залитую стаканом кипящей воды. Отставить на 45 минут, процедить и можно принимать по ½ стакана несколько раз в сутки.
- Столовую ложку лапчатки залить стаканом кипятка, 15 минут поварить на медленном огне. После накрыть кастрюлю толстым полотенцем и оставить до утра. Пить по пол стакана 3 раза в день.
- В 500 мл теплой воды растворить по ложке меда и сахара, добавить 2 г дрожжей. Не более чем через полтора часа, чтобы не забродило, весь объем нужно выпить. Через три часа можно поесть. Два-три дня принимать лекарство дважды в сутки.
- Утром натощак выпить стакан домашней теплой сыворотки. Несколько дней и микрофлора восстановится.
- Литр молока вскипятить и разделить на 4 порции. Подойдут маленькие баночки или стаканы. Когда молоко будет уже комнатной температуры, положить в каждую посуду для закваски ломтики черного черствого хлеба. Спустя сутки в получившуюся простоквашу нужно добавить еще сухариков, натертых чесноком. Убрать в холодильник. Лекарство принимать по необходимости несколько дней. Можно периодически готовить такую простоквашу с чесноком просто для удовольствия и профилактики.
- Две ложки смеси подорожника и аира залить кипятком и настоять полчаса. Готовое лекарство принимать на протяжении 10 дней по 50 мл за 30 минут каждый раз перед едой.
- Практически любые кислые ягоды замечательно помогают восстанавливать микрофлору кишечника после антибактериального лечения. Для этого нужно просто ежедневно есть немного шиповника, клюквы, голубики или других подобных ягод.
- Взять поровну ядра грецкого ореха, семечки подсолнуха и тыквы. В ступке или блендером измельчить смесь. В полстакана кипяченой воды всыпать 2 столовые ложки получившегося порошка, перемешать и выпить. Принимать дважды в день. Эффект наступит от 10-дневного курса.
- Стаканом воды залить 200 г измельченных корней кровохлебки. На маленьком огне томить 20 минут. Остудить, процедить и принимать по столовой ложке до 6 раз в сутки на протяжении месяца.
- Небольшого размера тыкву помыть, обсушить и срезать верхушку, как крышку. Аккуратно вынуть все семечки, а внутрь залить натуральный мед до самого верха. Срезанную верхушку приложить обратно и тестом по кругу замазать щель, как бы законопатить тыкву. Поставить в темное и прохладное место на 10 дней. Теперь лекарство готово. Есть его нужно по столовой ложке за час до еды трижды в день.
- На протяжении двух часов настаивать 2 столовые ложки укропного семени в стакане кипятка. Пить понемногу через каждые два часа.
- На завтрак следует есть кашу из овсяных хлопьев или гречневой крупы. Хорошо будет добавить в кашу чернослив. Обед обогащайте вареной свеклой. Два зубка чеснока в день помогут восстановить микрофлору кишечника. Полезно пить компот из сухофруктов или чай с лимоном.
- Приготовить смесь из чернослива, кураги и меда. Измельчить, перемешать и съедать по столовой ложке в день.
- Пол-литра кефира или кислого молока поместить в литровую банку, положить туда же несколько веточек свежего или сухого укропа с петрушкой, по чайной ложке цветков ромашки и зверобоя, два зубчика измельченного чеснока и примерно столько же лука. Кипящей водой долить содержимое банки до верха. Настаивать полчаса, затем процедить и сразу выпить один-два стакана лекарства.
Есть много различных комбинаций лекарственных растений, помогающих восстановиться после антибактериального лечения. Всех компонентов нужно взять в одинаковом количестве, пропустить через мясорубку или кофемолку. Две ложки сбора сложить в термос, запарить литром кипятка и оставить до утра.
Мелкими порциями, по 100 мл, выпить за день весь объем процеженного настоя. Допускается для вкуса положить в чашку немного меда. Проводить лечение травяными настоями придется продолжительное время, используя курсы по 2 месяца с перерывом в две недели. Затем необходимо поменять сбор и продолжить терапию.
Результат уже довольно скоро порадует, но рекомендуется принимать травы на протяжении года. Вот некоторые из таких сборов:
- спорыш, репешок, плоды рябины черноплодной, плоды или соцветия черемухи, дубовая кора, корни осины и аира;
- ольховые шишки, корни осины, бадана и змеиного горца, кора дуба, плоды софоры и трава тысячелистника;
- репешок, тысячелистник, плоды софоры, ольховые шишки, соцветия или плоды черемухи, корень кровохлебки;
- трава грушанки, листья черники, плоды черемухи, корни аира и кора дуба.
Важно
Часто мы относимся к своему здоровью не очень внимательно. К состоянию своей микрофлоры тем более, ведь невооруженным глазом ее не рассмотреть. Однако нормальный баланс микроорганизмов в нашем теле крайне важен.
Это и защита от возбудителей разных болезней, и гарантия правильного пищеварения, и поддержание нашего иммунитета в тонусе.
Может, если все это будет работать без сбоев, нам и вовсе не понадобится лечение при помощи антибиотиков?
Источник: http://fitoresept.ru/kak-vosstanovitsya-posle-kursa-antibiotikov/
Лучшие народные рецепты для восстановление микрофлоры кишечника
Восстановление микрофлоры кишечника народными средствами — очень эффективная процедура, которая вполне может быть проведена в домашних условиях.
И если уничтожить микроорганизмы, живущие в кишечники очень просто, то их восстановление может занять продолжительное время.
Повредить микроорганизмам могут самые разные причины и факторы. Во-первых, уничтожить флору кишечника могут различные врожденные болезни, которые приводят к недостатку (или переизбытку) фермента.
Во-вторых, флора может быть уничтожена вследствие принятия медикаментозных средств (например антибиотиков), а также из-за неправильного питания, различных инфекций и излишка алкогольных напитков.
Кроме того радиация всех видов (включая рентгеновские лучи) могут убивать флору кишечника.
Поэтому восстановление микрофлоры кишечника народными средствами крайне важно, так как от этого зависит здоровье человека. Благо существует огромное количество лекарственных трав, которые помогут решить эту проблему.
Так в частности для того, чтобы быстро восстановить микрофлору кишечника можно сделать сладкую и полезную смесь. Изготавливается такая смесь из меда, кураги и чернослива. Твердые ингредиенты необходимо размельчить с помощью блендера или мясорубки, а после смешать их с медом. Употреблять такую смесь надо по одной столовой ложке в день.
Восстановление микрофлоры кишечника народными средствами можно проводить с помощью классических круп. К примеру, очень помогают каши из геркулеса или гречки, съеденные за завтраком. Не будет лишним добавить к каше качественный чернослив.
Также восстановлению микрофлоры очень хорошо помогает компот из сухофруктов. К обеду добавляйте винегрет или любой другой салат из свеклы.
Пейте чай с добавлением кусочка лимона, ежедневно съедайте 2 зубчика чеснока для уничтожения злотворных бактерий.
Конечно же, оптимальным вариантом будет употреблять различные кисломолочные продукты, такие как кефир и творог. Есть их можно без ограничений, так как эти продукты приносят организму исключительно пользу. Достаточно большой эффективностью отличается прием кумыса или ряженки (до двух стаканов в сутки).
Восстановление микрофлоры кишечника народными средствами можно осуществлять с помощью корней кровохлебки. Для этого нужно 200 граммов корня кровохлебки залить стаканом воды и оставить вариться на медленном огне 15-20 минут. Получившийся отвар нужно принимать внутрь пять-шесть раз в день по одной столовой ложке. Подобное лечение нужно проводить как минимум месяц.
Также можно приготовить отличный рецепт из четырех чайных ложек семян укропа. Семена укропа нужно залить стаканом кипятка и оставить настаиваться в течение двух часов. После этого полученный настой следует принимать каждые два часа.
Подорожник с корнем аира – отличный способ восстановить флору кишечника. Как и в предыдущих случаях, 2 ч ложки смеси лекарственных трав заливают кипятком и настаивают полчаса, после чего принимают в течение десяти дней по 50 миллилитров за полчаса перед каждым приемом пищи.
Восстановление микрофлоры кишечника после антибиотиков брагой. Это самый, что ни на есть народный рецепт. В поллитра теплой воды добавляете по 1 ст ложке меда и сахара и примерно 2 г дрожжей. Все тщательно перемешиваете и оставляете бродить на пАру часов в теплое место.
Дольше не стоит, иначе получится хмельная брага. Выпить следует сразу все за раз залпом. Выпивать по времени ровно между приемами пищи. Это получится 2 кружки в день.
Этим средством вы сразу поселяете в кишечник бродильные микроорганизмы, тем самым восстанавливаете его нормальную работу.
Еще запомните — все кислые ягоды, типа клюквы, и плоды шиповника — это очень хорошее лекарство для восстановления микрофлоры кишечника. Ешьте их ежедневно и у вас все будет хорошо.
Уже ни для кого не секрет, что тыквенные семечки хорошо очищают кишечник от паразитов. Усильте их действие таким рецептом: в равных количествах измельчите в блендере тыквенные семечки, семечки от подсолнуха и грецкие орехи. 2 ст ложки получившегося порошка размешиваете в половине стакана кипяченой воды и выпиваете. Курс приема 2 раза в день 10 дней.
Стоит отметить, что восстановление флоры кишечника процедура, которая требует терпения и кропотливой работы. Для полного излечения нужно принимать целебные травы как минимум десять дней и при этом нельзя игнорировать диету.
Источник: https://formulazdorovya.com/631617629171222633/luchshie-narodnye-retsepty-dlya-vosstanovlenie-mikroflory-kishechnika/
Восстановление после антибиотиков: очищение организма, усиление иммунитета
Если человек хотя бы единожды в жизни сталкивался с необходимостью приема антибиотиков, то наверняка знаком и с важностью восстановления после антибиотиков.
Антибиотические средства – это эффективное лекарство в борьбе против вредоносных микроорганизмов, которые вызывают инфекции и воспаления.
Мы принимаем эти препараты по время сезонной простуды, а также при воспалении тканей, после операций, чтобы не допустить осложнений.
Однако ни для кого не секрет, что у антибиотических средств, спасших миллионы жизней, есть и обратная сторона.
Своеобразной платой за их эффективность являются тяжелые токсические эффекты и гибель полезной микрофлоры.
Некоторые из препаратов нового поколения уже частично лишены этих недостатков, однако подавляющее большинство лекарств против бактерий все еще оставляют после себя неприятные последствия.
Врачи, прописывая курс антибактериальных препаратов, всегда подсказывают пациенту, как восстановиться после приема курса антибиотиков.
Иногда в условиях стационара проводится полноценная реабилитация после антибиотиков, если больному с иммунодефицитом пришлось перенести агрессивное лечение.
Но в данной статье речь пойдет скорее о том, как почистить организм после антибиотиков в домашних условиях после бытовой ситуации: к примеру, лечения простуды.
Чем вредят антибиотики
Прежде чем переходить к непосредственно описанию восстановительного курса, следует пояснить, зачем нужно восстановление после антибиотиков. Как уже было упомянуто, после длительного приема антибиотиков вместе с патогенной микрофлорой гибнет и полезная – например, бактерии пищеварения, которые безвредны для человека и помогают переваривать пищу.
В результате этого после применения антибиотиков возникает дисбаланс кишечной микрофлоры (если речь идет про таблетки, а не про антибиотики в ампулах или местные средства). «Вакантное» место погибших бактерий сразу же начинают занимать другие микроорганизмы – либо другие бактерии, либо простейшие грибы, которые начинают врастать в стенки кишечника, нарушая его деятельность.
На организм женщины антибиотики влияют еще сильнее. Например, распространенная проблема представительниц прекрасного пола – появление молочницы после приема антибиотиков. Это происходит из-за того, что антибиотики, даже принимаемые в виде таблеток, способны оказывать системное влияние на организм, действуя не только в кишечнике, но и на слизистых.
Осложнения после лечения антибиотиками могут быть самые разные. Основные, и самые безобидные – это метеоризм, диарея, длительные запоры и другие кишечные расстройства. В тяжелых случаях серьезно страдает печень и развиваются другие токсические эффекты.
Еще раз отметим, что восстановление после приема антибиотиков – это нормальная процедура, которая входит в курс лечения.
Это не значит, что антибиотики – плохое средство и нужно всеми силами избегать их употребления (напротив, это может быть опасно для здоровья), а вот разумно помогать своему организму необходимо.
Заниматься самодеятельностью тоже не нужно – как восстановить организм должен либо подсказывать врач, либо сам пациент должен согласовать с ним свою инициативу.
Так ли необходимо восстановление
Многие сторонники здорового образа жизни и лечения народными средствами настолько фанатично обсуждают очищение организма от токсинов после антибиотиков, будто человек прошел не курс лечения, а был отравлен ядом.
Во-первых, восстановление организма после приема антибиотиков требуется далеко не всем пациентам.
Если человек, к примеру, лечится от простуды или воспалительного процесса, но при этом не имеет никаких тяжелых хронических заболеваний, не является пожилым и не имеет иммунодефицита, то стандартный курс антибиотических средств не сможет ему навредить.
Другое дело, если курс лечения затягивается и становятся очевидными побочные эффекты – появляется диарея или метеоризм, нарушается поступление питательных веществ из кишечника, возможно появление вздутия живота.
Во-вторых, реабилитация после курса лечения антибиотиками необходима не только как восстановление организма после антибиотиков, но, прежде всего, как восстановление организма после болезни.
Бактерии сами по себе наносят гораздо больший ущерб, чем можно нанести лекарствами – антибиотиками, так что вопрос должен быть не столько о том, как восстановиться после антибиотиков, а скорее о том, как восстанавливаться и устранять последствия перенесенной болезни.
Таким образом, после курса антибиотиков нужно пропить препараты для восстановления организма тем людям, которые:
- были ослаблены на момент лечения;
- испытывают побочные действия антибиотиков.
Для остальных пациентов после антибиотиков нужно лишь соблюдать щадящий режим, употребить курс витаминов и хорошо отдыхать.
Как минимизировать негативное действие антибиотиков
Чтобы не думать о том, как восстановить организм после антибиотиков, нужно соблюдать правила их приема, которые помогут сохранить полезные бактерии микрофлоры и здоровье других органов.
Прежде всего следует знать касательно антибиотиков что нужно пить эти препараты только по назначению врача и сдачи анализов. Самые токсичные противомикробные лекарства – препараты широкого спектра действия, гораздо эффективнее в самом начале заболевания выявить возбудителя, сделав посев флоры, и принимать препарат избирательного действия.
Без назначения врача пить антибиотические лекарства нельзя ни в коем случае, т.к. это ведет не только к интоксикации организма, но и к тому, что бактерии привыкают к препарату и у них появляется устойчивость к его воздействию. Это уже опасно не только для конкретного человека, но и для всех, кто с ним контактирует.
Второе золотое правило – нужно принимать антибиотические средства строго в той дозировке и длительности, что была предписана врачом. Меньшая доза и срок могут привести к тому, что бактерии приобретут устойчивость и выживут, поэтому необходимо пропить курс целиком, даже если пациенту кажется, что он уже здоров.
Диета во время и после курса лечения – важная часть сохранения микрофлоры. После антибиотиков для восстановления работы печени и кишечника хорошо употреблять в пищу кисломолочные продукты, каши (особенно овсяную), хлеб с содержанием муки грубого помола и добавлением отрубей, фрукты и овощи, много зелени, орехи.
Для устранения таких симптомов, как метеоризм, диарея, запоры, выпивайте в день несколько стаканов кефира, или хотя бы один стакан на ночь. Для тех людей, которые не переносят вкус кефира, есть альтернатива – ряженка, закваска, питьевые йогурты с более мягким вкусом.
Очищение после антибиотиков
Первый этап восстановления после завершения лечения антибиотическими средствами – детоксикация. На этом этапе из организма нужно вывести все шлаки и токсины, а также остаточные следы препарата. Как очистить организм после приема антибиотиков? Для этого существует несколько основных приемов, которые можно как комбинировать, так и выбрать один понравившийся.
Главный помощник в детоксикации – активированный уголь. Есть и другие препараты для выведения токсинов, но они нужны скорее для случаев отравления.
Лучше и дешевле для реабилитации в домашних условиях, чем активированный уголь, не справится ни одно другое лекарство. Принцип действия угля состоит в абсорбции шлаков, связывании токсичных веществ до безвредных комплексов и выведении их из организма.
Это средство можно пить после антибиотиков и детям, и взрослым – активированный уголь абсолютно безвреден.
Итак, чем почистить организм мы выяснили, но сколько надо лечиться углем? И какое лекарство может его заменить? Тут все индивидуально.
Средний срок детоксикации активированным углем составляет около 3 дней, при склонности к запорам лучше ограничиться 1 днем и повторять прием угля после нормализации стула.
Заменить черный уголь можно белым активированным углем или любым абсорбирующим препаратом, соблюдая рекомендованную для него дозировку.
Другой вариант – выпивать каждое утро натощак стакан теплой кипяченой воды.
Это правило можно совмещать с приемом активированного угля и можно применять не только в качестве восстановления после лечения. Такую привычку можно взять на вооружение хоть на каждый день.
Однако людям с больными почками следует отнестись к этому правилу с осторожностью и сначала проконсультироваться у лечащего врача.
В обычной жизни мы не замечаем, что пьем недостаточно чистой воды, заменяя ее соками, кофе, другими жидкостями.
Отмечено, что тело тех людей, которые регулярно пьют 1,5 – 2 л воды в сутки, более гармонично распределяет жировую ткань и накапливает меньше токсинов. Обязательно пейте чистую воду по утрам, и до полутора литров в течение дня.
Такой режим помогает устранить кишечное расстройство, метеоризм, проблемы со стулом. Восстанавливаются функции кишечника.
Усиление иммунитета после антибиотиков
Мы выяснили, как очистить организм после антибиотиков. Следующий шаг – восстанавливаем нормальный иммунитет и повышаем выносливость организма.
Можно пить после приема антибиотиков специальные препараты, содержащие антиоксиданты, а можно попить натуральные средства, которые воздействуют точно так же.
Итак, что нужно употреблять после антибиотиков как восстановить организм? Для этого нужно добавить на свой стол сухофрукты (особенно чернослив и курагу), орехи (фундук и миндаль являются природными средствами для улучшения иммунитета), зелень (особенно петрушку), натуральный какао.
Для многих пациентов важен вопрос – что пить во время курса восстановления, кроме кефира и воды? Количество употребляемой жидкости можно дополнить натуральными отварами трав – например, отваром листьев крапивы.
Можно употреблять и другие травы – например, желудочно-кишечный сбор, листья липы и другие. Нежелательно употреблять кофе и крепкий чай, т.к. они могут утомлять ослабленный организм и быстро обезвоживают его.
С нормализацией перистальтики желудка в рацион можно вводить больше белковых продуктов – нежирное мясо и рыбу, яйца. Нежелательно на первых этапах выздоровления перегружать организм тяжелой, обильно приправленной и жареной пищей. Отдавайте предпочтение мясу птицы и рыбе, приготовленным на пару или отваренным. Не стоит увлекаться и употреблением сладостей и сдобы.
Что пропить для дополнительного усиления организма, должен решать врач. Иногда случается так, что даже безобидные на первый взгляд мультивитаминные комплексы могут навредить здоровью, т.к. на фоне дисбаланса в организме они действуют неадекватно. Так что после принятия курса антибиотиков, наравне с тем, как лечить болезнь, врач должен подсказывать, какие меры принимать для его реабилитации.
Специальные добавки
Несмотря на то, что употребление специальных препаратов вроде «Хилак Форте» или «Панкреатин» выглядит очевидным в вопросе восстановления после курса лечения, это не совсем верное решение.
Во-первых, это дорогие препараты, без которых человек вполне может обойтись, прибегнув к правилам здорового питания и банально введя в свой рацион кисломолочные продукты.
Во-вторых, препараты для печени не являются профилактическими и предназначены для лечения нарушений этого органа, здоровым людям незачем их принимать. Наконец, в-третьих, эффективность различных про- и эубиотиков до сих пор не доказана клинически.
Решение о том, принимать ли ему тот или иной препарат для восстановления микрофлоры или функций печени, должен принимать врач. В праве пациента остается воспользоваться доступными ему средствами информации для выяснения эффективности того или иного назначенного препарата.
Здоровый образ жизни
Несмотря на банальность этого пункта, соблюдение правил здорового образа жизни непосредственно сказывается на вреде антибиотиков. Во-первых, умеренная физическая нагрузка до приема курса препарата снижает риск возникновения побочных эффектов, т.к. организм при регулярных занятиях физической культурой становится более выносливым и менее подверженным токсическому влиянию.
Во-вторых, лечебная гимнастика после (не во время!) болезни способствует скорейшему восстановлению перистальтики кишечника, снабжению тканей кислородом, а значит и детоксикации организма.
Следующий пункт – это правильное питание и отсутствие вредных привычек. Это одни из важнейших факторов, которые влияют на здоровье печени.
Именно на печень приходится главный удар антибиотиков, и из-за слабости печени возникает большинство токсических эффектов.
Гепатоциты (клетки печени) имеют свойство восстанавливать свои функции, и гораздо быстрее этот процесс происходит у тех людей, которые следят за своим здоровьем.
Еще один важный момент, о котором многие забывают, когда речь заходит о здоровом образе жизни.
Своевременная диагностика и выполнение врачебных предписаний – это те условия, при которых лечение протекает максимально быстро, эффективно и без мучительных последствий для пациента.
Поэтому ни в коем случае не занимайтесь самодиагностикой, самолечением и не принимайте антибиотики без предписаний врача.
Заключение
Подведем итоги тем правилам, которые помогут сохранить здоровье кишечника и получить минимальные побочные эффекты при приеме антибиотиков.
- Следить за здоровьем нужно постоянно. Чем здоровее человек до приема антибиотиков – тем меньше вероятность того, что они дадут токсический эффект, и тем быстрее пациент оправится от болезни.
- Доверяйте медицине. Обращаться к врачам за помощью нужно своевременно, пить лекарства только по назначению врача, а в период восстановления соблюдать врачебные предписания.
- Не всем нужны препараты для восстановления после антибиотиков. Этот пункт близок к предыдущему – доверяйте рекомендациям врача, интересуйтесь у них состоянием своего организма и необходимостью дополнительных мероприятий.
- Пейте больше жидкости и очищайте организм от шлаков. Наш организм – это самовосстанавливающаяся система, которая в состоянии исправить практически любые возникающие в ней сбои. Нужно только немного ей помочь и вывести токсичные вещества.
- Употребляйте в пищу продукты, которые улучшают работу кишечника и содержат антиоксиданты. В период восстановления после болезни не нагружайте организм тяжелой и вредной пищей.
- Не лечите то, что не болит. Не поддавайтесь на рекламные уловки покупать препарат для улучшения работы печени, если врачи не выявили нарушений ее работы. Стандартный курс антибиотиков во время работы не способен разрушить клетки печени.
И, наконец, будьте здоровы и счастливы!
Источник: https://proantibiotik.ru/vzroslym/vosstanovlenie-posle-antibiotikov
Энтерожермина® Форте
КУПИТЬ
УТВЕРЖДЕНА
Приказом Председателя
Комитета Фармации
Министерства здравоохранения
Республики Казахстан
от «28» июня 2018 г.
№ N015703
Инструкция по медицинскому применению
лекарственного средства
ЭНТЕРОЖЕРМИНА® ФОРТЕ
Торговое название
Энтерожермина® Форте
Международное непатентованное название
Нет
Лекарственная форма
Суспензия для перорального применения 4 миллиарда/5 мл
Состав
5 мл суспензии содержит
активное вещество — споры Bacillus clausii, полирезистентного к различным химиотерапевтическим препаратам и антибиотикам — 4 миллиарда спор, вспомогательное вещество — вода очищенная.
Описание
Беловатая опалесцирующая жидкость
Фармакотерапевтическая группа
Пищеварительный тракт и обмен веществ. Противодиарейные, кишечные противовоспалительные/противомикробные препараты. Антидиарейные микроорганизмы.
Код АТХ А07FА
Фармакологические свойства
Фармакокинетика
Поскольку активным веществом препарата Энтерожермина® Форте являются споры бактерий, локализованные и действующие исключительно в просвете желудочно-кишечного тракта, фармакокинетические исследования не проводились.
Фармакодинамика
Энтерожермина® Форте является препаратом, состоящим из спор Bacillus clausii – обычного обитателя кишечника, не оказывающего патогенного действия.
При пероральном приеме споры Bacillus clausii, благодаря своей высокой устойчивости к химическим и физическим веществам, проходят через барьер желудочного сока и в неповрежденном состоянии достигают кишечного тракта, где они преобразуются в метаболически активные вегетативные клетки. Bacillus clausii способен вырабатывать различные витамины, в частности, витамины группы B, вследствие чего препарат может применяться при авитаминозах вследствие антибиотикотерапии или химиотерапии. Благодаря действию Bacillus clausii, применение Энтерожермина® Форте способствует восстановлению кишечной микрофлоры, измененной в результате нарушения микробной флоры различного происхождения.
Энтерожермина® Форте позволяет достичь неспецифического антигенного и антитоксического эффекта, связанного с метаболическим действием B.Clausii. Кроме того, Bacillus clausii обладает в высокой степени гетерогенной устойчивостью к антибиотикам (вызванной искусственно), которая обеспечивает терапевтическую основу для предупреждения изменения кишечной микрофлоры после воздействия антибиотиков, особенно антибиотиков широкого спектра действия, или для восстановления баланса кишечной микрофлоры.
В связи с данной устойчивостью к антибиотикам препарат Энтерожермина® Форте можно применять в промежутке между двумя дозами антибиотиков.
Препарат обладает устойчивостью в отношении пенициллинов (если не в комбинации с ингибиторами бета-лактамазами), цефалоспоринов (частичная устойчивость в большинстве случае), тетрациклинов, макролидов, аминогликозидов (за исключением гентамицина и амикацина), новобиоцина, хлорамфеникола, тиамфеникола, линкомицина, клиндамицина, изониазида, циклосерина, рифампицина, новобиоцина, налидиксовой кислоты и пипемидовой кислоты (промежуточная устойчивость) и метронидазола.
Показания к применению
- лечение и профилактика нарушений микрофлоры кишечника и последующего эндогенного дисвитаминоза
- вспомогательная терапия для восстановления микрофлоры кишечника, измененной в результате лечения антибиотиками или химиотерапии
- острые или хронические желудочно-кишечные расстройства у детей, включая грудной возраст, вызванные кишечным дисбактериозом (дисмикробиозом) и дисвитаминозом
Способ применения и дозы
Взрослым: 1 флакон в день.
Детям, включая грудной возраст с 4 недель жизни: 1 флакон в день.
Содержимое флакона принимают без разведения или разводят в воде или других напитках (например, в молоке, чае, апельсиновом соке).
Этот препарат предназначен только для приема внутрь. Не вводить парентерально и не применять другим способом! Лекарственное средство должно быть использовано сразу во избежание загрязнения суспензии.
Продолжительность лечения определяется индивидуально врачом. Рекомендована следующая продолжительность лечения в зависимости от показания к применению:
- лечение нарушенной микрофлоры кишечника и последующего эндогенного дисвитаминоза (вследствие нарушения всасывания и усвоения витаминов в кишечнике): при острой диарее 5-7 дней, при хронической диарее до 30 дней;
- профилактика нарушений микрофлоры кишечника и последующего эндогенного дисвитаминоза во время антибактериальной терапии: во время лечения антибиотиками и до 1 недели после окончания лечения антибиотиками
- вспомогательное лечение для восстановления микрофлоры кишечника, изменившейся во время лечения антибиотиками или химиотерапии: во время лечения антибиотиками и до 1 недели после окончания лечения антибиотиками;
- лечение острых желудочно-кишечные расстройств у взрослых и детей, включая грудной возраст, связанные с отравлением или вызванные кишечным дисбактериозом (дисмикробиозом) и дисвитаминозом: острая диарея 5-7 дней;
- лечение хронических желудочно-кишечных расстройств у взрослых и детей, включая грудной возраст, связанных с отравлением или вызванные кишечным дисбактериозом (дисмикробиозом) и дисвитаминозом: хроническая диарея до 30 дней.
Побочные действия
Частота неизвестна- реакции гиперчувствительности, включая сыпь, крапивницу и ангионевротический отек
Важно сообщать о подозреваемых побочных реакциях в пострегистрационный период применения лекарственного средства. Это позволяет вести непрерывный мониторинг соотношения польза/риск препарата. Специалисты в области здравоохранения обязаны сообщать о любых случаях подозреваемых побочных реакций через национальную систему отчетности.
Противопоказания
- повышенная чувствительность к активному веществу или компонентам препарата
Лекарственные взаимодействия
Не установлены
Особые указания
Возможно наличие видимых включений во флаконах препарата Энтерожермина® Форте, что обусловлено агрегатами спор Bacillus clausii, это не означает, что препарат претерпел изменения.
Необходимо встряхнуть флакон перед применением.
Данный препарат предназначен только для перорального приема.
Запрещен инъекционный или любой другой путь введения в связи с высоким риском тяжелых анафилактических реакций, таких как анафилактический шок.
Во время терапии антибиотиками препарат следует принимать между двумя последовательными приемами дозы антибиотика.
Беременность и период лактации
Приём данного лекарственного препарата НЕ ПРОТИВОПОКАЗАН во время беременности и в период лактации.
Особенности влияния лекарственного средства на способность управлять транспортным средством или потенциально опасными механизмами
Препарат не влияет на способность управлять транспортным средством или движущимися механизмами.
Передозировка
До настоящего момента не сообщалось о клинических проявлениях передозировки.
Форма выпуска и упаковка
По 5 мл препарата разливают в однодозовые флаконы полиэтиленовые. На флаконы наклеивают этикетки самоклеющиеся.
По 10 флаконов вместе с инструкцией по медицинскому применению на государственном и русском языках помещают в картонную пачку.
Условия хранения
Хранить при температуре не выше 30oС.
Хранить в недоступном для детей месте!
Срок хранения
2 года
Не применять по истечении срока годности.
Условия отпуска
Без рецепта
Производитель/ Владелец регистрационного удостоверения
Санофи С. П. А., Италия
VIALE EUROPA, 11 ORIGGIO (VA) ITALIA
Наименование, адрес и контактные данные (телефон, факс, электронная почта) организации на территории Республики Казахстан, принимающей претензии (предложения) по качеству лекарственных средств от потребителей
ТОО «Санофи-авентис Казахстан»
Республика Казахстан, 050013, Алматы, пр-т Назарбаева 187 «Б»
телефон: +7 (727) 244-50-96
факс: +7 (727) 258-25-96
e-mail: [email protected]
Наименование, адрес и контактные данные (телефон, факс, электронная почта) организации на территории Республики Казахстан, ответственной за пострегистрационное наблюдение за безопасностью лекарственного средства
ТОО «Санофи-авентис Казахстан»
Республика Казахстан, 050013, Алматы, пр-т Назарбаева 187 Б
телефон: +7(727) 244-50-96
факс: +7 (727) 258-25-96
e-mail: [email protected]
Перед применением ознакомьтесь с инструкцией по медицинскому применению. Самолечение может быть вредным для вашего здоровья.
Восстановление нормальной микрофлоры влагалища в многопрофильной клинике Синай
Как проводится восстановление микрофлоры влагалища
При снижении количества лактобактерий активизируется условно-патогенная микрофлора, которая присутствует в том числе и у здоровых женщин. Это гарднерелла, Candida, уреоплазма, энтерококки и стрептококки. Однако при росте численности они перестают быть безобидными и провоцируют воспалительные процессы, сопровождающиеся неприятной симптоматикой.
Классическая схема восстановления нормальной микрофлоры состоит из двух этапов. В первую очередь, необходимо остановить размножение патогенной микрофлоры. Для этого используются специальные антибактериальные препараты. Доктор назначает их, основываясь на результатах лабораторных исследований. Врач принимает во внимание в первую очередь чувствительность микробов к компонентам тех или иных лекарств. При наличии сразу нескольких возбудителей инфекций назначаются препараты широкого спектра действия.
Следующий этап — это восстановление количества лактобактерий. Препараты-пробиотики содержат в своем составе живые бифидобактерии. Это помогает восстановить равновесие микрофлоры влагалища и подавить активность патогенной микрофлоры.
Восстановление микрофлоры в клинике Синай
Медикаментозное восстановление нормальной микрофлоры влагалища — одно из приоритетных направлений работы нашей клиники. Мы назначаем современные, эффективные препараты, при помощи которых в короткие сроки удается первой-второй степени чистоты влагалища. По окончании курса лечения обязательно проводится контрольный осмотр и взятие мазка на флору.
Препараты для восстановления микрофлоры кишечника
В этих препаратах содержится более 86 видов полезных микроорганизмов
Поэтому симбиотический комплекс ЭМ-курунги создавался на основе пищевого продукта — бурятского кисло-молочного напитка «хурэнгэ». Почему был выбран именно этот напиток? Главным образом потому, что из всех известных нам восточных, среднеазиатских, кавказских, европейских напитков этот продукт наиболее устойчив — курунга и при комнатной температуре может храниться месяцами. Это означает, что в симбиозе курунги есть природой заложенные наиболее сложные механизмы саморегуляции. Только в такой симбиоз имело смысл дополнительно включать оригинальные комплексы серии ЭМ (эффективные микроорганизмы). Полученный в итоге препарат «ЭМ-курунга» содержит в себе многие виды пробиотиков, известных медицине. А их пробиотические свойства взаимно усилены настолько, что курунголечение может стать даже основным методом восстановления здоровья при самых разных заболеваниях.
Начнем с дисбактериоза, или, как принято теперь говорить, с дисбиоза. Надо признать, что дисбиозом в той или иной форме страдают все. Но практически никто всерьез не обращает внимания на эту проблему, неминуемо обрекая себя по этой причине на тяжелые заболевания в будущем. Ежедневный прием по 1-2 таблетки курунги надежно подавляет гнилостные процессы в кишечнике, что уже свидетельствует о восстановительной работе пищеварительной микрофлоры, а значит, попутно излечиваются гастриты, язвы, колиты, гепатиты, панкреатиты, холециститы и т. д. Уменьшается камнеобразование в желчном пузыре, почках, восстанавливаются все виды обмена. Нагрузка на поджелудочную железу, печень, почки уменьшается в десятки раз!
У нас появилась новая серия продуктов на основе кобыльего молока ЧИТАЙТЕ ЗДЕСЬВрачи сообщили, какие лекарства не стоит принимать при заболевании коронавирусом
Применение антибиотиков при коронавирусной инфекции не только не защитит от болезни, но и может привести к серьезным последствиям – проблемам с желудочно-кишечным трактом, спазмам бронхов и аритмии, уверены медики. Кроме того, организм, привыкая к данным препаратам, теряет иммунитет к инфекциям, из-за чего люди могут начать погибать даже от простых ОРВИ. Врачи рассказали, как восстановиться после приема антибактериальных средств и какие еще лекарства не стоит применять при COVID-19.
Применение антибиотиков при коронавирусной инфекции бесполезно и может принести организму немалый вред, заявил главный микробиолог и специалист по антимикробной резистентности Минздрава России, член-корреспондент РАН Роман Козлов.
«По данным ряда исследований, более 90% пациентов с COVID-19 в настоящее время получают антибиотики, в том числе комбинированную терапию и парентеральные препараты, не только в стационарах, но и в амбулаторных условиях. Вне всякого сомнения, сложившая ситуация будет иметь серьезные неблагоприятные последствия в будущем», — пояснил он.
По словам медика, необоснованная антибактериальная терапия может значительно ухудшить состояние пациента, а порой и привести к угрожающим жизни последствиям. «Поэтому не покупайте антимикробные препараты для системного применения в учреждениях аптечной сети самостоятельно, без рецепта врача», — подчеркнул Козлов.
Как объяснила «Газете.Ru» терапевт-пульмонолог Марина Казакова, COVID-19 – это вирусная инфекция, а не бактериальная, поэтому антибиотики для ее лечения бессильны. «Да, бывает, что бактериальная флора вторично присоединяется к заболеванию, но это бывает крайне редко. В противном случае антибиотик никак не поможет, а лишь создаст ложное чувство спокойствия», — отметила врач.
Главная опасность антибиотиков в том, что организм к ним быстро привыкает, убеждены медики.
«Антибактериальные препараты приводят к устойчивости организма, внутренние микроорганизмы перестают реагировать на средство, и в таком случае мы уже никогда не сможем вылечить болезнь»,
— подчеркнула в беседе с «Газетой.Ru» врач общей практики Анастасия Тараско.
С ней согласилась и Марина Казакова. «Когда бактерии разовьют устойчивость к препарату, вырастет монстр, которым люди обменяются, и на него уже ничего действовать не будет. Люди начнут умирать от банальных инфекций, как в доантибиотиковую эру. Надо помнить, что это коллективная ответственность», — предупредила она.
Заслуженный врач России, ведущий научный редактор Vrachu.ru Михаил Каган уточнил, что применение антибиотиков грозит такими последствиями, как тошнота, рвота, спазм бронхов и аритмия. Кроме того, данные препараты могут приводить к видоизменениям резистентных бактерий, которые сами способны вызвать отдельный инфекционный процесс.
Если же применения антибиотиков избежать не удалось, помочь организму восстановиться уже не получится – необходимо дождаться, когда он самостоятельно нормализует внутренние процессы. «К антибиотику становится устойчив не человек, а бактерия. И если бактерия уже приспособилась, то что бы вы ни предпринимали, это не поможет. Дайте время организму восстановиться самостоятельно», — заявила Казакова.
Необходимость применения пробиотиков для восстановления микрофлоры после антибиотиков — всего лишь миф, убежден главный терапевт клиники «Семейная» Александр Лаврищев. «Это легенда, которая продвигается по телевидению. А у аптекарей вообще план стоит, сколько пробиотиков продать. Есть инциденты, когда без рецепта антибиотики не продают, но если покупаешь курс пробиотика – можно купить и без рецепта», — рассказал медик «Газете.Ru».
Он объяснил, что бактерии, которые поступают вместе с пробиотиками, также гибнут при приеме антибиотиков. «Более того, у человека в кишечнике есть две микрофлоры — пристеночная и просветная, которая выходит в виде фекалий.
Старые исследователи пытались понять, что происходит с бактериями, анализируя состав только просветной микрофлоры, но сейчас уже ясно, что главную роль играет пристеночная», — уточнил Лаврищев.
И если просветная микрофлора при приеме антибиотиков погибает, то пристеночная сохраняется, и именно благодаря ей организм сам себя восстанавливает. «Никак не надо помогать. Разве что правильно питаться, высыпаться и не употреблять алкоголь в чудовищных количествах», — подчеркнул терапевт.
Он заключил, что если же при приеме антибиотиков возникли какие-то побочные заболевания, то самолечением заниматься не стоит – необходимо оперативно обратиться к врачу.
Между тем Марина Казакова добавила, что бесполезным при COVID-19 является и самостоятельный прием кроворазжижающих препаратов. «Их назначать должен только врач. Иначе можно умереть от тяжелого кровотечения быстрее, чем от коронавируса», — предупредила она.
Ранее заведующая психоневрологическим отделением поликлиники №4 управделами президента РФ Ирина Вереютина также заявляла о том, что никакой пользы при ковиде не принесут нестероидные противовоспалительные препараты (НПВС) – в частности, аспирин и анальгин.
«Пациентам с коронавирусной инфекцией необходимо использовать парацетамол», — отмечала она, подчеркнув, что применение аспирина и анальгина в данном случае «неприемлемо».
Так, аспирин, из-за содержания в нем ацетилсалициловой кислоты (вещество, оказывающее жаропонижающий эффект — «Газета.Ru»), на фоне инфекционных заболеваний может вызывать синдром Рея – опасное состояние, при котором возникает острая печеночная недостаточность и гипераммониемия (повышение концентрации аммиака в организме, способное вызвать кому и даже смерть — «Газета.Ru»).
Также ранее специалисты из клиники Майо США выяснили, что нестероидные противовоспалительные препараты могут привести к сердечному приступу или инсульту.
Американские ученые проанализировали данные 56 тыс. взрослых людей с повышенным артериальным давлением, на протяжении длительного времени принимавших НПВС. В результате наблюдения выяснилось, что у одного из 330 человек, употреблявших такие препараты, в течение четырех недель случался сердечный приступ или инсульт. Они также заметили, что самый высокий риск побочных реакций вызывает лекарство целекоксиб – инфаркт случался у 1 из 105 пациентов, принимавших данное средство.
Врач-кардиолог Юрий Кузьменков также ранее сообщал, что длительное применение НПВС может вызывать и развитие гастропатии – повреждения слизистой оболочки желудка и двенадцатиперстной кишки, приводящее к развитию эрозий и язв. Кроме того, по его словам, при гастропатиях часто встречаются различные диспепсические нарушения (расстройства пищеварения —«Газета.Ru»).
Автопробиотики как подход к восстановлению персонализированной микробиоты
Front Microbiol. 2018; 9: 1869.
, 1, 2, * , 1 , 1 , 2 , 1 , 2 , 2 , 1 , 1 , 1 , 3 , 2 и 1, 2Александр Суворов
1 Отделение молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
2 Отделение фундаментальных исследований Медицина и медицинские технологии, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Алена Карасева
1 Кафедра молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Марина Котылева
1 Кафедра кафедры молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Юлия Кондратенко
2 Кафедра фундаментальной медицины и медтехники ology, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Надежда Лавренова
1 Кафедра молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Антон Коробейников
2 Кафедра фундаментальной медицины и медицинские технологии, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Петр Козырев
2 Кафедра фундаментальной медицины и медицинских технологий, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Татьяна Крамская
1 Отделение молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Галина Леонтьева
1 Отделение молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Игорь Кудрявцев
1 Отделение молекулярной микробиологии, Институт кафедра экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
Даньян Гуо
3 Институт агропродовольственной науки и технологий, SAAS, Шаньдун, Китай
Алла Лапидус
2 Кафедра фундаментальной медицины и медицинских технологий, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Елена Ермоленко
1 Кафедра молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
2 Кафедра фундаментальной медицины и медицинских технологий, Санкт-Петербург Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
1 Кафедра молекулярной микробиологии, Институт экспериментальной медицины, Санкт-Петербург, Россия
2 Кафедра фундаментальной медицины и медицинских технологий, Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург Санкт-Петербург, Россия
3 Институт агропродовольственной науки и технологий hnology, SAAS, Шаньдун, Китай
Под редакцией: Надия В.Бойко, Ужгородский национальный университет, Украина
Рецензент: Томас Хертле, Национальный институт агрономических исследований (INRA), Франция; Хулио Вильена, Centro de Referencia para Lactobacilos, Аргентина
Эта статья была отправлена в Food Microbiology, раздел журнала Frontiers in Microbiology
Поступила в редакцию 30 октября 2017 г .; Принята в печать 25 июля 2018 г.
Copyright © 2018 Суворов, Карасева, Котылева, Кондратенко, Лавренова, Коробейников, Козырев, Крамская, Леонтьева, Кудрявцев, Го, Лапидус и Ермоленко.Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (CC BY). Использование, распространение или воспроизведение на других форумах разрешено при условии указания автора (авторов) и правообладателя (ов) и ссылки на оригинальную публикацию в этом журнале в соответствии с принятой академической практикой. Запрещается использование, распространение или воспроизведение без соблюдения этих условий.
Эта статья цитируется в других статьях в PMC.Abstract
Микробиота человека — это сложный консорциум микроорганизмов, участвующих в правильном функционировании почти каждой системы организма. Большинство заболеваний человека связаны с развитием дисбактериоза кишечника. Дисбиотическое состояние или дисбактериоз является ключевым патогенным состоянием, вызывающим многие тяжелые инфекционные или неинфекционные заболевания. Быстрое возвращение к исходной микробиоте во многих случаях приводит к быстрому выздоровлению от болезни. Однако оптимальный способ лечения дисбактериоза все еще обсуждается.Недавно мы разработали метод автопробиотики, основанный на использовании изолированных аборигенных бактерий для улучшения состояния микробиоты. Метод, основанный на кормлении пациентов бактериальными продуктами, выращенными из их личных, генетически охарактеризованных штаммов, успешно апробирован в клинике на пациентах с СРК или хронической пневмонией. В настоящем исследовании мы попытались оценить технологию с использованием автопробиотических бактерий, принадлежащих к разным видам, с использованием крысиной модели дисбиоза, индуцированного антибиотиками.Шесть экспериментальных групп животных после приема антибиотиков получали различные варианты аутопробиотиков (лактобациллы, бифидобактерии, энтерококки, их смеси, фекальная микробиота или анаэробно выращенный комплекс аборигенной микробиоты), приготовленные для каждой из них до развития дисбиоза. Судя по множеству параметров, включая метагеномический анализ микробиоты, иммунного статуса и содержания микробиоты животных с дисбактериозом относительно контрольной группы, наиболее выраженные положительные изменения были обеспечены автопробиотиками на основе энтерококков, бифидобактерий или консорциума аборигенных бактерий, выращенных в анаэробных условиях. .Эти группы автопробиотиков обеспечивали наиболее эффективное восстановление исходного содержания микробиоты и значительную противовоспалительную реакцию иммунной системы.
Ключевые слова: аутопробиотиков, микробиота, дисбиоз кишечника, противовоспалительное действие, микробиом
Введение
Микробиота человека представляет собой сложный консорциум, состоящий из множества видов бактерий, архей, вирусов, грибов и простейших (более 500 видов бактерий в только кишечник). Сейчас он рассматривается как дополнительный орган в организме человека (Суворов, 2013).Микробиота является важным фактором, влияющим почти на все функции организма при здоровье и болезнях. Применение технологии секвенирования следующего поколения (NGS) повысило интерес к роли микробиоты в здоровье и болезнях. Этот интерес быстро вырос с появлением нескольких международных научных инициатив, таких как проект NIH Human Microbiome Project (https://hmpdacc.org) и MetaHit Consortium (http://www.metahit.eu). Полное секвенирование геномов сотен бактериальных геномов из микробиоты человека и разработка новых биоинформатических анализов микробиома позволили сделать несколько важных научных открытий.Было установлено, что микробиота тканеспецифична и в то же время обладает особенностями, характерными для каждого человека (Qin et al., 2010). Кишечная микробиота, являющаяся наиболее многочисленным микробным сообществом в организме, очень индивидуальна, но обычно предпочитает ограниченное количество композиций, известных как энтеротипы (Arumugam et al., 2011).
Еще одно важное открытие связано с установлением врожденной иммунной системы. Недавно было установлено, что микробный состав кишечника претерпевает наиболее значительные изменения в течение первых 3 лет жизни.Это позволяет установить иммунную толерантность к местной микробиоте и дифференцировать автохтонную (личную) микробиоту от аллохтонных (чужеродных) бактерий, грибов и вирусов (Wopereis et al., 2014). Эти открытия позволили лучше понять корни многочисленных заболеваний, связанных с дисбактериозом, включая воспалительные заболевания кишечника, рассеянный склероз, диабет (типы 1 и 2), атопию, астму, аутизм и рак (Lloyd-Price et al., 2016) . В большинстве случаев исход лечения многих инфекционных или неинфекционных заболеваний связан с восстановлением состава микробиоты до исходного здорового состояния.Этот факт повлиял на многочисленные исследования эффектов бактериальной терапии, включая пробиотики или трансплантацию фекальной микробиоты (FMT), когда микробиота пересаживается от здорового донора (Vuotto et al., 2014; Gupta et al., 2016). Основным ограничением этих подходов является то, что микробы, полученные экзогенно, могут быть чужеродными для иммунной системы реципиента. Другой подход к лечению дисбактериоза основан на использовании аутопробиотиков. Автопробиотики основаны на другой стратегии микробной терапии.Он включает культивирование in vitro, индивидуальных штаммов микробиоты и приготовление персонализированной пищи или лекарства для использования в восстановлении микробиома (Суворов, 2013). Общая цель настоящей работы — оценить терапевтический потенциал различных бактериальных вариантов автопробиотиков, используя экспериментальную модель антибиотико-индуцированного дисбиоза с последующим метагеномным и иммунологическим анализом.
Материалы и методы
Животные
Самцы крыс линии Вистар (200–250 г, возраст 6–7 недель) были получены из Центра разведения животных, Рапполово, Россия.Крыс содержали в отдельных клетках в постоянных условиях при комнатной температуре (18–22 ° C), при 12-часовом цикле свет / темнота, с уровнем шума не более 85 дБ, при влажности 50–60% и обеспечивали свободный доступ. на воду и стандартные гранулы для крыс (полнорационные комбикорма для лабораторных крыс и мышей ПК-120 ш. 1492, ГОСТ Р 50258-92 в гранулах диаметром 14 мм, Россия). Это исследование было проведено в строгом соответствии с необходимыми этическими требованиями и в соответствии с принципами гуманности (Европейского сообщества № 86/609 ЕС).Исследование одобрено локальным этическим комитетом ФГБУН «ИЭМ».
План эксперимента
Крысы были разделены на шесть экспериментальных и две контрольные группы по 8 животных в каждой. Все экспериментальные (LB, BI, EN, MIX, AN и FE) и контрольные группы, обозначенные как 3AB, получали лечение антибиотиками в течение 3 дней в соответствии с ранее опубликованным протоколом (Ermolenko et al., 2013). За некоторыми животными из группы 3AB наблюдали в течение дополнительных 5 дней после сбора фекальной микробиоты.Эти животные были сгруппированы как 8AB. После приема антибиотиков в течение 3 дней крыс из шести экспериментальных групп кормили различными препаратами автопробиотиков — лактобациллами, бифидобактериями, энтерококками, смесью трех штаммов, анаэробно выращенной микробиотой фекалий или местными фекалиями, предварительно приготовленными из их собственных образцов фекалий. Вторая контрольная группа (В) получала воду вместо антибиотиков и PBS вместо автопробиотиков (таблица).
Таблица 1
Экспериментальные группы | Лечение (1–3 дня) | Лечение (4–8 дней) | Собранные образцы | Дистиллированная вода | PBS | Образцы фекалий — для исследования микробиоты. На 9-й день — образцы крови и биопсия селезенки для иммунологического анализа. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3AB | Ампициллин + метронидазол | — | Образцы фекалий — для исследования микробиоты. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8AB | Ампициллин + метронидазол | PBS | Образцы фекалий — для исследования микробиоты. На 9-й день — образцы крови и биопсия селезенки для иммунологического анализа. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BI | Ампициллин + метронидазол | Bifidobacterium spp. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EN | Ампициллин + метронидазол | Enterococcus faecium | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LB | Ампактициллин + метронидазол | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MIX | Ампициллин + метронидазол | Смесь Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp. и Enterococcus faecium штаммы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AN | Ампициллин + метронидазол | Анаэробный консорциум | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Коренные штаммы | Аунициллин | Аунициллин | Аувициллин | Metronidoc5 , лактобациллы или бифидобактерии выделяли из фекалий крыс до лечения животных антибиотиками и выращивали отдельно.Анализ образцов стула и идентификация отдельных клонов бактерий ( Enterococcus spp., Lactobacillus spp. Или Bifidobacterium spp.) Проводились с использованием селективных сред или с помощью ПЦР. Генетическая характеристика штаммов LAB (энтерококков или лактобацилл), используемых в исследовании, была проведена с использованием количественной ПЦР (кПЦР) с видоспецифичными праймерами и праймерами для идентификации генов, связанных с вирулентностью (Таблица S1). Enterococcus faecium был единственным автопробиотиком энтерококка, выбранным с помощью генетического анализа.Энтерококки были протестированы на наличие генов, связанных с вирулентностью (Таблица S1), и штаммы, несущие эти маркеры, были исключены из исследования. Аборигенные штаммы лактобацилл, бифидобактерий и энтерококков были включены в соответствующую группу автопробиотиков (LB, BI и EN) и выращены в бульоне MRS (HiMedia, Индия), бульоне Blaurock (питательная среда, Россия) и бульоне Brain Heart Infusion Broth. (Gibco Diagnostics, США) соответственно. Затем их собирали центрифугированием при 3000 g в течение 10 м, промывали три раза стерильным фосфатным буферным солевым раствором (PBS-8.00 г / л NaCl, 0,20 г / л KCl, 1,44 г / л Na 2 HPO 4 , 0,24 г / л KH 2 PO 4 , pH 7,4, pH 7,2), суспендированные в стерильном PBS с сахарозу (20%) и желатин (10%) в концентрации 5,5 × 10 8 КОЕ / мл и хранили при -20 ° C до использования. Группа MIX получала смесь выбранных аборигенных энтерококков, лактобацилл и бифидобактерий в равных количествах в концентрации 5,5 × 10 8 КОЕ / мл. Бактерии из группы AN были получены путем анаэробного выращивания сложного сообщества фекальных бактерий, первоначально взятых от каждой отдельной крысы и скармливаемых одному и тому же животному.Для этого фекалии крыс разводили в PBS и культивировали анаэробно в тиогликолятном бульоне (HiMedia, Индия) с 10% стерильным фекальным экстрактом в течение 72 ч. Группа FE получила собственные фекалии, разведенные в PBS. (Экспериментальные группы перечислены в таблице). Изучение микробиоты и иммунологический анализОбразцы фекалий были собраны на 4-й и 9-й день и проанализированы с помощью метагеномного анализа на основе кПЦР и гена 16S рРНК. На 9-й день брали образцы крови и биопсию селезенки для иммунологических исследований. ДНКиз фекалий выделяли с использованием мини-набора QIAamp DNA Stool Mini (Qiagen) в соответствии с протоколом производителя. Образцы инкубировали в буфере для лизиса при 90 ° C в течение 10 м для оптимального лизиса бактерий. Для секвенирования микробиома библиотеки ДНК были подготовлены с использованием набора для подготовки образцов Illumina Nextera с праймерами ДНК, соответствующими участкам V3 – V4 гена 16S рРНК, перечисленным в таблице S1. Illumina MiSeq использовался для секвенирования библиотек. Секвенирование проводили в Ресурсном центре СПбГУ «Биобанк». OTU generationFastqc (http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc) использовался для оценки качества необработанных чтений. CD-HIT-OTU-Miseq (Li and Chang, 2017) использовался для поиска OTU. CD-HIT-OTU-Miseq позволяет извлекать OTU из парных операций чтения без объединения парных последовательностей. Это было достигнуто путем сопоставления результатов кластеризации для чтений R1 и R2. CD-HIT-OTU-Miseq может использовать только высококачественные области чтения для кластеризации. Кластеризация проводилась с использованием следующих параметров — длины высококачественных областей чтения R1 и R2 200 и 180 п.н. соответственно, 97% сходства чтения для отсечки кластеризации и 0.00001 для ограничения изобилия. OTU были аннотированы с использованием базы данных Greengenes версии 13.5 (DeSantis et al., 2006). Анализ разнообразия микробиомаOTU, присутствующие менее чем в 5% образцов, были отброшены для фильтрации шума. R-пакет phyloseq (McMurdie and Holmes, 2013) использовался для построения графиков численности филумов. Функция R prcomp () использовалась для анализа главных компонент (PCA). Векторы для PCA соответствовали содержанию OTU, отфильтрованному на шум и нормализованному по относительному содержанию.Пороговое значение фильтрации шума было увеличено для PCA, чтобы исключить OTU, присутствующие менее чем в 25% образцов. Это было сделано для увеличения процента дисперсии, объясняемой 1-й и 2-й главными компонентами, и для получения более представительного 2D-изображения. Анализ qPCR для выявления бактерий в толстой кишке проводили с использованием набора Colonoflor (ExPlana, Россия) на приборе RT-PCR Mini-Opticon, BioRad. Данные RT-qPCR для некоторых видов бактерий были подтверждены классическим бактериологическим исследованием. Определение цитокинов в сыворотке кровиУровни MCP-1, IL-10 и TGF-β в сыворотке крови оценивали с помощью ELISA с наборами Bender MedSystems (eBioscience, США) в соответствии с инструкциями производителя.Все образцы были протестированы в двух экземплярах и прочитаны в iMark, BioRad, США. Проточная цитометрияФенотип клеток крови и селезенки определяли на 9 день с помощью анализа проточной цитометрии, следуя стандартным процедурам окрашивания антител. Клетки окрашивали комбинацией следующих антител: CD3, CD4, CD8, CD161, CD25, FOXP3 и CD45RA. Клетки окрашивали тремя различными комбинациями флуоресцентно меченных ДНК-моноклональных антител. Все антитела были получены от BioLegend и использовались в соответствии с инструкциями производителя.Первые две комбинации антител использовали для окрашивания клеточной поверхности, третья — для окрашивания клеточной поверхности и внутриклеточного окрашивания. Первая комбинация состояла из FITC-конъюгированных мышиных анти-крысиных CD3 (клон 1F4), PE-конъюгированных мышиных анти-крысиных CD8a (клон OX-8), PE / Cy7-конъюгированных мышиных анти-крысиных анти-CD4 (W3 / 25) и APC-конъюгированные мышиные антитела против CD161 крысы (клон 3.2.3, который распознал общий эпитоп NKR-1P1a (CD161a) и NKR-P1b (CD161b). Вторая комбинация состояла из конъюгированных с FITC мышиных анти- крысиные анти-CD3 и PE-конъюгированные мышиные анти-CD45RA крысы (клон OX-33).Смеси антител добавляли к 50 мкл цельной крови крысы с антикоагулянтом K3-EDTA, осторожно перемешивали и инкубировали в течение 15 м при комнатной температуре в темноте. Затем добавляли 250 мкл лизирующего раствора OptiLyse C (Beckman Coulter), перемешивали и инкубировали в течение 10 м при комнатной температуре в темноте. После инкубации добавляли 250 мкл PBS. Через 10 мин образцы промывали два раза промывочным буфером (PBS, содержащий 2% FCS (Sigma Aldrich) и анализировали проточной цитометрией. Третья комбинация состояла из двух антител для окрашивания клеточной поверхности — FITC — конъюгированных мышиных антибиотиков. -крысиные анти-CD25 (клон OX-33) и PE-Cy7 / конъюгированные мышиные анти-крысиные CD4 (клон W3 / 25), а также PE-конъюгированные мышиные антимышиные / крысиные / человеческие FOXP3 (150 d клон) для внутриклеточное окрашивание.Внутриклеточное окрашивание проводили с использованием набора буферов FOXP3 Fix / Perm (BioLegend). Все образцы анализировали с помощью проточного цитометра Navios ™ (Beckman Coulter), оборудованного двумя диодными лазерами (488 и 635 нм). Данные анализировали с помощью программного обеспечения Navios Software v.1.2 и Kaluza ™ v.1.2 (Beckman Coulter). Статистический анализСтатистический анализ проводился с использованием пакета программ Statistica 8.0. (StatSoft, США). Различия между группами сравнивали с помощью ANOVA и тестов Краскела – Уоллиса. P ≤ 0,05 считалось значимым. РезультатыМетагеномный анализДля характеристики состава микробиома считывания были сгруппированы с порогом 97%. Виды микробов, соответствующие кластерам последовательностей 16S рРНК, были идентифицированы на основе результатов предыдущих исследований (Li and Chang, 2017). Одновременная кластеризация прочтений всех проанализированных выборок дала 7782 OTU. Большинство OTU присутствовали как в небольшом количестве образцов, так и в низких абсолютных количествах, что является общей чертой образцов микробиома кишечника (Quince et al., 2009). OTU, присутствующие менее чем в 5% выборок, были отброшены для фильтрации шума. Большинство низко-распространенных OTU не соответствовали никаким последовательностям из базы данных Greengenes 13.5. Количество аннотированных OTU составило 534 с 22,4% неклассифицированных чтений. Было замечено, что все группы, кроме 3ab, которые состояли преимущественно из протеобактерий, характеризовались значительной степенью бактериальной гетерогенности. Это продемонстрировало положительный эффект автопробиотиков на микробиом, делая его похожим на контрольную группу C (рисунок).Высокое количество протеобактерий в группе 3AB было связано с действием коктейля антибиотиков. Бактериальный состав группы 8AB, которая получала только PBS без аутопробиотиков в течение 5 дней после антибиотиков, стал более разнообразным по сравнению с 3AB, но все еще оставался богатым протеобактериями. Обобщенные и статистически оцененные результаты анализа данных метагенома на уровне филума представлены в таблице. Сходные результаты были получены после метагеномного анализа на уровне класса или семьи (рисунки S1, S2 и таблицы S2, S3). Таксономическое распределение (уровень филума) кишечной микробиоты в различных группах крыс. Подсчеты OTU, соответствующие различным группам, были суммированы, и относительные доли обнаруженных типов были нанесены на график. Таблица 2Результаты сравнения представителей кишечной микробиоты в экспериментальных группах с контрольной группой C (уровень Phylum).
Анализ главных компонентов (PCA) двух групп. (A) PCA представление контрольных групп и группы BI. (B) PCA — представление контрольных групп и группы EN. Анализ данных метагенома выявил значительные различия в составе микробиома в «нормальном» состоянии контрольных животных, что можно было увидеть по широкому распределению точек в PCA. Точки, представляющие микробиом после лечения антибиотиками (3AB), сформировали более компактную группу, чем точки, представляющие нормальные состояния микробиома (контрольная группа, которая получала физиологический раствор в течение всех 8 дней эксперимента).Это показало, что нормальный микробиом животных без лечения антибиотиками был более разнообразным, чем микробиом животных после дисбактериоза, вызванного антибиотиками. «Нормальные» и «дисбактериальные» группы были наиболее удаленными, и все автопробиотики смещали состояние микробиома от «дисбактериоза» ближе к контрольной группе. Группа естественного восстановления (8AB) также двигалась к восстановлению микробиома, хотя и менее очевидна по сравнению с группами автопробиотиков. PCA, представляющий микробиомы, полученные из групп, имеющих другие автопробиотики, также следовали той же тенденции.Результаты, полученные с использованием других типов автопробиотиков, были аналогичными, но менее очевидными (Рисунок S3). Анализ микробиоты методом КПЦР показал, что лечение антибиотиками избирательно истощило большинство маркерных бактерий в кишечнике. Мы также отслеживали значительный рост грамотрицательных условно-патогенных бактерий, включая Proteus vulgaris, Klebsiella, Enterobacter и E. coli (рисунок). Введение автопробиотиков вызвало значительную степень восстановления микробиоты.Однако полной реституции добиться не удалось ни в одной группе. Среди используемых автопробиотиков аутобифидобактерии (BI) и анаэробная смесь (AN) обеспечили наибольшее увеличение содержания F. prausnitzii (рисунок). Общие результаты анализа КПЦР приведены в таблице. Содержание бактерий в образцах фекалий крыс разных групп. Популяция различных бактерий в опытных группах относительно контрольной группы C. * p <0.05. Таблица 3Содержание бактерий в различных экспериментальных группах по сравнению с контрольной группой C.
Концентрация ИЛ-10 в сыворотке крови в опытных группах по сравнению с контрольной группой C. * p <0,05. ОбсуждениеХорошо известно, что здоровье человека зависит от состояния микробиоты и что с дисбактериозом связаны многочисленные заболевания.Также хорошо известно, что различные антибиотики или коктейли с антибиотиками могут значительно снизить численность бактерий и изменить состав микробиоты (Morgun et al., 2015). Однако, несмотря на множество экспериментальных исследований, в которых антибиотики являются основной причиной дисбактериоза, очень мало известно об эффективных стратегиях восстановления микробиоты. Бактериальная терапия с использованием пробиотиков или трансплантации фекалий имеет очевидный недостаток из-за чужеродной природы микроорганизмов, введенных в организм хозяина.Российский микробиолог Борис Шендеров первым начал использовать местные бактерии для лечения дисбактериоза. Он разработал и запатентовал подход, основанный на личных лактобациллах и бифидобактериях, для восстановления микробиоты (Шендеров и Манвелова, 1999). Недавно мы продемонстрировали другую стратегию лечения дисбактериоза с использованием генетически протестированных бактерий, полученных от пациентов, выращенных в лабораторных условиях и предоставленных пациентам в виде кисломолочных продуктов. Индивидуально подобранные и культивируемые пробиотические штаммы лактобацилл или энтерококков были успешно протестированы в клинике на пациентах с синдромом раздраженного кишечника (СРК) и пневмонией (Суворов, 2013).Автопробиотические молочные ферментированные бактериальные продукты на основе энтерококков или лактобацилл были способны восстанавливать микробиоту в различных клинических условиях, включая заболевания раздраженного кишечника (ВЗК) и язвенный колит (ЯК) (Суворов и др., 2011; Соловьева и др., 2017). Это лечение также было эффективным в восстановлении микробиоты у космонавтов (Ильин и др., 2013). В этом исследовании побочных эффектов не наблюдалось. В настоящем исследовании мы рассмотрели вопрос о выборе оптимального штамма автопробиотиков или лучшей бактериальной композиции автопробиотиков.В экспериментах, проведенных на модели дисбактериоза на крысах, мы тестировали различных представителей бактерий, выращенных из одного выбранного клона аборигенных бифидобактерий, лактобактерий или энтерококков, выделенных из фекалий одного и того же животного. Вместе с моноштаммовыми автопробиотиками мы протестировали три варианта бактериальных композиций (фекальная биомасса, анаэробно выращенная индивидуальная микробиота и смесь трех различных штаммов автопробиотиков). Введение антибиотиков (ампициллин и метронидазол) привело к снижению численности и богатства микробиоты.У 90% экспериментальных крыс в кишечнике преобладали гамма-протеобактерии. Естественное восстановление после лечения антибиотиками только физиологическим раствором в течение 5 дней (группа 8AB) показало положительную динамику, хотя состав микробиома не изменился так существенно, как в группах, получавших автопробиотики. Микробиомный анализ кала, полученного от животных без обработки автопробиотиками, выявил значительную степень вариабельности микробиома. Однако они всегда находились далеко от контрольных животных, которые не получали антибиотики.Интересно, что бактериальный состав в микробиоме групп, получавших автопробиотики, был одинаковым независимо от введенных автопробиотиков. Данные, полученные с помощью кПЦР, выявили значительное увеличение количества протеобактерий, таких как Proteus spp., Klebsiella spp., E. coli и Enterobacter spp. вместе с резким снижением количества F. prausnitzii, Enterococcus spp. и Bacteroides spp.после лечения антибиотиками (таблица). Эти негативные тенденции в составе микробиоты обычно отражают воспаление в кишечнике. Прием автопробиотиков снял воспаление. Различные виды автопробиотиков изменяли бактериальный состав микробиоты в зависимости от индивидуальных особенностей каждого животного и типа используемого автопробиотического препарата. Однако можно было определить разные тенденции среди групп. Например, автопробиотики на основе бифидобактерий или микробиоты, выращенной в анаэробных условиях, смогли уменьшить количество протеобактерий, представленных Proteus spp.В то же время автопробиотические бифидобактерии обладали очень низкой антагонистической активностью в отношении Klebsiella spp. в отличие от других автопробиотиков, таких как местные энтерококки. Сравнение микробиоты показало, что лечение мультиштаммовыми препаратами не имело преимущества перед моноштаммовыми автопробиотиками. Это соответствовало предыдущему исследованию с использованием репараций на основе аутоэнтерококковых штаммов в клинике. Состав микробиоты животных, получавших препараты аборигенных энтерококков и бифидобактерий, был наиболее близок к контрольной микробиоте.Другой группой, которая обеспечила быстрое восстановление, была группа AN, которая получала смесь бактерий, выращенных в анаэробных условиях. Иммунологические изменения в крови животных, получавших антибиотики, характеризовались провоспалительными тенденциями, типичными для дисбиотических состояний. Все автопробиотики в определенной степени улучшали иммунологические параметры. Но между группами были существенные различия. Иммунологическое исследование было сосредоточено на основных иммунологически установленных ориентирах, представляющих состояние воспаления слизистой оболочки кишечника — маркерах Т-клеток, таких как FoxP3 + CD 25 в селезенке и крови, B, NKT-клетках и содержании регуляторных цитокинов IL-10 в крови.Известно, что эти иммунологические параметры претерпевают значительные изменения как в клинических случаях воспалительных заболеваний кишечника, так и в экспериментальных моделях воспаления, вызванного антибиотиками (Olszak et al., 2014; Zeissig and Blumberg, 2014). Эти иммунологические эффекты после приема антибиотиков коррелировали с уменьшением присутствия основного продуцента бутирата F. prausnitzii , что могло отражать уменьшение количества короткоцепочечных жирных кислот, продуцируемых в кишечнике. Интересно, что в группах аутопробиотиков наблюдались отчетливые иммунологические изменения.Группы FE и MIX характеризовались наибольшим увеличением B-клеток и уменьшением NKT-клеток в крови, аналогично группе без каких-либо автопробиотиков — 8AB. Такая иммунологическая реакция типична для адаптивной иммунной системы после воспаления. Напротив, моноштаммовые аутопробиотики из групп BI, LB и EN вместе с группой AN характеризовались значительным увеличением регуляторного цитокина IL-10 и CD 25 + FoxP3 + Т-клеток, отражающих отличительная противовоспалительная тенденция.В этом отношении использование анаэробных аборигенных бактерий в качестве пробиотиков выглядит очень многообещающим (El Enshasy et al., 2016). По-видимому, разные препараты аутопробиотиков могут быть полезными при разных патологических состояниях, связанных с разными вариантами дисбактериоза. Однако необходимы дальнейшие исследования, чтобы полностью понять влияние автопробиотиков на контроль дисбактериоза. ЗаключениеАвтопробиотический подход, основанный на использовании личных бактериальных штаммов, был оценен для восстановления микробиоты на модели антибиотико-ассоциированного дисбиоза.Лечение различными штаммами автопробиотиков привело к быстрому восстановлению микробиоты по сравнению с животными, не получавшими лечения автопробиотиками. Данные метагенома и КПЦР отражали значительные изменения в составе микробиоты и численности бактерий после приема автопробиотиков. Однако полного восстановления микробиоты добиться не удалось. Иммунологические изменения после лечения автопробиотиками характеризовались общей тенденцией к восстановлению иммунного статуса. Характерные противовоспалительные реакции наблюдались при приеме автопробиотиков на основе бифидобактерий, энтерококков или смеси бактерий.Анаэробно выращенная фекальная микробиота обеспечила наиболее многообещающий пробиотический эффект. Вклад авторовAS руководил проектом и написал статью. АК подготовил ДНК метагенома и провел предварительный анализ ДНК. МК участвовал во всех этапах работы с экспериментальными животными и собирал образцы для секвенирования метагенома. YK провел анализ PCA и помог в редактировании статьи. NL взял образцы крови у животных и собрал фекальную микробиоту. AK помог в проведении анализа биоинформации и дизайна праймеров ДНК.ПК выполнил значительную часть биоинформационного анализа фекальной микробиоты. TK собрал кровь у экспериментальных животных и подготовил образцы для ELISA и иммунного флуориметрического анализа. GL провела все иммунологические исследования и эксперименты ELISA. IK провела все иммунофлуориметрические исследования. DG участвовал в пересмотре текущей публикации, критически важном для интеллектуального содержания, и интерпретации данных для работы. А.Л. руководил всей биоинформационной работой и участвовал в редактировании рукописи.Е.Е. руководил всеми экспериментами, подготовил большинство рисунков и таблиц и лично работал с экспериментальными животными. Заявление о конфликте интересовАвторы заявляют, что исследование проводилось в отсутствие каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов. БлагодарностиМы благодарим профессора М. Арумугама, Университет Копенгагена, Дания, за его ценные предложения и помощь в редактировании рукописи. СноскиФинансирование. Работа поддержана Российским научным фондом 16-15-10085. Ссылки1. Arumugam M., Raes J., Pelletier E., Le Paslier D., Yamada T., Mende D. R., et al. . (2011). Энтеротипы микробиома кишечника человека. Природа 473, 174–180. 10.1038 / nature09944 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 2. ДеСантис Т. З., Хугенгольц П., Ларсен Н., Рохас М., Броди Э. Л., Келлер К. и др. . (2006) Greengenes, проверенная химерами рабочая среда базы данных генов 16S рРНК, совместимая с ARB.Прил. Environ. Microbiol. 72, 5069–5072. 10.1128 / AEM.03006-05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 3. Эль-Эншаси Х., Малик К., Малек Р. А., Осман Н. З., Эльсайед Э. А., Вадаан М. (2016). Анаэробные пробиотики: ключевые микробы для здоровья человека, в «Анаэробах в биотехнологии», ред. Хатти-Каул Р., Мамо Г., Маттиассон Б. (Cham: Springer;), 397–431. [Google Scholar] 4. Ермоленко Э., Громова Л., Борщев Ю., Воейкова А., Ермоленко К., Груздков А. и др. . (2013). Влияние различных пробиотических молочнокислых бактерий на микробиоту и метаболизм крыс с дисбактериозом.Biosci. Микробиота Пища Здоровье 32, 41–49. 10.12938 / bmfh.32.41 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 5. Гупта С., Аллен-Верко Э., Петроф Э. О. (2016). Трансплантация фекальной микробиоты: в перспективе. Ther. Adv. Гастроэнтерол 9, 229–239. 10.1177 / 1756283X15607414 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 6. Ильин В. К., Суворов А. Н., Кирюхина Н. В., Усанова Н. А., Старкова Л. В., Бояринцев В. В. и др. (2013). Автохтонные пробиотики в профилактике инфекционно-воспалительных заболеваний человека в измененных местообитаниях.Вестн. Росс. Акад. Med. Наук. 68, 56–62. 10.15690 / vramn.v68i2.550 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 9. Макмерди П. Дж., Холмс С. (2013). Phyloseq: пакет R для воспроизводимого интерактивного анализа и графики данных переписи микробиома. PLoS ONE 8: e61217. 10.1371 / journal.pone.0061217 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 10. Моргун А., Дзуцев А., Донг X., Грир Р. Л., Секстон Д. Дж., Равель Дж. И др. . (2015). Выявление эффектов антибиотиков на хозяина и микробиоту с использованием генных сетей транскингдома.Кишечник 64, 1732–1743. 10.1136 / gutjnl-2014-308820 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 11. Ольшак Т., Невес Дж. Ф., Даудс К. М., Бейкер К., Гликман Дж., Дэвидсон Н. О. и др. (2014) Защитный иммунитет слизистой оболочки, опосредованный эпителиальным CD1d IL-10. Природа 509, 497–502. 10.1038 / природа13150. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 12. Qin J., Li R., Raes J., Arumugam M., Burgdorf K. S., Manichanh C., et al. . (2010). Каталог микробных генов кишечника человека, созданный путем метагеномного секвенирования.Природа 464, 59–65. 10.1038 / nature08821 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 13. Айва К., Лансен А., Кертис Т. П., Давенпорт Р. Дж., Холл Н., Хед И. М. и др. . (2009) Точное определение микробного разнообразия по 454 данным пиросеквенирования. Nat. Методы 6, 639–641. 10.1038 / nmeth.1361. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 15. Соловьева О. И., Симаненков В. И., Суворов А. Н., Ермоленко Е. И., Шумихина И. А., Свиридов Д. А. (2017). Использование пробиотиков и аутопробиотиков при лечении синдрома раздраженного кишечника.Exp. Clin. Гастроэнтерол. 7, 115–120. [Google Scholar] 17. Суворов А., Симаненков В., Громова Л., Колоджиева В., Цапиева А., Черныш А. и др. (2011). Энтерококки как пробиотики или автопробиотики, в пребиотиках и потенциале пробиотиков для здоровья человека, под ред. Иванова И. (София: Софийский университет «Св. Климента Охридского»), 104–112. [Google Scholar] 18. Вуотто К., Лонго Ф., Донелли Г. (2014). Пробиотики для противодействия инфекциям, связанным с биопленками: многообещающие и противоречивые данные. Int. J. Oral Sci. 6, 189–194.10.1038 / ijos.2014.52 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 19. Wopereis H., Oozeer R., Knipping K., Belzer C., Knol J. (2014). Первая тысяча дней — кишечная микробиология молодости: установление симбиоза. Педиатр. Allergy Immunol. 25, 428–438. 10.1111 / pai.12232 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 20. Цейссиг С., Блумберг Р. С. (2014). Комменсальная микробная регуляция естественных Т-клеток-киллеров на границах иммунной системы слизистой оболочки. FEBS Lett. 588, 4188–4194. 10.1016 / j.febslet.2014.06.042 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]Восстановление состава и разнообразия бактериального микробиома среди респондеров во время фазы 2 испытания RBX2660: исследуемого терапевтического средства для восстановления микробиома | Открытый форум по инфекционным болезнямАннотацияПредпосылки RBX2660 — это исследуемая терапия восстановления микробиоты в фазе 3 клинической разработки для предотвращения рецидивирующих инфекций Clostridioides difficile (ИКД).В рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом исследовании фазы 2B RBX2660 был эффективен в предотвращении рецидива ИКД. Настоящее исследование было проведено для характеристики бактериального микробиома фекалий до и после лечения среди респондентов, получавших RBX2660 или плацебо, в этом испытании. Методы Образцы были секвенированы с использованием методов 16S, и полученные данные об относительной численности были подогнаны к полиномиальному распределению Дирихле для определения средней групповой относительной таксономической численности и избыточной дисперсии на уровне класса.Альфа-разнообразие было определено для всех образцов. Для оценки статистической значимости наблюдаемых изменений применялись биостатистические инструменты, включая размер эффекта и анализ повторных измерений. Результаты На момент начала исследования в микробиомах субъектов преобладали гаммапротеобактерии и бациллы с низким содержанием бактериоидов и клостридий. После лечения бактериоидии, клостридии и альфа-разнообразие увеличились среди респондеров RBX2660, что сопровождалось уменьшением количества гаммапротеобактерий и бацилл.Полученные композиции значительно отличались от исходных композиций, и изменения среди респондеров RBX2660 значительно отличались от изменений среди респондентов плацебо, у которых численность Bacteroidia или Gammaproteobacteria не изменилась так сильно. Анализ повторных измерений показал более быстрое и обширное ремоделирование микробиома у респондеров RBX2660 по сравнению с респондентами плацебо, а анализ величины эффекта показал, что микробиомы респондентов RBX2660 стали более похожими на состав RBX2660, также по сравнению с респондентами плацебо. Выводы Профилактика рецидива ИКД с помощью RBX2660 была связана с восстановительными изменениями микробиома, которые могут помочь противостоять колонизации и рецидиву C. difficile . RBX2660 был более эффективным, чем плацебо, в восстановлении микробиомов участников. Сообщество микроорганизмов, обитающих в кишечном тракте человека или микробиоме кишечника, все чаще признается ключевым регулятором метаболического и иммунного гомеостаза и медиатором устойчивости к некоторым патогенным инфекциям [1].Нарушение состава и / или разнообразия микробиома кишечника, известное как дисбиоз, связано с множеством болезненных состояний [2], и восстановление «более нормального» или «более здорового» микробиома все чаще рассматривается как многообещающее лечение. вариант, с рядом экспериментальных терапевтических средств, модулирующих микробиом, в стадии формальной доклинической или клинической разработки [3–5]. Клиническим показанием, наиболее четко связанным с дисбактериозом, является рецидивирующая инфекция Clostridioides difficile (ИКД) [6], с четкими доказательствами того, что восстановление микробиома может уменьшить рецидив ИКД [7].RBX2660 — это стандартизированная стабилизированная суспензия микробиоты широкого консорциума, которая в настоящее время находится на стадии 3 клинической разработки для предотвращения рецидива ИКД ([4, 5]; NCT03244644). В рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом исследовании фазы 2B участники, получившие ≥1 дозу RBX2660, имели меньше рецидивов ИКД, чем участники, получавшие плацебо, через 8 недель после лечения [5]. В этой статье мы расширяем клинические результаты этого испытания, используя набор подходящих для микробиома биостатистических инструментов, чтобы продемонстрировать значительные изменения в составе и разнообразии микробиомов респондентов RBX2660 после лечения.Этот сдвиг привел к увеличению сходства с составом продукта RBX2660. Участники, ответившие на лечение плацебо, показали меньшее изменение микробиома и меньшую склонность к RBX2660. Этот анализ подчеркивает ценность RBX2660 как потенциального терапевтического средства, восстанавливающего микробиом. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫRBX2660 ПодготовкаRBX2660 доставляет широкий консорциум живых микробов в жидкой суспензии, произведенной из стула здоровых людей-доноров.Отбор и скрининг доноров, а также подготовка RBX2660 были описаны в другом месте [4], а дополнительные подробности представлены в качестве дополнительных материалов. Слепая часть исследования фазы 2B включала в общей сложности 119 доз RBX2660 от 17 доноров. Плацебо состояло из физиологического раствора и раствора носителя в тех же пропорциях, что и в RBX2660. Описание клинического исследованияДетали экспериментов и клинические результаты исследования фазы 2B были опубликованы в другом месте [5] и представлены в качестве дополнительных материалов.Вкратце, 127 участников с диагнозом мультирецидивная ИКД были включены в исследование, рандомизированы и лечились в 1 из 3 групп: группа А получила 2 дозы RBX2660; группа В — 2 дозы плацебо; и группа C — 1 доза RBX2660 с последующей 1 дозой плацебо. Успешный ответ на лечение определялся как отсутствие рецидива ИКД через 8 недель после лечения. Анализ образцов, экстракция и секвенированиеУчастников попросили предоставить образцы фекалий перед исследуемым лечением (исходный уровень) и через 1, 4 и 8 недель, а также через 6, 12 и 24 месяца после завершения назначенного слепого исследуемого лечения.Участие в фазе сбора образцов исследования было необязательным в соответствии с требованиями согласия; поэтому не все участники были представлены в анализе. Чтобы избежать систематической ошибки отбора, мы включили все полученные образцы от респондентов группы A, B или C, которые соответствовали критериям временной точки исходного уровня и через 10 ± 4, 30 ± 10 или 60 ± 15 дней с даты последнего слепого исследуемого лечения. . Анализ проб за пределами этих диапазонов не проводился. Образцы кала от неответчиков не были включены в этот анализ, поскольку все они были обработаны открытым препаратом RBX2660 после определения неэффективности лечения, что затрудняет количественное сравнение с другими группами образцов.Аликвоту каждой дозы RBX2660, введенной в слепую фазу исследования, также включали в анализ секвенирования. Все образцы были секвенированы с использованием методов 16S, адаптированных из методов, разработанных для Проекта микробиома человека Национальных институтов здравоохранения [8] и проведенных Diversigen. Последовательности гена 16S рибосомной РНК были сгруппированы в рабочие таксономические единицы (OTU) со значением отсечения сходства 97% с использованием алгоритма UPARSE [9]. Дополнительные сведения представлены в дополнительных материалах. Определение показателей таксономического изобилия и разнообразияОтносительная таксономическая численность на уровне класса была определена для всех выборок на основе данных OTU. Средние значения относительной численности по группе были определены путем подгонки значений относительной численности выборки к полиномиальному распределению Дирихле (DM) с использованием метода максимального правдоподобия, как описано в другом месте [10], для получения двух сводных статистических данных: pi (π), вектор среднего пропорции таксонов в наборе образцов и тета (θ), мера избыточной дисперсии или вариации выборки между выборками, которая не зависит от глубины секвенирования или размера выборки.Альфа-разнообразие рассчитывали по индексам Шеннона и Симпсона [11]. Анализ многомерного масштабированияАнализ многомерного масштабирования (MDS) был использован для отображения всех отдельных образцов в 2-мерном пространстве с помощью меры несходства Брея-Кертиса [10]. Средний таксономический состав для каждого времени и группы обработки, оцененный по параметру DM π, был включен в качестве дополнительной выборки в анализ MDS. Статистический анализВсе статистические анализы были выполнены на таксономическом уровне класса, за исключением случаев, когда это указано, гибнущих таксонов, которые в совокупности вносят <1% в один таксон («другой»).Статистическая значимость межгрупповых различий определялась для π с использованием критерия Вальда и для θ с использованием критерия отношения правдоподобия [10]. Статистическая значимость различий π и θ между подобранными пациентами продольными выборками (например, выборками от одного и того же субъекта в разные моменты времени) определялась с использованием теста перестановки [12]. Проверка гипотез для анализа с повторными измерениями проводилась с использованием алгоритма repeatDM [13]. Средние показатели альфа-разнообразия сравнивались между группами с использованием одномерного критерия Вилкоксона. Анализ размера эффектаВеличина эффекта (ES) для сравнений микробиома была рассчитана как модифицированный критерий Крамера ϕ, как описано в другом месте [10], при этом больший ϕ указывает на большую разницу в распределении таксонов микробиома. РЕЗУЛЬТАТЫРезультаты клинических испытаний и образцы кала участниковКак описано в другом месте в промежуточном анализе [5], 25 из 41 участника в группе A (2 дозы RBX2660) и 25 из 42 в группе C (1 доза RBX2660 и 1 доза плацебо) ответили на лечение, что составляет 60%. среди всех участников, получивших ≥1 активное лечение, по сравнению с 43% ответом среди участников, которые получали только плацебо (группа B, 19 из 44).Ответ на лечение существенно не отличался между участниками, получавшими 1 и получавшими 2 дозы RBX2660 (группы A и C; P > 0,05). Из 69 респондентов 58 предоставили ≥1 образец фекалий, который был включен в этот анализ (таблицы 1 и 2). Не было доказательств существенной разницы между группами лечения в отношении возраста, пола, предшествующих эпизодов, продолжительности эпизода включения или назначения антибиотика для эпизода включения ( P > 0,05; критерий Краскела-Уоллиса [χ 2 текст для секса]).Образцы кала неответчиков не были включены в этот анализ, потому что все они были обработаны открытым препаратом RBX2660 после определения неэффективности лечения, что затрудняет количественное сравнение с другими группами образцов. Таблица 1.Демография участников текущего анализа a
Демографические данные участников текущего анализа a
образцов, включенных в текущий анализ
Образцы, включенные в текущий анализ
|
Временная точка . | P Стоимость по моменту времени . | . | . | . | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
. | Исходный уровень . | 10 дн. . | 30 дн. . | 60 д . | ||||||
Исходный уровень | … | .001 | .001 | .001 | ||||||
10 d | .001 | … | .6 | .12 | .12 | .001 | .12 | … | .03 | |
60 d | .001 | .006 | .03 | … |
P Стоимость по моменту времени . | . | . | . | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
. | Исходный уровень . | 10 дн. . | 30 дн. . | 60 д . | ||||
Базовый уровень | … | .001 | .001 | .001 | ||||
10 д | .001 | … | .12 | .006 | ||||
30 d | .001 | .12 | … | .03 | ||||
60 d | 9. 03… |
Значимость различий в средней относительной численности группы (π) между временными точками, определенная с помощью перестановочного теста
Временная точка . | P Стоимость по моменту времени . | . | . | . |
---|---|---|---|---|
. | Исходный уровень . | 10 дн. . | 30 дн. . | 60 д . |
Базовый уровень | … | .001 | .001 | .001 |
10 d | .001 | … | .12 | .006 |
30 d | .001 | .12 | … | .03 |
60 d | .001 | .006 | 9136 9136 9196
Момент времени . | P Стоимость по моменту времени . | . | . | . | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
. | Исходный уровень . | 10 дн. . | 30 дн. . | 60 д . | ||||||
Исходный уровень | … | .001 | .001 | .001 | ||||||
10 d | .001 | … | .6 | .12 | .12 | .001 | .12 | … | .03 | |
60 д | .001 | .006 | .03 | … |
Влияние лечения RBX2660 на альфа-разнообразие микробиомов участников
Альфа-разнообразие обычно выражается как индекс Шеннона, невзвешенный показатель или индекс Симпсона, показатель, взвешенный по относительной численности [18]. Оба индекса были значительно увеличены после лечения RBX2660 по сравнению с исходным уровнем (рис. 3; тест Вилкоксона), что согласуется с результатами предыдущих анализов рецидивирующего ИКД [17], и все группы после лечения имели альфа-разнообразие, аналогичное таковому для RBX2660.
Рисунок 3.
Альфа-разнообразие RBX2660 и выборок участников для каждой группы временных точек, выраженное как индекс Симпсона или Шеннона. Прямоугольники представляют собой групповые средние значения со стандартными отклонениями. * П <. 05 (тест Вилкоксона).
Рисунок 3.
Альфа-разнообразие RBX2660 и выборок участников для каждой группы временных точек, выраженное как индекс Симпсона или Шеннона. Прямоугольники представляют собой групповые средние значения со стандартными отклонениями. * П <.05 (тест Вилкоксона).
ES Анализ: конвергенция микробиомов после лечения к профилю RBX2660
Как препарат широкого консорциума, полученный от здоровых людей-доноров и имеющий состав, аналогичный здоровым когортам, RBX2660 можно считать 1 представителем более здорового микробиома. Поэтому в качестве меры эффективности лечения RBX2660 мы количественно оценили степень, в которой лечение изменило состав микробиома участников в сторону состава RBX2660.ES, выраженный как модифицированный критерий Крамера (ϕ), представляет собой метод, с помощью которого можно количественно оценить сходство или различие между двумя популяциями микробиома [10, 19]. Исходно ES для сравнения с RBX2660 был большим (ϕ = 0,703) с очевидными различиями в Bacteroidia, Clostridia, Gammaproteobacteria, Bacilli и Negativicutes (Рисунок 4). Через 10, 30 и 60 дней после лечения ϕ снизился до 0,424, 0,294 и 0,261 соответственно, подтверждая прогрессирование микробиомов участников до более близкого к RBX2660.
Рисунок 4.
Размер эффекта для каждой группы временных точек по сравнению с RBX2660. Векторы средней относительной численности (π) на уровне таксономического класса показаны с верхним и нижним доверительными интервалами, определенными путем подгонки к полиномиальному распределению Дирихле. Величина эффекта выражается в виде модифицированного критерия Крамера ϕ для каждого попарного сравнения.
Рис. 4.
Размер эффекта для каждой группы временных точек по сравнению с RBX2660. Векторы средней относительной численности (π) на уровне таксономического класса показаны с верхним и нижним доверительными интервалами, определенными путем подгонки к полиномиальному распределению Дирихле.Величина эффекта выражается в виде модифицированного критерия Крамера ϕ для каждого попарного сравнения.
Различия в изменениях и восстановлении микробиома среди респондеров, получавших плацебо
Визуальный осмотр анализа MDS Брея-Кертиса показал, что микробиомы среди респондеров, получавших плацебо, отклонялись от исходного уровня в меньшей степени, чем у участников, получавших RBX2660, и не сходились с RBX2660 (рис. 5). Кроме того, средние составы (π) на уровне класса изменились меньше после лечения плацебо, чем после RBX2660 (фиг. 6A).В частности, содержание Bacteroidia никогда не превышало 15% и существенно не отличалось от исходного уровня в любой момент времени после лечения плацебо ( P > 0,05; тест Вилкоксона). Аналогичным образом, гаммапротеобактерии оставались значительной частью микробиомов респондентов плацебо даже через 60 дней после лечения. Общий состав значительно отличался у респондентов плацебо и респондентов RBX2660 через 60 дней после лечения ( P = 0,02; тест типа Вальда; таблица 4), подтверждая, что лечение RBX2660 более эффективно при изменении состава микробиома.Чрезмерная дисперсия (θ) среди респондентов, ответивших на плацебо, была выше после лечения (рис. 6В) и была значительно выше, чем среди респондентов RBX2660 через 30 и 60 дней после лечения ( P <0,05; тест отношения правдоподобия). Наконец, ES-анализ подтвердил, что микробиомы респондентов, получавших плацебо, не сдвигались так близко к RBX2660 после лечения по сравнению с респондентами, получавшими RBX2660 (ϕ = 0,36, 0,45 и 0,36 через 10, 30 и 60 дней, соответственно; дополнительный рисунок). 3).
Рисунок 5.
Анализ многомерной шкалы, основанный на различии Брея-Кертиса для образцов продукта RBX2660 и образцов респондентов плацебо до лечения (исходный уровень) и через 10, 30 и 60 дней после лечения. Средний состав микробиома для каждой временной группы ( треугольников, ) был рассчитан на основе полиномиального распределения Дирихле и включен в анализ.
Рис. 5.
Анализ многомерной шкалы, основанный на различии Брея-Кертиса для образцов продукта RBX2660 и образцов плацебо-респондентов до лечения (исходный уровень), а также через 10, 30 и 60 дней после лечения.Средний состав микробиома для каждой временной группы ( треугольников, ) был рассчитан на основе полиномиального распределения Дирихле и включен в анализ.
Рисунок 6.
Средний таксономический состав образца и группы и разнообразие образцов продукта RBX2660 и образцов респондентов плацебо до лечения (исходный уровень) и через 10, 30 и 60 дней после лечения. A, Относительная численность таксономических классов, присутствующих при численности ≥5%, включая Bacteroidia, Clostridia, Gammaproteobacteria, Bacilli, Verrucomicrobia и Negativicutes.Отдельные выборки представлены в виде точек, а средние значения групп (π) с верхним и нижним доверительными интервалами ( красных квадратов ) были рассчитаны на основе оценки максимального правдоподобия с использованием многочлена Дирихле. B, Избыточная дисперсия (θ) для групп образцов, показанная как медиана с верхним и нижним доверительными интервалами, рассчитанными с использованием метода моментов. Сравнения между временными группами отмечены как значимые (* P <0,05) или как незначимые (NS). C, Альфа-разнообразие для отдельных лиц и групп выборок, выраженное индексами Симпсона или Шеннона.Прямоугольники представляют собой групповые средние значения со стандартными отклонениями. * P <0,05 (критерий Вилкоксона).
Рисунок 6.
Средний таксономический состав образца и группы и разнообразие образцов продукта RBX2660 и образцов респондентов плацебо до лечения (исходный уровень) и через 10, 30 и 60 дней после лечения. A, Относительная численность таксономических классов, присутствующих при численности ≥5%, включая Bacteroidia, Clostridia, Gammaproteobacteria, Bacilli, Verrucomicrobia и Negativicutes.Отдельные выборки представлены в виде точек, а средние значения групп (π) с верхним и нижним доверительными интервалами ( красных квадратов ) были рассчитаны на основе оценки максимального правдоподобия с использованием многочлена Дирихле. B, Избыточная дисперсия (θ) для групп образцов, показанная как медиана с верхним и нижним доверительными интервалами, рассчитанными с использованием метода моментов. Сравнения между временными группами отмечены как значимые (* P <0,05) или как незначимые (NS). C, Альфа-разнообразие для отдельных лиц и групп выборок, выраженное индексами Симпсона или Шеннона.Прямоугольники представляют собой групповые средние значения со стандартными отклонениями. * P <0,05 (критерий Вилкоксона).
Таблица 4.Сравнения группового среднего относительного обилия (π) и избыточной дисперсии (θ) между респондерами RBX2660 и респондерами плацебо по временным точкам a
Time Point . | P Значение . | . | ||
---|---|---|---|---|
. | π . | θ . | .02 | <.01 |
Момент времени . | P Значение . | . | ||
---|---|---|---|---|
. | π . | θ . | 0,02 | <0,01 |
Сравнения группового среднего относительного обилия (π) и избыточной дисперсии (θ) между респондентами RBX2660 и респондентами плацебо по временным точкам a
. | P Значение . | . | ||
---|---|---|---|---|
. | π . | θ . | .02 | <.01 |
Момент времени . | P Значение . | . |
---|---|---|
. | π . | θ . |
Исходный уровень | .99 | .16 |
10 d | .93 | .76 |
30 d | .06 | .02 |
60 d | .02 | <0,01 |
Различия в динамике изменений микробиома между RBX2660- и плацебо-леченными респондерами
Для оценки продольных изменений среди образцов, соответствующих пациентам, мы выполнили анализ с повторными измерениями на подмножестве образцов от участников, получавших RBX2660 или плацебо, у которых были доступны все 4 временных точки (исходный уровень и 10, 30 и 60 дней после лечения. ; 16 участников, получавших RBX2660, и 7 участников, получавших плацебо).При использовании DMRepeat, который регулирует корреляцию внутри субъекта [13], продольные изменения микробиома значительно различались между RBX2660 и респондентами плацебо (рисунок 7 и дополнительный рисунок 4; P <0,001). Заметными среди этих различий было большее увеличение количества Bacteroidia и уменьшение Gammaproteobacteria среди респондеров RBX2660 через 10 дней.
Рисунок 7.
Относительная численность ключевых таксономических классов на исходном уровне и после обработки для образцов участников, включенных в анализ повторных измерений.Значения среднего относительного обилия (π) с доверительными интервалами показаны для участников, получавших RB2660 и плацебо.
Рис. 7.
Относительная численность ключевых таксономических классов на исходном уровне и после обработки для проб участников, включенных в анализ повторных измерений. Значения среднего относительного обилия (π) с доверительными интервалами показаны для участников, получавших RB2660 и плацебо.
ОБСУЖДЕНИЕ
Предполагается, что нарушенный микробиом кишечника способствует развитию многих заболеваний человека, включая рецидивирующую ИКД.Соответственно, терапевтические средства, восстанавливающие микробиом, могут стать эффективной стратегией здравоохранения. Процесс их разработки выиграет от статистической демонстрации изменений в микробиомах пациентов, которые связаны с улучшением болезненного состояния. Здесь мы сообщаем об изменениях микробиома, связанных с рандомизированным двойным слепым плацебо-контролируемым испытанием исследуемого терапевтического средства восстановления микробиома RBX2660. Мы также представляем и применяем набор инструментов биостатистики микробиома для оценки статистической значимости изменений, связанных с лечением.
Микробиом наших участников до лечения RBX2660 или плацебо (исходный уровень) соответствует тому, что описано в литературе. Уровни таксономической классификации, на которых сообщаются данные, варьируются в зависимости от публикаций, поэтому для сравнения выводится характеристика на уровне класса. Большинство наших участников получали ванкомицин или метронидазол — наиболее часто назначаемые антибиотики для ИКД во время испытания. Известно, что оба антибиотика глубоко изменяют микробиоту, в том числе уменьшают количество бактерий и клостридий и способствуют чрезмерному росту гаммапротеобактерий [20, 21].Оба также, как известно, уменьшают альфа-разнообразие. Эти сбои делают пациентов уязвимыми к повторной колонизации и рецидиву ИКД. У наших участников были аналогичные изменения микробиоты на исходном уровне, что подтверждает, что они достаточно репрезентативны для общей популяции рецидивирующих ИКД.
Только 3 участника получали фидаксомицин до начала лечения. Фидаксомицин был разработан как более селективный агент, который вызывает меньшее нарушение микробиома и тем самым снижает частоту рецидивов через 30 дней после лечения [22].По сравнению с ванкомицином, фидаксомицин и другие новые антибиотики, разрабатываемые в настоящее время, обычно более щадящие по отношению к бактериоидиям и клостридиям [23–28]. Хотя эти новые препараты показали многообещающие результаты в клинических испытаниях, чрезмерный рост гаммапротеобактерий и другие нарушения микробиома могут сохраняться [29, 30], что мы наблюдали у пациентов, получавших фидаксомицин на исходном уровне (дополнительная таблица 3). Таким образом, литература и наши данные подчеркивают, что сохраняется потребность в терапии, восстанавливающей микробиом.
Подход, наиболее тесно связанный с восстановлением микробиома и снижением рецидивов после лечения ИКД, — это трансплантация фекальной микробиоты (FMT), хотя методы, источники доноров и результаты различаются в разных отчетах [31]. Увеличение бактериоидов, клостридий и альфа-разнообразия и уменьшение гаммапротеобактерий и бацилл после лечения RBX2660 также наблюдалось после FMT [7, 32]. В литературе есть свидетельства того, что различные составы FMT приводят к разным составам микробиома после обработки.Например, относительное содержание Bacteroidia в композициях FMT варьировалось от <10% до> 50% между двумя исследованиями, и микробиомы пациентов после лечения варьировались соответственно [7, 33]. Если они достаточно большие, эти типы вариаций, вероятно, могут привести к различиям в эффективности. Более того, поскольку методы приготовления, хранения и доставки могут повлиять на состав или жизнеспособность FMT [34], существует очевидная потребность в стандартизации процесса и продукта и реализации мер контроля качества, как это было сделано для RBX2660.
Имеется еще один отчет об изменениях микробиома после лечения стандартизированным исследуемым терапевтическим микробиомом, проходящим формальную клиническую оценку рецидива ИКД. SER-109 — это состав на основе спор человека, полученный из стула, который продемонстрировал многообещающую эффективность в исследовательском исследовании диапазона доз [3]. Хотя это преимущество еще предстоит продемонстрировать в плацебо-контролируемом исследовании, микробиомы участников показали такое же восстановление, как и у пациентов, ответивших на RBX2660 — возобновление роста Clostridia, уменьшение Enterobacteriaceae (в пределах класса Gammaproteobacteria) и увеличение альфа-разнообразия через 4 недели после лечения.Повторный рост бактериоидов после SER-109 был не таким обширным, как после лечения RBX2660, только у 11 из 29 участников наблюдалось увеличение. Это может быть связано с отсутствием Bacteroidia в продукте SER-109; Для определения важности этой разницы для клинической эффективности потребуются плацебо-контролируемые клинические испытания.
Ключевые различия между микробиомами респондентов, получавших RBX2660 и плацебо, после лечения могут показать, почему RBX2660 показал лучший клинический ответ. Изменения микробиома после лечения плацебо можно считать разумным представителем общей популяции с рецидивирующей ИКД постантибиотиками, потому что частота ответа на плацебо отражает известные показатели отсутствия рецидивов постантибиотиков [35], а плацебо не содержало микробов.Хотя некоторые изменения наблюдались среди респондентов, ответивших на плацебо, RBX2660 показал более быстрое и обширное восстановление Bacteroidia и Clostridia и снижение Gammaproteobacteria и Bacilli. Это говорит о том, что может быть минимальный уровень восстановления, который необходим вскоре после лечения антибиотиками, чтобы предотвратить рецидивы. Возможно, ключевые метаболические функции, конкурентная экология, снижение воспалительной провокации и устойчивости к колонизации имеют решающее значение в этот период, когда пациенты наиболее уязвимы для рецидива.Дальнейшие исследования могут быть направлены на решение этой проблемы путем изменения уровня доз или составов препаратов для лечения микробиома и выполнения анализа с повторными измерениями совокупных или более крупных когорт.
В некоторых сообщениях высказывается предположение, что прямое и длительное приживление штаммов, полученных из FMT, пациентам важно для эффективности [16]. Однако, учитывая тяжелый дисбактериоз среди пациентов с рецидивирующей ИКД, может быть важнее быстро привить и восстановить «более здоровый» или «более нормальный» микробиом, чем напрямую и надолго прижиться.После защиты от рецидива путем кратковременного восстановления пациенты могут уравновеситься со своим нормальным микробиомом в соответствии с диетой, окружающей средой, образом жизни и другими факторами, так что длительное сохранение штаммов FMT не требуется. По крайней мере, одно исследование поддерживает эту модель в том смысле, что восстановление ключевых функций, а не полное приживление донора пациенту, было важным для эффективности [7]. Другими словами, прививка здорового микробиома может вытеснить пациентов из локализованного минимума дисбактериоза, позволяя восстановить их более здоровый состав.
Если эта модель верна, полезно рассмотреть, какие характеристики более здорового, более нормального микробиома могут обеспечить это, учитывая, что не существует эталонного состава здорового микробиома. Проект «Микробиом человека» [8], Meta-HIT [14] и другие когортные исследования здоровых людей [36] показали, что бактерии и клостридии преобладают, что имеет смысл, учитывая их связь с устойчивостью к колонизации [37, 38]. Они также обнаружили более низкую численность Gammaproteobacteria (особенно Enterobacteriaceae), которые обычно связаны с восприимчивостью к C.difficile колонизация, воспаление желудочно-кишечного тракта и другие расстройства [39, 40]. Наконец, более высокое альфа-разнообразие также связано со здоровьем микробиома [17]. Хотя преувеличивать эти характеристики опасно, они представлены во многих примерах здоровой микробиоты, включая RBX2660, который производится из стула, пожертвованного в целом здоровыми людьми. Наши результаты показали быстро возрастающее сходство с RBX2660 после лечения, что подтверждает модель восстановления клинической эффективности RBX2660.В будущих исследованиях будет предпринята попытка изучить это более глубоко, отслеживая состав микробиома в течение более длительного периода после лечения и идентифицируя ключевые функционально восстанавливающие элементы RBX2660.
Дополнительные данные
Дополнительные материалы доступны на сайте Open Forum Infectious Diseases онлайн. Состоящие из данных, предоставленных авторами для удобства читателя, размещенные материалы не копируются и являются исключительной ответственностью авторов, поэтому вопросы или комментарии следует адресовать соответствующему автору.
Благодарности
Эта рукопись была написана при содействии Эми Мур, независимого писателя-медика, финансируемого Rebiotix.
Финансовая поддержка. Работа поддержана Rebiotix, Roseville, Minnesota.
Возможный конфликт интересов. W. D. S. и E. D. получили консультационные услуги от Rebiotix. Все остальные являются сотрудниками Rebiotix и не сообщают о потенциальных конфликтах.Все авторы подали форму ICMJE для раскрытия информации о потенциальных конфликтах интересов. Выявлены конфликты, которые редакция считает относящимися к содержанию рукописи.
Список литературы
1.Gilbert
JA
,Blaser
MJ
,Caporaso
JG
и др.Современные представления о микробиоме человека
.Nat Med
2018
;24
:392
—400
.2.Weiss
GA
,Hennet
T
.Механизмы и последствия дисбактериоза кишечника
.Cell Mol Life Sci
2017
;74
:2959
—77
.3.Khanna
S
,Pardi
DS
,Kelly
CR
и др.Новое терапевтическое средство для микробиома увеличивает разнообразие кишечных микробов и предотвращает повторную инфекцию Clostridium difficile
.J Инфекция Dis
2016
;214
:173
—81
.4.Orenstein
R
,Dubberke
E
,Hardi
R
и др. ;PUNCH CD Investigators
.Безопасность и долговечность RBX2660 (суспензия микробиоты) при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile : результаты исследования PUNCH CD
.Clin Infect Dis
2016
;62
:596
–602
.5.Dubberke
ER
,Lee
CH
,Orenstein
R
, et al.Результаты рандомизированного плацебо-контролируемого клинического исследования препарата на основе микробиоты RBX2660-A для профилактики рецидивирующей инфекции Clostridium difficile
.Clin Infect Dis
2018
;67
:1198
—204
.6.Сталей
С
,Хоруц
А
,Садовский
МДж
.Современные применения трансплантации фекальной микробиоты для лечения кишечных заболеваний человека
.Arch Med Res
2017
;48
:766
—73
.7.Staley
C
,Kelly
CR
,Brandt
LJ
и др.Полное приживление микробиоты не является необходимым для выздоровления от рецидивирующей инфекции Clostridium difficile после трансплантации фекальной микробиоты
.МБио
2016
;7
:e01965
—16
.8.Проект микробиома человека C
.Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека
.Природа
2012
;486
:207
—14
.9.Эдгар
RC
.UPARSE: высокоточные последовательности OTU из микробного ампликона считывают
.Nat Methods
2013
;10
:996
—8
.10.La Rosa
PS
,Brooks
JP
,Deych
E
, et al.Проверка гипотез и расчет мощности для таксономических данных микробиома человека
.PLoS One
2012
;7
:e52078
.11.Legendre
P
,Legendre
L.
Числовая экология.
3-е англ. Изд.Амстердам, Нидерланды
:Elsevier
;2012 г.
.12.Хорошее
PI.
Перестановочные тесты: практическое руководство по методам повторной выборки для проверки гипотез.
2-е изд.Нью-Йорк, Нью-Йорк
:Springer
;2000
.14.Qin
J
,Li
R
,Raes
J
и др. ;Консорциум MetaHIT
.Каталог кишечных микробных генов человека, созданный методом метагеномного секвенирования
.Природа
2010
;464
:59
—65
.15.Ray
A
,Jones
C
.Имеет ли значение донор? влияние донора и пациента на исход исследования лекарств нового поколения на основе микробиоты для лечения рецидивирующей инфекции, вызванной Clostridium difficile
.Future Microbiol
2016
;11
:611
—6
. 16.Гамильтон
MJ
,Weingarden
AR
,Unno
T
, et al.Высокопроизводительный анализ последовательности ДНК показывает стабильное приживление кишечной микробиоты после трансплантации ранее замороженных фекальных бактерий
.Кишечные микробы
2013
;4
:125
—35
. 17.Khanna
S
,Vazquez-Baeza
Y
,González
A
, et al.Изменения микробной экологии после трансплантации фекальной микробиоты при рецидиве C.difficile , вызванная основным воспалительным заболеванием кишечника
.Микробиом
2017
;5
:55
. 18.Hill
TC
,Walsh
KA
,Harris
JA
,Moffett
BF
.Использование мер экологического разнообразия с бактериальными сообществами
.FEMS Microbiol Ecol
2003
;43
:1
—11
.19.La Rosa
PS
,Zhou
Y
,Sodergren
E
, et al.Проверка гипотез метагеномных данных
. В:Izard
J
,Rivera
MC
, ред.Метагеномик для микробиологии.
Амстердам: Academic Press;
2015
:81
—96
,20.Vrieze
A
,Out
C
,Fuentes
S
и др.Влияние перорального ванкомицина на микробиоту кишечника, метаболизм желчных кислот и чувствительность к инсулину
.J Hepatol
2014
;60
:824
—31
. 21.Haak
BW
,Lankelma
JM
,Hugenholtz
F
,Belzer
C
,de Vos
WM
ingaWiers
,Wiers
Долгосрочное воздействие перорального ванкомицина, ципрофлоксацина и метронидазола на кишечную микробиоту здоровых людей
.J Antimicrob Chemother
2019
;74
:782
—6
. 22.Louie
TJ
,Miller
MA
,Mullane
KM
и др. ;OPT-80-003 Группа клинических исследований
.Фидаксомицин против ванкомицина при инфекции, вызванной Clostridium difficile
.N Engl J Med
2011
;364
:422
—31
. 23.Ajami
NJ
,Cope
JL
,Wong
MC
и др.Влияние перорального введения фидаксомицина на кишечную микробиоту и восприимчивость к колонизации у мышей Clostridium difficile
.Противомикробные агенты Chemother
2018
;62
:e02112
—17
. 24.Tannock
GW
,Munro
K
,Taylor
C
и др.Новый макроциклический антибиотик фидаксомицин (OPT-80) вызывает меньшие изменения микробиоты кишечника пациентов, инфицированных Clostridium difficile , чем ванкомицин
.Микробиология
2010
;156
:3354
—9
. 25.Boix
V
,Fedorak
RN
,Mullane
KM
и др.Первичные исходы рандомизированного двойного слепого активно-контролируемого исследования суротомицина фазы 3 у субъектов с инфекцией Clostridium difficile
.Открытый форум Infect Dis
2017
;4
:ofw275
.26.Endres
BT
,Bassères
E
,Alam
MJ
,Garey
кВт
.Кадазолид для лечения Clostridium difficile
.Заключение эксперта по расследованию наркотиков
2017
;26
:509
—14
. 27.Vickers
RJ
,Tillotson
GS
,Nathan
R
и др.;Исследовательская группа CoDIFy
.Эффективность и безопасность ридинилазола в сравнении с ванкомицином для лечения инфекции Clostridium difficile : рандомизированное, двойное слепое, активно-контролируемое исследование не меньшей эффективности, фаза 2
.Lancet Infect Dis
2017
;17
:735
—44
. 28.Blount
KF
,Megyola
C
,Plummer
M
и др.Новый аналог флавина, связывающийся с рибопереключателем, который защищает мышей от инфекции Clostridium difficile без подавления флоры слепой кишки
.Противомикробные агенты Chemother
2015
;59
:5736
—46
,29.Citron
DM
,Tyrrell
KL
,Dale
SE
и др.Влияние суротомицина на микробиоту кишечника здоровых добровольцев в ходе клинического исследования фазы 1
.Противомикробные агенты Chemother
2016
;60
:2069
—74
.30.Mitra
S
,Chilton
C
,Freeman
J
и др.Сохранение микробиома кишечника после лечения ридинилазолом по сравнению с лечением фидаксомицином Clostridium difficile инфекции
.Открытый форум Infect Dis
2017
;4
:S526
—S7
.31.Моайеди
P
,юаней
Y
,Baharith
H
,Ford
AC
.Трансплантация фекальной микробиоты при диарее, ассоциированной с Clostridium difficile : систематический обзор рандомизированных контролируемых исследований
.Med J Aust
2017
;207
:166
—72
.32.Seekatz
AM
,Aas
J
,Gessert
CE
и др.Восстановление микробиома кишечника после трансплантации фекальной микробиоты
.МБио
2014
;5
:e00893
—14
. 33.Jiang
ZD
,Ajami
NJ
,Petrosino
JF
и др.Рандомизированное клиническое испытание: трансплантация фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridum difficile — свежая, замороженная или лиофилизированная микробиота от небольшого пула здоровых доноров, доставленная с помощью колоноскопии
.Алимент Фармакол Тер
2017
;45
:899
—908
. 34.Chu
ND
,Smith
MB
,Perrotta
AR
и др.Профилирование живых бактерий для подготовки трансплантации фекальной микробиоты
.PLoS One
2017
;12
:e0170922
.35.Келли
CP
.Можем ли мы идентифицировать пациентов с высоким риском рецидива инфекции Clostridium difficile ?
Clin Microbiol Infect
2012
;18
(доп. 6
):21
—7
.36.Lloyd-Price
J
,Abu-Ali
G
,Huttenhower
C
.Здоровый микробиом человека
.Genome Med
2016
;8
:51
.37.Khanna
S
,Montassier
E
,Schmidt
B
и др.Микробиом кишечника, предикторы ответа на лечение и рецидива первичной инфекции Clostridium difficile
.Алимент Фармакол Тер
2016
;44
:715
—27
,38.Schubert
AM
,Sinani
H
,Schloss
PD
.Вызванные антибиотиками изменения микробиоты кишечника мышей и последующие эффекты на устойчивость к колонизации против Clostridium difficile
.МБио
2015
;6
:e00974
.39.Garrett
WS
,Gallini
CA
,Яцуненко
T
и др.Enterobacteriaceae действуют совместно с кишечной микробиотой, вызывая спонтанный и передаваемый от матери колит
.Cell Host Microbe
2010
;8
:292
—300
.40.Buffie
CG
,Pamer
EG
.Опосредованная микробиотой устойчивость к колонизации кишечными патогенами
.Nat Rev Immunol
2013
;13
:790
—801
.© Автор (ы) 2019. Опубликовано Oxford University Press от имени Общества инфекционных болезней Америки.
Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/), которая разрешает неограниченное повторное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии, что оригинал работа правильно процитирована.Восстановление микробиоты снижает колонизацию кишечника устойчивыми к антибиотикам бактериями у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridioides difficile по результатам открытого исследования PUNCH CD | Геномная медицина
О’Нил Дж. Глобальная борьба с лекарственно-устойчивыми инфекциями: окончательный отчет и рекомендации; 2016.
Google ученый
Кляйн Е.Ю., Ван Бекель Т.П., Мартинез Э.М., Пант С., Гандра С., Левин С.А. и др. Глобальный рост и географическая конвергенция потребления антибиотиков в период с 2000 по 2015 гг. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2018; 115 (15): E3463 – E70.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Pehrsson EC, Tsukayama P, Patel S, Mejía-Bautista M, Sosa-Soto G, Navarrete KM, et al. Взаимосвязанные микробиомы и резистомы в местах обитания людей с низким доходом. Природа. 2016; 533 (7602): 212.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Костелло С., Меткалф С., Ловеринг А., Мант Д., Хэй А.Д. Влияние назначения антибиотиков в учреждениях первичной медико-санитарной помощи на устойчивость к противомикробным препаратам у отдельных пациентов: систематический обзор и метаанализ.BMJ. 2010; 340: c2096.
PubMed Статья Google ученый
Ван Дж., Фоксман Б., Моди Л., Сниткин Е.С. Сеть микробных взаимодействий и взаимодействий с антибиотиками приводит к колонизации и инфицированию микроорганизмами с множественной лекарственной устойчивостью. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2017; 114 (39): 10467–72.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Лэнгдон А., Крук Н., Дантас Г.Влияние антибиотиков на микробиом в процессе разработки и альтернативные подходы к терапевтическому регулированию. Genome Med. 2016; 8 (1): 39.
PubMed PubMed Central Статья CAS Google ученый
Чаттерджи А., Модарай М., Нейлор Н.Р., Бойд С.Е., Атун Р., Барлоу Дж. И др. Количественная оценка факторов устойчивости к антибиотикам у людей: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2018; 18 (12): e368 – e78.
CAS PubMed Статья Google ученый
Баффи К.Г., Памер Е.Г. Устойчивость к колонизации, опосредованной микробиотой, против кишечных патогенов. Nat Rev Immunol. 2013. 13 (11): 790–801.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Чилтон Ч., Пикеринг Д.С., Фриман Дж. Микробиологические факторы, влияющие на рецидив Clostridium difficile. Clin Microbiol Infect. 2018; 24 (5): 476–82.
CAS PubMed Статья Google ученый
Lessa FC, Winston LG, McDonald LC, Emerging Infections Program CST. Бремя инфекции Clostridium difficile в США. N Engl J Med. 2015; 372 (24): 2369–70.
PubMed Google ученый
Шах Д., Данг М.Д., Хасбун Р., Ку Х.Л., Цзян З.Д., Дюпон Х.Л. и др. Инфекция Clostridium difficile: обновленная информация о новых вариантах лечения антибиотиками и устойчивости к антибиотикам. Expert Rev Anti-Infect Ther. 2010. 8 (5): 555–64.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Weingarden A, Gonzalez A, Vazquez-Baeza Y, Weiss S, Humphry G, Berg-Lyons D, et al. Динамические изменения в краткосрочном и долгосрочном бактериальном составе после трансплантации фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. Микробиом. 2015; 3: 10.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Youngster I, Sauk J, Pindar C, Wilson RG, Kaplan JL, Smith MB, et al. Трансплантация фекальной микробиоты при рецидиве инфекции Clostridium difficile с использованием замороженного посевного материала от неродственных доноров: рандомизированное открытое контролируемое пилотное исследование. Clin Infect Dis. 2014. 58 (11): 1515–22.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Аль-Насир В.Н., Сетхи А.К., Ли Й., Пульц М.Дж., Риггс М.М., Донски С.Дж. Как пероральный метронидазол, так и пероральный ванкомицин способствуют стойкому разрастанию устойчивых к ванкомицину энтерококков во время лечения заболевания, связанного с Clostridium difficile.Антимикробные агенты Chemother. 2008. 52 (7): 2403–6.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Roghmann MC, McCarter RJ Jr, Брюринк J, Cross AS, Моррис JG мл. Инфекция Clostridium difficile является фактором риска бактериемии из-за устойчивых к ванкомицину энтерококков (VRE) у VRE-колонизированных пациентов с острым лейкозом. Clin Infect Dis. 1997. 25 (5): 1056–9.
CAS PubMed Статья Google ученый
Prematunge C, MacDougall C, Johnstone J, Adomako K, Lam F, Robertson J, et al. Исходы бактериемии VRE и VSE в эпоху эффективной терапии VRE: систематический обзор и метаанализ. Инфекционный контроль Hosp Epidemiol. 2016; 37 (1): 26–35.
PubMed Статья Google ученый
Каммарота Дж., Яниро Дж., Гасбаррини А. Трансплантация фекальной микробиоты для лечения инфекции Clostridium difficile: систематический обзор.J Clin Gastroenterol. 2014. 48 (8): 693–702.
PubMed Статья Google ученый
Икбал У., Анвар Х., Карим М.А. Безопасность и эффективность трансплантации инкапсулированной фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile: систематический обзор. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2018; 30 (7): 730–4.
PubMed Статья Google ученый
Дубберке Э. Р., Ли Ч., Оренштейн Р., Ханна С., Хехт Г., Гердинг Д. Н..Результаты рандомизированного плацебо-контролируемого клинического исследования препарата на основе микробиоты RBX2660 для профилактики рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. Clin Infect Dis. 2018; 67 (8): 1198–204.
CAS PubMed Статья Google ученый
Ханна С., Парди Д.С., Келли С.Р., Крафт С.С., Дере Т., Хенн М.Р. и др. Новый терапевтический микробиом увеличивает разнообразие кишечных микробов и предотвращает рецидивирующую инфекцию Clostridium difficile.J Infect Dis. 2016; 214 (2): 173–81.
PubMed Статья Google ученый
Suez J, Zmora N, Zilberman-Schapira G, Mor U, Dori-Bachash M, Bashiardes S, et al. Восстановление микробиома слизистой оболочки кишечника после приема антибиотиков нарушается пробиотиками и улучшается с помощью аутологичного FMT. Клетка. 2018; 174 (6): 1406–23 e16.
CAS PubMed Статья Google ученый
Smillie CS, Sauk J, Gevers D, Friedman J, Sung J, Youngster I, et al. Отслеживание штаммов позволяет выявить детерминанты приживления бактерий в кишечнике человека после трансплантации фекальной микробиоты. Клеточный микроб-хозяин. 2018; 23 (2): 229–40.e5–40.e5.
CAS PubMed Статья Google ученый
Миллан Б., Парк Х, Хотте Н., Матье О, Бургьер П., Томпкинс Т.А. и др. Трансплантаты фекальных микробов снижают уровень генов устойчивости к антибиотикам у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile.Clin Infect Dis. 2016; 62 (12): 1479–86.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Сингх Р., де Гроот П.Ф., Герлингс С.Е., Ходиамонт С.Дж., Белзер С., Берге И. и др. Трансплантация фекальной микробиоты против колонизации кишечника бета-лактамазой расширенного спектра, продуцирующей Enterobacteriaceae: доказательство принципиального исследования. BMC Res Notes. 2018; 11 (1): 190.
PubMed PubMed Central Статья CAS Google ученый
Оренштейн Р., Дубберке Э., Харди Р., Рэй А., Муллан К., Парди Д.С. и др. Безопасность и долговечность RBX2660 (суспензия микробиоты) при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile : результаты исследования PUNCH CD. Clin Infect Dis. 2016; 62 (5): 596–602.
PubMed Статья Google ученый
Ray A, Jones C. Имеет ли значение донор? Эффекты донора и пациента в результате исследования лекарств нового поколения на основе микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile.Future Microbiol. 2016; 11: 611–6.
CAS PubMed Статья Google ученый
Langdon A, Schwartz DJ, Bulow C, Sun X, Hink T, Reske KA и др. Набор данных для восстановления микробиоты снижает колонизацию кишечника устойчивыми к антибиотикам бактериями у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridioides difficile из открытого исследования PUNCH CD. NCBI Biorepository 2020.
CLSI, редактор. Стандарты эффективности тестирования чувствительности к противомикробным препаратам.26-е изд. изд: Институт клинических и лабораторных стандартов; 2016.
Гуревич А., Савельев В., Вяххи Н., Теслер Г. QUAST: инструмент оценки качества сборки генома. Биоинформатика. 2013. 29 (8): 1072–5.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Занкари Э., Хасман Х., Косентино С., Вестергаард М., Расмуссен С., Лунд О. и др. Выявление приобретенных генов устойчивости к противомикробным препаратам.J Antimicrob Chemother. 2012; 67 (11): 2640-4-4.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Seemann T. Prokka: быстрая аннотация генома прокариот. Биоинформатика. 2014; 30 (14): 2068–9.
CAS PubMed Статья Google ученый
Пейдж AJ, Cummins CA, Hunt M, Wong VK, Reuter S, Holden MT и др. Roary: быстрый крупномасштабный анализ генома прокариот.Биоинформатика. 2015; 31 (22): 3691–3.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Стаматакис А. RAxML версия 8: инструмент для филогенетического анализа и постанализа крупных филогений. Биоинформатика. 2014; 30 (9): 1312–3.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Seah BKB, Schwaha T, Volland JM, Huettel B, Dubilier N, Gruber-Vodicka HR.Специфика разнообразия: единое происхождение широко распространенного симбиоза инфузорий-бактерий. Proc Biol Sci. 2017; 284 (1858): 1–9.
Langdon A, Schwartz DJ, Bulow C, Sun X, Hink T, Reske KA и др. Набор данных для сборок бактериальных изолятов для восстановления микробиоты снижает колонизацию кишечника устойчивыми к антибиотикам бактериями у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridioides difficile из открытого исследования PUNCH CD. NCBI Biorepository 2020. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/?term=6
Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, et al. Представляем mothur: программное обеспечение с открытым исходным кодом, независимое от платформы, поддерживаемое сообществом для описания и сравнения сообществ микробов. Appl Environ Microbiol. 2009. 75 (23): 7537–41.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Камински Дж., Гибсон М.К., Франзоза Е.А., Сегата Н., Дантас Дж., Хаттенхауэр С. Высокоспецифичное целевое функциональное профилирование микробных сообществ с помощью ShortBRED.PLoS Comput Biol. 2015; 11 (12): e1004557.
PubMed PubMed Central Статья CAS Google ученый
Каллахан Б.Дж., Макмерди П.Дж., Розен М.Дж., Хан А.В., Джонсон А.Дж., Холмс С.П. DADA2: вывод образца с высоким разрешением из данных ампликона Illumina. Природные методы. 2016; 13 (7): nmeth.3869.
Артикул CAS Google ученый
Райт Э.С. ДЕЦИФЕР: использование контекста локальной последовательности для улучшения выравнивания множественных последовательностей белков.BMC Bioinformatics. 2015; 16: 322.
PubMed PubMed Central Статья CAS Google ученый
МакМурди П.Дж., Холмс С. phyloseq: пакет R для воспроизводимого интерактивного анализа и графики данных переписи микробиома. Plos One. 2013; 8 (4): e61217.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Bolger AM, Lohse M, Usadel B.Trimmomatic: гибкий триммер для данных последовательности Illumina. Биоинформатика. 2014; 30 (15): 2114–20.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Schmieder R, Edwards R. Быстрая идентификация и удаление контаминации последовательностей из наборов геномных и метагеномных данных. Plos One. 2011; 6 (3): e17288.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Truong DT, Franzosa EA, Tickle TL, Scholz M, Weingart G, Pasolli E, et al. MetaPhlAn2 для расширенного метагеномного таксономического профилирования. Нат методы. 2015; 12 (10): 902-3-3.
CAS PubMed Статья PubMed Central Google ученый
Franzosa EA, McIver LJ, Rahnavard G, Thompson LR, Schirmer M, Weingart G, et al. Функциональное профилирование метагеномов и метатранскриптомов на уровне видов. Нат методы. 2018; 15 (11): 962-8-8.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Ле Рой Т., Дебеда Дж., Марке Ф., Да-Кунья С., Ичу Ф., Герре-Милло М. и др. Сравнительная оценка приживления микробиоты после переноса фекальной микробиоты на моделях мышей: значение возраста, кинетики и микробного статуса. Front Microbiol. 2018; 9: 3289.
PubMed Статья Google ученый
Блаунт К.Ф., Шеннон В.Д., Дейч Э., Джонс С. Восстановление состава и разнообразия бактериального микробиома среди респондентов в испытании фазы 2 Rbx2660 — исследуемого терапевтического средства для восстановления микробиома. Открытый форум Infect Dis. 2019: 6 (4) ofz095: 1–10.
Consortium THMP, Huttenhower C, Gevers D, Knight R, Abubucker S, Badger JH, et al. Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека. Природа. 2012; 486 (7402): 207.
Артикул CAS Google ученый
Citron DM, Tyrrell KL, Dale SE, Chesnel L, Goldstein EJ. Влияние суротомицина на микробиоту кишечника здоровых добровольцев в клинических испытаниях фазы 1. Антимикробные агенты Chemother. 2016; 60 (4): 2069–74.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Reuland EA, Sonder GJ, Stolte I, Al Naiemi N, Koek A, Linde GB, et al. Путешествие в Азию и диарея путешественников на фоне лечения антибиотиками являются независимыми факторами риска приобретения устойчивых к ципрофлоксацину энтеробактерий, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия, — проспективное когортное исследование.Clin Microbiol Infect. 2016; 22 (8): 731 e1–7.
Артикул Google ученый
Сегата Н., Изард Дж., Уолдрон Л., Геверс Д., Миропольский Л., Гарретт В.С. и др. Открытие и объяснение метагеномных биомаркеров. Genome Biol. 2011; 12 (6): R60.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Каллахан Б.Дж., Макмерди П.Дж., Холмс С.П. Варианты точных последовательностей должны заменять рабочие таксономические единицы в анализе данных маркерных генов.ISME J. 2017; 11 (12): 2639–43.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Мукерджи К., Билл С.Дж., Гриффен А.Л., Лейс Э.Дж. Секвенирование ампликона ISR с высоким разрешением позволяет выявить персонализированный микробиом полости рта. Микробиом. 2018; 6 (1): 153.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
ДеФилипп З., Блум П.П., Торрес Сото М., Мансур М.К., Сатер MRA, Хантли М.Х. и др.Лекарственно-резистентная бактериемия E. coli, передающаяся при трансплантации фекальной микробиоты. N Engl J Med. 2019; 381 (21): 2043–50.
PubMed Статья Google ученый
Бабади Н.Е. Больничные инфекции. Microbiol Spectr. 2016; 4 (3): 1–22.
Naiemi NA, Duim B, Savelkoul PH, Spanjaard L, de Jonge E, Bart A, et al. Широко распространенная передача генов устойчивости между видами бактерий в отделении интенсивной терапии: последствия для больничной эпидемиологии.J Clin Microbiol. 2005. 43 (9): 4862–4.
PubMed PubMed Central Статья CAS Google ученый
Форсберг К.Дж., Рейес А., Ван Б., Селлек Е.М., Соммер М.О., Дантас Г. Общий резистентность к антибиотикам почвенных бактерий и патогенов человека. Наука. 2012. 337 (6098): 1107–11.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Андерсен Х., Коннолли Н., Бангар Х., Стаат М., Мортенсен Дж., Дебургер Б. и др.Использование секвенирования метагенома дробовика для выявления колонизации фекалий бактериями с множественной лекарственной устойчивостью у детей. J Clin Microbiol. 2016; 54 (7): 1804–13.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Администрация FaD. Информация, касающаяся дополнительных мер безопасности при использовании фекальной микробиоты для трансплантации — скрининг и тестирование доноров стула на наличие организмов с множественной лекарственной устойчивостью FDA.gov2019 [обновлено 18.06.2019.
Palleja A, Mikkelsen KH, Forslund SK, Kashani A, Allin KH, Nielsen T, et al. Восстановление кишечной микробиоты здоровых взрослых после воздействия антибиотиков. Nat Microbiol. 2018; 3 (11): 1255-65-65.
CAS PubMed Статья Google ученый
Бюлоу Э., Белло Гонсалес TDJ, Фуэнтес С., де Стинхейсен Питерс ВАА, Лахти Л., Байджанов Дж. Р. и др. Сравнительная микробиота кишечника и профили резистома у пациентов интенсивной терапии, получающих селективную деконтаминацию пищеварительного тракта, и у здоровых субъектов.Микробиом. 2017; 5 (1): 88.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Фэн Дж., Ли Б., Цзян Х, Ян И, Уэллс Г.Ф., Чжан Т. и др. Устойчивость к антибиотикам в крупномасштабной здоровой кишечной микробиоте человека, расшифрованная с помощью метагеномного и сетевого анализов. Environ Microbiol. 2018; 20 (1): 355–68.
CAS PubMed Статья Google ученый
Тарик Р., Парди Д.С., Бартлетт М.Г., Ханна С. Низкие показатели излечения в контролируемых испытаниях трансплантации фекальной микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile: систематический обзор и метаанализ. Clin Infect Dis. 2019; 68 (8): 1351–8.
CAS PubMed Статья Google ученый
Khan MY, Dirweesh A, Khurshid T, Siddiqui WJ. Сравнение трансплантации фекальной микробиоты со стандартным лечением рецидивирующей инфекции Clostridium difficile: систематический обзор и метаанализ.Eur J Gastroenterol Hepatol. 2018; 30 (11): 1309–17.
PubMed Статья Google ученый
Квак С., Чой Дж., Хинк Т., Реске К.А., Блаунт К., Джонс С. и др. Воздействие исследуемого терапевтического препарата RBX2660 на микробиом кишечника и его резистентность выявлено в ходе плацебо-контролируемого клинического исследования. Микробиом. 2020; 8 (1): 125.
PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Маллиш Б.Х., Макдональд Дж.К., Печливанис А., Аллегретти Дж. Р., Као Д., Баркер Г. Ф. и др. Микробные гидролазы солей желчных кислот опосредуют эффективность трансплантации фекальной микробиоты при лечении рецидивирующей инфекции Clostridioides difficile. Кишечник. 2019; 68 (10): 1791–800.
Png CW, Linden SK, Gilshenan KS, Zoetendal EG, McSweeney CS, Sly LI, et al. Муколитические бактерии с повышенной распространенностью в слизистой оболочке IBD увеличивают использование муцина in vitro другими бактериями. Am J Gastroenterol.2010. 105 (11): 2420–8.
CAS PubMed Статья Google ученый
Дао М.К., Эверард А., Арон-Висневски Дж., Соколовска Н., Прифти Е., Вергер Е.О. и др. Akkermansia muciniphila и улучшение метаболического здоровья во время диетического вмешательства при ожирении: взаимосвязь с богатством кишечного микробиома и экологией. Кишечник. 2016; 65 (3): 426–36.
CAS PubMed Статья Google ученый
Derrien M, Belzer C, de Vos WM. Akkermansia muciniphila и ее роль в регуляции функций хозяина. Microb Pathog. 2017; 106: 171–81.
PubMed Статья Google ученый
Ford C HM, Bryant J, Diao L, Wortman J, Tomlinson A, Litcofsky K, Bernardo P, McGovern B, Aunins JG, Cook DN, Trucksis M. 1641. Лечение рецидивирующей инфекции Clostridium difficile с помощью SER -109 снижает перенос генов устойчивости к противомикробным препаратам в желудочно-кишечном тракте.Открытый форум Infect Dis. 2018; 5: S44-S47.
Browne HP, Forster SC, Anonye BO, Kumar N, Neville BA, Stares MD, et al. Культивирование «некультивируемой» микробиоты человека обнаруживает новые таксоны и обширное спороношение. Природа. 2016; 533 (7604): 543–6.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Лоули Т.Д., Клэр С., Уокер А.В., Гулдинг Д., Стейблер Р.А., Краучер Н. и др. Лечение антибиотиками мышей-носителей Clostridium difficile вызывает состояние суперседдера, опосредованную спорами передачу и тяжелое заболевание у хозяев с ослабленным иммунитетом.Infect Immun. 2009. 77 (9): 3661–9.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Saha S, Tariq R, Tosh PK, Pardi DS, Khanna S. Трансплантация фекальной микробиоты для искоренения носительства организмов с множественной лекарственной устойчивостью: систематический обзор. Clin Microbiol Infect. 2019; 25 (8): 958–63.
CAS PubMed Статья Google ученый
Маккейн Н., Генк Б., Снеллинг Т.Дж., Уоллес Р.Дж. Дифференциальное извлечение генов 16S рРНК бактерий и архей из пищеварительного тракта рубца в ответ на глицерин в качестве криопротектора. J Microbiol Methods. 2013; 95 (3): 381–3.
CAS PubMed Статья Google ученый
Ма Г.К., Брензингер К.М., Ву К., Льюис Дж. Д.. Повышение заболеваемости многократно рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile в США: когортное исследование. Ann Intern Med.2017; 167 (3): 152–8.
PubMed Статья Google ученый
Ллойд-Прайс Дж., Арз К., Анантакришнан А.Н., Ширмер М., Авила-Пачеко Дж., Пун Т.В. и др. Многокомпонентность микробной экосистемы кишечника при воспалительных заболеваниях кишечника. Природа. 2019; 569 (7758): 655–62.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Lim ES, Zhou Y, Zhao G, Bauer IK, Droit L, Ndao IM, et al.Динамика вирома кишечника человека и бактериального микробиома у младенцев в раннем периоде жизни. Nat Med. 2015; 21 (10): 1228–34.
CAS PubMed PubMed Central Статья Google ученый
Препараты для восстановления микрофлоры кишечника
Роль бактерий в развитии хронических и острых заболеваний хорошо известна всем. Но в то же время существуют бактерии, приносящие пользу организму хозяина. Это взаимовыгодное сотрудничество между бактериями и человеческим телом называется симбиозом.Этот набор «хороших» микроорганизмов, обитающих в нашем организме как снаружи, так и внутри, обеспечивающих нормальную жизнь человека, и есть МИКРОФЛОРА. А абсолютное первенство по количеству и видовому разнообразию бактерий в организме принадлежит кишечнику.
Процесс формирования микрофлоры начинается с момента рождения ребенка. До этого при нормальном течении беременности во всем организме ребенка нет ни одной бактерии. Уже во время родов организм ребенка начинает знакомиться с микроорганизмами матери.В основном для ребенка важны лактобациллы, которые являются первыми защитниками от инфекции. После рождения и в процессе кормления заселение кишечника бактериями только усиливается. В основном это бифидобактерии. К первому месяцу жизни ребенка состав бактерий становится относительно стабильным.
В настоящее время все ученые пришли к выводу, что человеческий организм и населяющие его микроорганизмы представляют собой единую функционирующую систему. Но что наиболее поразительно, так это исследования, говорящие о тесной взаимосвязи между мозгом и кишечником.Именно кишечник и его микрофлора влияют на психическое и эмоциональное состояние. То есть депрессия и депрессия могут быть следствием нарушения состава бактерий в кишечнике или нарушения их количества.
Кишечник — это последний отдел пищеварительного тракта человека. При приеме пищи пища через рот, через пищевод попадает в желудок. Желудок активно переваривает твердые частицы, расщепляя их на более мелкие, которые при попадании в двенадцатиперстную кишку измельчаются еще больше.Все это происходит под действием активных веществ — ферментов. Здесь начинается кишечник — трубка с множеством изгибов.
Длина кишечника в среднем 7-9 м. Поэтому движение пищевого комка по нему происходит за счет перистальтики (волнообразного сжатия стенок). Кишечник делится на два отдела — тонкий и толстый кишечник. Основная задача тонкого кишечника — усвоение питательных веществ из пищи или лекарств, поступающих в организм. Стенки тонкой кишки состоят из множества ворсинок, которые значительно увеличивают площадь всасывания.Если расправить тонкий кишечник, то он займет площадь 7 километров! А функция толстого кишечника — окончательное переваривание и всасывание ранее непереваренных остатков пищи (например, всасывание кальция и многих других минералов происходит только в толстом кишечнике), всасывание воды и образование кала.
В каждом случае дозировки и правила приема могут незначительно отличаться, но как для пребиотиков, так и для пробиотиков можно выделить общие принципы терапии.Пребиотики принимают 3-4 раза в день во время еды. Вы можете проходить их длительными курсами, иногда даже больше года. Как правило, пребиотики назначают для поддержания нормальной микрофлоры кишечника, когда при активном лечении достигнуто улучшение и необходимо его поддерживать. Также пребиотики хорошо устраняют симптомы дисбактериоза, облегчая состояние пациента.
Режимы приема пробиотиков различаются в зависимости от формы заболевания. При хронических заболеваниях — принимать пробиотики необходимо 3-4 раза в день за 30-60 минут до еды.Продолжительность приема 14, 21, 30 дней. Если состояние острое, то препараты принимают 4-6 раз в день коротким курсом до нормализации состояния.
Порошкообразную форму препарата развести в теплой воде, капсулы и таблетки проглотить и запить небольшим количеством воды. Для оптимального лечения патологии важно выбрать правильный пробиотик с правильным составом микроорганизмов.
При лечении данной группой препаратов необходимо скорректировать свой рацион, а именно: уменьшить, а лучше полностью исключить сахар и продукты, содержащие его; ешьте больше сложных углеводов (фрукты, овощи, бобы), клетчатки и зелени (пищевые волокна и микроэлементы полезны для микрофлоры кишечника).
Пробиотики для местного применения могут восстанавливать микрофлору кожи, уменьшать угри.
Пробиотики, применяемые местно, могут способствовать положительному бактериальному балансу в коже — подобно тому, как пероральные пробиотики увеличивают разнообразие флоры в кишечнике — и могут улучшать кожные заболевания, такие как акне, говорят авторы недавнего обзора, опубликованного в Experimental Dermatology . 1
СВЯЗАННЫЕ С: Дырявый кишечник, негерметичная кожа или и то, и другое?
В нескольких исследованиях изучалась потенциальная польза пробиотиков для лечения акне, но имеющиеся данные позволяют предположить, что они могут быть полезны при акне, а также при других воспалительных кожных заболеваниях, пишут авторы Ребекка Кнакстедт, М.D. из отделения пластической хирургии клиники Кливленда и Томас Кнакстедт, доктор медицины, из отделения дерматологии MetroHealth, Кливленд. 1
Известно, что микробиом кишечника влияет на здоровье кишечника, а также на более широкие системные воспаления и заболевания. Некоторые крупные метаанализы показали, что пробиотики могут снизить частоту инфекций и снизить потребность в антибиотиках, одновременно улучшая заживление ран, маркеры воспаления и уровень холестерина.Пероральные пробиотики также продемонстрировали эффективность при лечении других кожных заболеваний, таких как атопический дерматит и розацеа.
Микрофлора кожи играет столь же важную роль в регуляции воспаления и иммунного ответа. Нарушение регуляции как врожденной, так и адаптивной иммунной системы вовлечено в патогенез акне. Активация толл-подобных рецепторов и CD14 с помощью Cutibacterium обеспечивает повышенную регуляцию воспалительных цитокинов, таких как TNFa, IL-1B и IL-8, что способствует развитию угревой сыпи, а также может запускать адаптивная иммунная система через клетки Th2 и гуморальный иммунитет.
Cutibacterium , патоген, вызывающий прыщи, является комменсальным организмом у здоровых пациентов, поэтому его присутствие само по себе не является причиной этого состояния. Было показано, что два штамма — риботип 4 и риботип 5 — присутствуют только у пациентов с акне и могут играть роль в патогенезе неясным механизмом. 2
В одном проспективном испытании рассматривалось использование пероральных пробиотиков (комбинация Lactobacillus acidophilus , Lactobacillus delbrueckii и Bifidobacterium bifidum ) для лечения угрей, у пациентов в комбинации с антибиотиками, отдельно или в комбинации с антибиотиками. и комбинация значительно уменьшила количество поражений. 3
СВЯЗАННЫЙ: Пришло ли время регулировать использование пробиотиков в косметике?
«В будущих исследованиях следует выяснить, следует ли использовать пробиотики вместе с антибиотиками для обеспечения лучшего контроля заболеваний», — сказал доктор. Ребекка Кнакстедт и Томас Кнакстедт рассказали Dermatology Times . «Когда они используются из-за их противовоспалительных свойств в дерматологических условиях, рекомендуется использовать субантимикробные препараты. Эти более низкие дозировки обеспечивают противовоспалительную эффективность, сводя к минимуму нарушение кишечной флоры.
Пациенты с акне, получавшие местные пробиотики, включая л plantarum и бесклеточный супернатант от Enterococcus faecalis , также обнаружили снижение концентрации поражений, эритемы и нагрузки патогенных бактерий с улучшением кожного барьера. .
«… поскольку прыщи связаны с чрезмерным ростом патогенных бактерий, а основой терапии часто являются антибиотики, местные пробиотики могут восстановить более желаемую микрофлору, чтобы уменьшить поражения прыщей без системных побочных эффектов», — сказал доктор.Пишут Ребекка Кнакстедт и Томас Кнакстедт.
Пробиотики, в том числе комменсальные бактерии Streptococcus thermophiles , Vitreoscilla filiformis , Staphylococcus hominis , Staphylococcus epidermidies и Lactobacillus johnsonii также были показаны для лечения дерматита, лактобациллы johnsonii Согласно обзору, атопический дерматит связан с изменениями микрофлоры кожи, такими как обилие S aureus .А S aureus был связан с дисфункцией Т-клеток, уменьшением количества антимикробных пептидов, более серьезными аллергическими реакциями и нарушениями кожного барьера.
Взаимосвязь между полезными и патогенными кожными бактериями и их медиаторами сложна и до конца не изучена. Микробиом кожи индивидуализирован, часто меняется в ответ на множество факторов, и в результате не все пробиотики будут работать для всех пациентов. Ребекка Кнакстедт и Томас Кнакстедт заключают.
СВЯЗАННЫЕ: Хорошее здоровье кожи и разнообразный микробиом идут рука об руку
«Оптимальная дозировка и деформация для различных кожных заболеваний еще не определены», — пишут они. «Наиболее эффективная стратегия лечения может включать сочетание местной и пероральной терапии. Кроме того, некоторые предложили использовать пероральные и / или местные пробиотики и антибиотики одновременно, чтобы обеспечить нацеливание на патогенные бактерии, одновременно обеспечивая поддержку комменсальных и полезных бактерий.
«Хорошо проведенных исследований, посвященных роли пробиотиков, местных или пероральных, в развитии акне мало. Однако исследования, которые были проведены при акне и других воспалительных и инфекционных состояниях, показывают, что пробиотики могут положительно влиять на эти болезненные состояния », — рассказали д-р и д-р Кнакстедт изданию Dermatology Times . «Требуются более качественные исследования, чтобы помочь определить роль, которую пробиотики могут играть в смягчении угревой сыпи и других дерматологических заболеваний.”
Ссылки:
1. Knackstedt R, Knackstedt T., Gatherwright J. Роль местных пробиотиков при заболеваниях кожи: систематический обзор исследований на животных и людях и их значение для будущих методов лечения. Эксперимент Дерматол . 2019;
2. Фитц-Гиббон С., Томида С., Чиу Б. Х. и др. Популяции штаммов Propionibacterium acnes в микробиоме кожи человека, связанные с акне. Дж Инвест Дерматол . 2013; 133 (9): 2152-60.
3. Baquerizo nole KL, Yim E, Keri JE.Пробиотики и пребиотики в дерматологии. J Am Acad Dermatol . 2014; 71 (4): 814-21.
Программа восстановления кишечника может улучшить пищеварение и познание; вот как можно принять диету с микробиомом — Health News, Firstpost
Мир, в котором мы живем, полон микроорганизмов, поэтому естественно, что некоторые из них есть в нашем организме. Человеческие тела несут миллионы бактерий, грибков и вирусов, которые вместе создают микробиом, особенно в кишечнике или кишечнике. Хотя многие из этих микроорганизмов связаны с заболеваниями, большинство из них, которые естественным образом поддерживает ваш кишечник, на самом деле имеют решающее значение для правильного функционирования пищеварительной системы, иммунной системы и даже нервной системы.
Итак, поддержание процветающего и здорового микробиома кишечника очень важно для основных функций организма и общего состояния здоровья. Однако бывают ситуации, когда микробиом кишечника может быть поставлен под угрозу, а его баланс нарушен, что может иметь огромные неблагоприятные последствия для вашего здоровья.
Последствия дисбактериоза кишечной микробиоты
Исследование, опубликованное в International Journal of Environmental Research and Public Health в 2018 году, показывает, что это нарушение микробиоты кишечника называется дисбактериозом, и это состояние связано с кишечными заболеваниями, такими как синдром раздраженного кишечника (СРК), целиакия и воспалительное заболевание кишечника (ВЗК).Более того, исследование показывает, что дисбактериоз также может вызывать другие проблемы, такие как ожирение, нарушение обмена веществ, сердечно-сосудистый синдром, аллергию и астму.
Исследование 2019 года, опубликованное в Nutrients , показывает, что дисбактериоз кишечной микробиоты теперь также связан с колоректальным раком, диабетом и даже неврологическими расстройствами. Исследование предполагает, что между кишечной микробиотой и мозгом существует взаимное взаимодействие, известное как ось кишечник-мозг, и изменения в этом взаимодействии из-за дисбактериоза могут вызвать возникновение неврологических проблем.В целом, исследования показывают, что дисбактериоз — это состояние, которое может сильно повлиять на ваше здоровье и качество жизни, и его следует предотвращать любой ценой.
Диета при дисбактериозе?
Диета — один из ключевых методов регулирования микробиома кишечника, поэтому вполне логично, что диетологи на протяжении многих лет разрабатывают диеты, которые могут эффективно бороться с дисбактериозом. По словам Аканкши Мишры, эксперта по питанию и здоровью, связанного с myUpchar , соблюдение такой диеты сейчас даже более важно, потому что современная диета также включает гораздо больше нездоровой пищи.«Нездоровая пища богата простыми углеводами, рафинированным сахаром, жирами плохого качества, чрезмерным количеством натрия и консервантов», — говорит она. «Это классический пример несбалансированной диеты, которая приводит к различным проблемам со здоровьем, включая нарушение здоровья кишечника, потому что эти продукты содержат небольшое количество питательных веществ, клетчатки и воды. Очевидно, что это не создает здоровую среду для кишечных бактерий, и принятие изменений для восстановления микробиома кишечника становится важным ».
Мишра — не единственный диетолог, который советует использовать диеты для восстановления кишечника, чтобы обеспечить хорошее самочувствие кишечника.В книге «Натуральные решения для здоровья пищеварительной системы» 2014 года исследователи рекомендуют диету, исключающую аллергенные и воспалительные продукты, и включающую пробиотики и пребиотики для восстановления слизистой оболочки всей желудочно-кишечной системы, включая желудок. В этой книге говорится, что соблюдение диеты для восстановления кишечника также может помочь предотвратить проблемы с кожей, включая прыщи, сыпь, дерматит и экзему, поскольку кожа является зеркалом для пищеварительной системы.
Как соблюдать диету для восстановления кишечника
Примечательно, что д-р Рафел Келлман (американский врач, который, как сообщается, является пионером в области «микробиомной медицины») выпустил в 2014 году свою книгу под названием «Микробиомная диета», в которой была разработана диета, которая стала популярной в последние годы.Диета Келлмана — это трехэтапная программа, которая, как утверждается, помогает вам похудеть, а также восстанавливает микробиом кишечника. Его микробиомная диета также основана на удалении токсичных продуктов, включении продуктов, благоприятных для кишечника, и длительном периоде поддержания, когда эти продукты могут эффективно изменить состояние вашего здоровья.
Независимо от того, есть ли у вас проблемы с пищеварением, поддержание здоровья кишечника очень важно. По словам Мишры, лучший способ придерживаться диеты для восстановления кишечника — это проконсультироваться с диетологом, который может составить план диеты в соответствии с вашими конкретными проблемами со здоровьем и потребностями.Она также предлагает советы, которые помогут вам начать путь к совершенно счастливому и здоровому микробиому кишечника:
- Добавьте в свой рацион продукты с пребиотиками и пробиотиками, чтобы обеспечить надлежащий баланс между желудочными и кишечными бактериями. Постарайтесь добавить в свой ежедневный рацион несколько кисломолочных продуктов, таких как творог, йогурт, пахта, кефир и кимчи.
- Добавьте различные виды проса, такие как жемчужное просо, пальмовое просо, сорго, стальной овес, чтобы увеличить количество сложных углеводов и клетчатки в вашем рационе.
- Вы можете добавить чайную ложку изабгола или шелухи псиллиума в молоко перед сном.
- Добавьте сезонные фрукты и овощи, чтобы получить клетчатку, необходимые витамины, минералы и воду.
- Выпивайте от двух до четырех литров воды в день. Вы также можете пить пахту, воду для детоксикации, сок, лимонад, травяной чай или зеленый чай.
- Выберите домашний завтрак вместо готовых к употреблению хлопьев, чтобы избежать вредной среды для кишечных бактерий.
- Попробуйте добавить ферментированные продукты в свой обычный рацион.Это помогает создать здоровый баланс между кишечными микробами. Поэтому регулярно принимайте идли, доша, дхокла, кадхи, ферментированный рис, чтобы поддерживать этот здоровый баланс.
Подробнее читайте в нашей статье Как улучшить пищеварение.
Статьи о здоровье в Firstpost написаны myUpchar.com, первым и крупнейшим в Индии ресурсом проверенной медицинской информации. В myUpchar исследователи и журналисты работают с врачами, чтобы предоставить вам информацию обо всем, что касается здоровья.
4 способа восстановить здоровье кишечника вашего питомца
Полезные бактерии или пробиотики в кишечнике вашего питомца являются ключевыми строительными блоками для общего состояния здоровья. Большая часть иммунной системы живет в кишечнике. Сохранение большого количества полезных бактерий в тонком микробиоме кишечника может помочь укрепить иммунную систему. Это может помочь вашей собаке или кошке бороться с вредными бактериями, вирусами и повседневными токсинами, а также предотвратить аллергию, поддерживать здоровый вес и улучшить общее качество жизни! Читайте дальше, чтобы узнать больше о том, как восстановить здоровье кишечника вашего питомца.
1. Кормите вашего питомца биологически подходящей диетой, богатой питательными веществами.
Собаки и кошки — плотоядные животные, которым необходим мясной белок для поддержания оптимального здоровья. Сырое мясо, внутренние органы и кости с органическими фруктами, овощами и пищевыми витаминами обеспечивают богатую питательными веществами диету. Сырое мясо содержит живые ферменты, которые создают идеальную среду для полного переваривания и усвоения питательных веществ. Хотите узнать, как перейти на сыроедение, или вам нужна помощь в выборе идеального протеина для вашего мехового малыша? Воспользуйтесь нашими рекомендациями по переходу и инфографикой по поиску первичного белка, чтобы помочь вам.
2. Включите в их рацион пробиотики для создания полезных бактерий.
Пополните их кишечную флору изнутри! Добавляйте в пищу пробиотики, которые создают микрофлору и уравновешивают микробиом. Наше сырое козье молоко содержит витамины, минералы, электролиты, микроэлементы, ферменты, белок и жирные кислоты, которые легко усваиваются их пищеварительной системой. Пробиотики добавляются в молоко для повышения иммунной устойчивости к вредным бактериям, борьбы с кишечными инфекциями и обеспечения нутритивной поддержки в случае диарейных заболеваний.Чтобы эти полезные пробиотики оставались здоровыми и процветали в желудочно-кишечном тракте вашего питомца, попробуйте наш съедобный эликсир для поддержки пищеварения Winter Squash Puree, который содержит растворимые волокна для питания и поддержки здорового микробиома. Любые добавки к рациону вашего питомца следует постепенно вводить и контролировать. Поскольку наши меховые младенцы не могут напрямую сказать нам, как они себя чувствуют, обязательно внимательно наблюдайте за их поведением, чтобы получить подсказки.
3. Добавляйте в еду костный бульон, чтобы улучшить усвоение питательных веществ.
Bone Broth обеспечивает выработку коллагена через легкоусвояемый жидкий желатин.Коллаген содержит антиоксиданты, в основном глутатион, который помогает вывести токсины из печени и восстановить слизистую оболочку кишечника. Добавление костного бульона в пищу вашего питомца увеличивает усвоение питательных веществ и создает идеальную среду для процветания кишечной флоры. Primal Broth богат гликозаминогликанами, потому что его получают путем медленного кипячения целых костей, включая хрящи и суставы. Он также богат аминокислотами, включая глицин, который известен своими антивозрастными свойствами. Дополнительный бонус: костный бульон помогает вашему питомцу удовлетворять ежедневную потребность во влаге!
4.Ежедневно занимайтесь спортом и играйте, чтобы снизить стресс.
Повысьте физическое и психическое здоровье вашего питомца с помощью физических упражнений и игр. Когда дело доходит до рекомендуемого уровня физических упражнений, все кошка и собака индивидуальны, и их потребности будут меняться на протяжении всей жизни. Итак, найдите подходящий уровень для этапа жизни вашего мехового малыша. Снижение стресса с помощью упражнений не только позволит им развлечься и будет в хорошей форме, но и снизит выработку кортизола в организме. Этот гормон может ослабить иммунную систему и вызвать воспаление.Хотя кошек труднее тренировать, тренировка с поводком позволяет вам вместе исследовать природу. Предложение игрушек и других животных для общения также может помочь как кошачьим, так и фидо оставаться в форме и чувствовать себя фантастически.
Предоставьте своему меховому малышу вкусные блюда, повышающие иммунитет, которые ему понравятся. Найдите ближайший к вам магазин и начните восстанавливать здоровье их кишечника уже сегодня!
Источник: https://www.nomnomnow.com/learn/pet-microbiome/microbiome-pet-health
.